Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC39A12Q504Y0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC39A12Q504Y0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC39A12Q504Y0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC39A12Q504Y0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC39A12Q504Y0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC39A12Q504Y0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC39A12Q504Y0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC39A12Q504Y0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC39A12Q504Y0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC39A12Q504Y0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC39A12Q504Y0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC39A12Q504Y0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC39A12Q504Y0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC39A12Q504Y0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC39A12Q504Y0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC39A12Q504Y0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC39A12Q504Y0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC39A12Q504Y0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC39A12Q504Y0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC39A12Q504Y0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC39A12Q504Y0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC39A12Q504Y0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC39A12Q504Y0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC39A12Q504Y0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC39A12Q504Y0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC39A12Q504Y0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC39A12Q504Y0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC39A12Q504Y0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC39A12Q504Y0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC39A12Q504Y0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLC39A12Q504Y0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLC39A12Q504Y0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLC39A12Q504Y0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
SLC39A12Q504Y0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC39A12Q504Y0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC39A12Q504Y0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC39A12Q504Y0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC39A12Q504Y0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC39A12Q504Y0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC39A12Q504Y0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC39A12Q504Y0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC39A12Q504Y0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC39A12Q504Y0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC39A12Q504Y0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC39A12Q504Y0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC39A12Q504Y0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC39A12Q504Y0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC39A12Q504Y0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC39A12Q504Y0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC39A12Q504Y0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC39A12Q504Y0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC39A12Q504Y0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC39A12Q504Y0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC39A12Q504Y0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC39A12Q504Y0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC39A12Q504Y0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC39A12Q504Y0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC39A12Q504Y0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC39A12Q504Y0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC39A12Q504Y0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC39A12Q504Y0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC39A12Q504Y0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC39A12Q504Y0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC39A12Q504Y0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC39A12Q504Y0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC39A12Q504Y0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC39A12Q504Y0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC39A12Q504Y0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC39A12Q504Y0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLC39A12Q504Y0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC39A12Q504Y0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC39A12Q504Y0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC39A12Q504Y0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC39A12Q504Y0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC39A12Q504Y0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC39A12Q504Y0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC39A12Q504Y0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC39A12Q504Y0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC39A12Q504Y0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC39A12Q504Y0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC39A12Q504Y0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC39A12Q504Y0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC39A12Q504Y0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC39A12Q504Y0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC39A12Q504Y0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC39A12Q504Y0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC39A12Q504Y0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC39A12Q504Y0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC39A12Q504Y0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC39A12Q504Y0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC39A12Q504Y0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC39A12Q504Y0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC39A12Q504Y0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC39A12Q504Y0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC39A12Q504Y0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC39A12Q504Y0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC39A12Q504Y0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC39A12Q504Y0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC39A12Q504Y0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms