Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SKAP1Q86WV1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SKAP1Q86WV1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SKAP1Q86WV1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SKAP1Q86WV1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SKAP1Q86WV1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
SKAP1Q86WV1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SKAP1Q86WV1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SKAP1Q86WV1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SKAP1Q86WV1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SKAP1Q86WV1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SKAP1Q86WV1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SKAP1Q86WV1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SKAP1Q86WV1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
SKAP1Q86WV1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
SKAP1Q86WV1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
SKAP1Q86WV1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SKAP1Q86WV1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SKAP1Q86WV1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
SKAP1Q86WV1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SKAP1Q86WV1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SKAP1Q86WV1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SKAP1Q86WV1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SKAP1Q86WV1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SKAP1Q86WV1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SKAP1Q86WV1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SKAP1Q86WV1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SKAP1Q86WV1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SKAP1Q86WV1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SKAP1Q86WV1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SKAP1Q86WV1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
SKAP1Q86WV1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SKAP1Q86WV1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SKAP1Q86WV1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SKAP1Q86WV1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SKAP1Q86WV1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SKAP1Q86WV1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SKAP1Q86WV1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SKAP1Q86WV1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SKAP1Q86WV1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
SKAP1Q86WV1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SKAP1Q86WV1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SKAP1Q86WV1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SKAP1Q86WV1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SKAP1Q86WV1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SKAP1Q86WV1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SKAP1Q86WV1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SKAP1Q86WV1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SKAP1Q86WV1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SKAP1Q86WV1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SKAP1Q86WV1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
SKAP1Q86WV1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SKAP1Q86WV1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SKAP1Q86WV1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SKAP1Q86WV1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SKAP1Q86WV1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC31.32■■■□□ 2.61
SKAP1Q86WV1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SKAP1Q86WV1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SKAP1Q86WV1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SKAP1Q86WV1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SKAP1Q86WV1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SKAP1Q86WV1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SKAP1Q86WV1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SKAP1Q86WV1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SKAP1Q86WV1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SKAP1Q86WV1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SKAP1Q86WV1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SKAP1Q86WV1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SKAP1Q86WV1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SKAP1Q86WV1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SKAP1Q86WV1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SKAP1Q86WV1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SKAP1Q86WV1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SKAP1Q86WV1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SKAP1Q86WV1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SKAP1Q86WV1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
SKAP1Q86WV1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SKAP1Q86WV1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SKAP1Q86WV1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
SKAP1Q86WV1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
SKAP1Q86WV1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
SKAP1Q86WV1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SKAP1Q86WV1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SKAP1Q86WV1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SKAP1Q86WV1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SKAP1Q86WV1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SKAP1Q86WV1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SKAP1Q86WV1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SKAP1Q86WV1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
SKAP1Q86WV1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SKAP1Q86WV1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SKAP1Q86WV1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SKAP1Q86WV1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SKAP1Q86WV1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SKAP1Q86WV1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SKAP1Q86WV1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SKAP1Q86WV1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
SKAP1Q86WV1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SKAP1Q86WV1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SKAP1Q86WV1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms