Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC41.83■■■■■ 4.29
SKAP1Q86WV1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
SKAP1Q86WV1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC41.57■■■■■ 4.24
SKAP1Q86WV1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC41.51■■■■■ 4.24
SKAP1Q86WV1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC41.1■■■■■ 4.17
SKAP1Q86WV1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
SKAP1Q86WV1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC40.79■■■■■ 4.12
SKAP1Q86WV1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
SKAP1Q86WV1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
SKAP1Q86WV1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC40.24■■■■■ 4.03
SKAP1Q86WV1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
SKAP1Q86WV1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
SKAP1Q86WV1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
SKAP1Q86WV1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
SKAP1Q86WV1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
SKAP1Q86WV1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC39.83■■■■□ 3.97
SKAP1Q86WV1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
SKAP1Q86WV1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
SKAP1Q86WV1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
SKAP1Q86WV1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
SKAP1Q86WV1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
SKAP1Q86WV1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
SKAP1Q86WV1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
SKAP1Q86WV1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
SKAP1Q86WV1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
SKAP1Q86WV1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
SKAP1Q86WV1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.59■■■■□ 3.77
SKAP1Q86WV1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
SKAP1Q86WV1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
SKAP1Q86WV1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
SKAP1Q86WV1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
SKAP1Q86WV1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
SKAP1Q86WV1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
SKAP1Q86WV1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
SKAP1Q86WV1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
SKAP1Q86WV1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
SKAP1Q86WV1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
SKAP1Q86WV1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
SKAP1Q86WV1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
SKAP1Q86WV1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
SKAP1Q86WV1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
SKAP1Q86WV1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
SKAP1Q86WV1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
SKAP1Q86WV1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
SKAP1Q86WV1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
SKAP1Q86WV1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
SKAP1Q86WV1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
SKAP1Q86WV1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
SKAP1Q86WV1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
SKAP1Q86WV1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
SKAP1Q86WV1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
SKAP1Q86WV1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
SKAP1Q86WV1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
SKAP1Q86WV1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
SKAP1Q86WV1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
SKAP1Q86WV1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
SKAP1Q86WV1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
SKAP1Q86WV1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
SKAP1Q86WV1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
SKAP1Q86WV1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
SKAP1Q86WV1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
SKAP1Q86WV1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
SKAP1Q86WV1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
SKAP1Q86WV1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
SKAP1Q86WV1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
SKAP1Q86WV1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
SKAP1Q86WV1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
SKAP1Q86WV1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
SKAP1Q86WV1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SKAP1Q86WV1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
SKAP1Q86WV1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SKAP1Q86WV1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
SKAP1Q86WV1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
SKAP1Q86WV1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SKAP1Q86WV1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
SKAP1Q86WV1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SKAP1Q86WV1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
SKAP1Q86WV1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
SKAP1Q86WV1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
SKAP1Q86WV1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SKAP1Q86WV1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SKAP1Q86WV1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
SKAP1Q86WV1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
SKAP1Q86WV1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
SKAP1Q86WV1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
SKAP1Q86WV1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SKAP1Q86WV1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SKAP1Q86WV1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SKAP1Q86WV1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SKAP1Q86WV1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SKAP1Q86WV1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SKAP1Q86WV1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SKAP1Q86WV1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SKAP1Q86WV1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SKAP1Q86WV1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SKAP1Q86WV1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SKAP1Q86WV1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SKAP1Q86WV1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SKAP1Q86WV1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SKAP1Q86WV1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms