RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397620.6

MEIS2-204, Transcript of Meis homeobox 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene MEIS2, Length 2,295 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS2-204ENST00000397620 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.95■■■■■ 5.91
MEIS2-204ENST00000397620 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.68■■■■■ 4.74
MEIS2-204ENST00000397620 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.83■■■■■ 4.61
MEIS2-204ENST00000397620 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.48■■■■■ 4.55
MEIS2-204ENST00000397620 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.89■■■■■ 4.46
MEIS2-204ENST00000397620 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.74■■■■■ 4.43
MEIS2-204ENST00000397620 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.26■■■■■ 4.36
MEIS2-204ENST00000397620 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.79■■■■■ 4.28
MEIS2-204ENST00000397620 ABCC9O60706 1549 aa41.69■■■■■ 4.26
MEIS2-204ENST00000397620 SCRIBQ14160 1630 aa41.55■■■■■ 4.24
MEIS2-204ENST00000397620 NACADO15069 1562 aa41.38■■■■■ 4.21
MEIS2-204ENST00000397620 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.87■■■■■ 4.13
MEIS2-204ENST00000397620 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.83■■■■■ 4.13
MEIS2-204ENST00000397620 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.76■■■■■ 4.12
MEIS2-204ENST00000397620 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.48■■■■■ 4.07
MEIS2-204ENST00000397620 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.31■■■■■ 4.04
MEIS2-204ENST00000397620 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.31■■■■■ 4.04
MEIS2-204ENST00000397620 WIZO95785 1651 aa40.09■■■■■ 4.01
MEIS2-204ENST00000397620 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.97■■■■□ 3.99
MEIS2-204ENST00000397620 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.76■■■■□ 3.96
MEIS2-204ENST00000397620 SMARCA4P51532 1647 aa39.76■■■■□ 3.95
MEIS2-204ENST00000397620 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.62■■■■□ 3.93
MEIS2-204ENST00000397620 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.53■■■■□ 3.92
MEIS2-204ENST00000397620 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.5■■■■□ 3.91
MEIS2-204ENST00000397620 TRIM41Q8WV44 630 aa39.49■■■■□ 3.91
MEIS2-204ENST00000397620 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.35■■■■□ 3.89
MEIS2-204ENST00000397620 SMARCA2P51531 1590 aa39.24■■■■□ 3.87
MEIS2-204ENST00000397620 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.22■■■■□ 3.87
MEIS2-204ENST00000397620 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.09■■■■□ 3.85
MEIS2-204ENST00000397620 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.04■■■■□ 3.84
MEIS2-204ENST00000397620 ABCC8Q09428 1581 aa38.87■■■■□ 3.81
MEIS2-204ENST00000397620 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.84■■■■□ 3.81
MEIS2-204ENST00000397620 PCGF6Q9BYE7 350 aa38.74■■■■□ 3.79
MEIS2-204ENST00000397620 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.67■■■■□ 3.78
MEIS2-204ENST00000397620 EHMT2Q96KQ7 1210 aa38.64■■■■□ 3.78
MEIS2-204ENST00000397620 HRCP23327 699 aa38.32■■■■□ 3.73
MEIS2-204ENST00000397620 SOGA1O94964 1423 aa38.31■■■■□ 3.72
MEIS2-204ENST00000397620 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.3■■■■□ 3.72
MEIS2-204ENST00000397620 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP38.27■■■■□ 3.72
MEIS2-204ENST00000397620 HMGXB3Q12766 1538 aa38.24■■■■□ 3.71
MEIS2-204ENST00000397620 NCAPD3P42695 1498 aa38.23■■■■□ 3.71
MEIS2-204ENST00000397620 SYNJ1O43426 1573 aa38.21■■■■□ 3.71
MEIS2-204ENST00000397620 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.17■■■■□ 3.7
MEIS2-204ENST00000397620 EEA1Q15075 1411 aa38.09■■■■□ 3.69
MEIS2-204ENST00000397620 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.99■■■■□ 3.67
MEIS2-204ENST00000397620 TOP2BQ02880 1626 aa37.84■■■■□ 3.65
MEIS2-204ENST00000397620 TNIKQ9UKE5 1360 aa37.83■■■■□ 3.65
MEIS2-204ENST00000397620 CEP162Q5TB80 1403 aa37.82■■■■□ 3.64
MEIS2-204ENST00000397620 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.78■■■■□ 3.64
MEIS2-204ENST00000397620 GOLGA3Q08378 1498 aa37.77■■■■□ 3.64
MEIS2-204ENST00000397620 CFTRP13569 1480 aa37.72■■■■□ 3.63
MEIS2-204ENST00000397620 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP37.71■■■■□ 3.63
MEIS2-204ENST00000397620 UBTFP17480 764 aaKnown RBP37.69■■■■□ 3.62
MEIS2-204ENST00000397620 KIF21BO75037 1637 aa37.68■■■■□ 3.62
MEIS2-204ENST00000397620 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.67■■■■□ 3.62
MEIS2-204ENST00000397620 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.64■■■■□ 3.62
MEIS2-204ENST00000397620 CUX1P39880 1505 aa37.6■■■■□ 3.61
MEIS2-204ENST00000397620 PRDM2Q13029 1718 aa37.59■■■■□ 3.61
MEIS2-204ENST00000397620 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.45■■■■□ 3.59
MEIS2-204ENST00000397620 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.38■■■■□ 3.57
MEIS2-204ENST00000397620 CLIP1P30622 1438 aa37.26■■■■□ 3.55
MEIS2-204ENST00000397620 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP37.23■■■■□ 3.55
MEIS2-204ENST00000397620 PRXQ9BXM0 1461 aa37.22■■■■□ 3.55
MEIS2-204ENST00000397620 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.19■■■■□ 3.54
MEIS2-204ENST00000397620 KIF27Q86VH2 1401 aa37.18■■■■□ 3.54
MEIS2-204ENST00000397620 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP37.1■■■■□ 3.53
MEIS2-204ENST00000397620 VPS8Q8N3P4 1428 aa37.04■■■■□ 3.52
MEIS2-204ENST00000397620 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.04■■■■□ 3.52
MEIS2-204ENST00000397620 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP37.03■■■■□ 3.52
MEIS2-204ENST00000397620 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.01■■■■□ 3.52
MEIS2-204ENST00000397620 NESP48681 1621 aa36.97■■■■□ 3.51
MEIS2-204ENST00000397620 CUX2O14529 1486 aa36.97■■■■□ 3.51
MEIS2-204ENST00000397620 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP36.83■■■■□ 3.49
MEIS2-204ENST00000397620 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.83■■■■□ 3.49
MEIS2-204ENST00000397620 IGF1RP08069 1367 aa36.82■■■■□ 3.49
MEIS2-204ENST00000397620 ARAP1Q96P48 1450 aa36.82■■■■□ 3.48
MEIS2-204ENST00000397620 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.76■■■■□ 3.47
MEIS2-204ENST00000397620 TOPBP1Q92547 1522 aa36.75■■■■□ 3.47
MEIS2-204ENST00000397620 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.72■■■■□ 3.47
MEIS2-204ENST00000397620 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.68■■■■□ 3.46
MEIS2-204ENST00000397620 APLP2Q06481 763 aa36.68■■■■□ 3.46
MEIS2-204ENST00000397620 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP36.68■■■■□ 3.46
MEIS2-204ENST00000397620 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.67■■■■□ 3.46
MEIS2-204ENST00000397620 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.65■■■■□ 3.46
MEIS2-204ENST00000397620 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.61■■■■□ 3.45
MEIS2-204ENST00000397620 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.6■■■■□ 3.45
MEIS2-204ENST00000397620 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.57■■■■□ 3.45
MEIS2-204ENST00000397620 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.47■■■■□ 3.43
MEIS2-204ENST00000397620 WDR97A6NE52 1622 aa36.45■■■■□ 3.43
MEIS2-204ENST00000397620 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.45■■■■□ 3.42
MEIS2-204ENST00000397620 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP36.4■■■■□ 3.42
MEIS2-204ENST00000397620 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP36.38■■■■□ 3.41
MEIS2-204ENST00000397620 CUL7Q14999 1698 aa36.35■■■■□ 3.41
MEIS2-204ENST00000397620 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.27■■■■□ 3.4
MEIS2-204ENST00000397620 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.21■■■■□ 3.39
MEIS2-204ENST00000397620 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.19■■■■□ 3.38
MEIS2-204ENST00000397620 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.14■■■■□ 3.38
MEIS2-204ENST00000397620 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.12■■■■□ 3.37
MEIS2-204ENST00000397620 TIAM1Q13009 1591 aa36.12■■■■□ 3.37
MEIS2-204ENST00000397620 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.5 ms