Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDO1Q16878 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDO1Q16878 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDO1Q16878 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDO1Q16878 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDO1Q16878 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDO1Q16878 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDO1Q16878 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDO1Q16878 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDO1Q16878 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CDO1Q16878 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CDO1Q16878 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDO1Q16878 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDO1Q16878 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDO1Q16878 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDO1Q16878 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDO1Q16878 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDO1Q16878 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CDO1Q16878 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDO1Q16878 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDO1Q16878 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDO1Q16878 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDO1Q16878 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDO1Q16878 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDO1Q16878 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDO1Q16878 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDO1Q16878 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CDO1Q16878 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDO1Q16878 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDO1Q16878 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDO1Q16878 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDO1Q16878 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDO1Q16878 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDO1Q16878 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDO1Q16878 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDO1Q16878 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDO1Q16878 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CDO1Q16878 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDO1Q16878 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDO1Q16878 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDO1Q16878 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDO1Q16878 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDO1Q16878 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDO1Q16878 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDO1Q16878 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDO1Q16878 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDO1Q16878 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDO1Q16878 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDO1Q16878 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDO1Q16878 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDO1Q16878 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDO1Q16878 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDO1Q16878 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDO1Q16878 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CDO1Q16878 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CDO1Q16878 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDO1Q16878 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDO1Q16878 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDO1Q16878 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDO1Q16878 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDO1Q16878 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDO1Q16878 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDO1Q16878 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDO1Q16878 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDO1Q16878 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDO1Q16878 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDO1Q16878 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CDO1Q16878 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDO1Q16878 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDO1Q16878 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDO1Q16878 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDO1Q16878 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDO1Q16878 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDO1Q16878 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDO1Q16878 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDO1Q16878 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDO1Q16878 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDO1Q16878 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDO1Q16878 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CDO1Q16878 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDO1Q16878 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDO1Q16878 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDO1Q16878 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDO1Q16878 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDO1Q16878 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDO1Q16878 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDO1Q16878 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDO1Q16878 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDO1Q16878 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDO1Q16878 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDO1Q16878 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDO1Q16878 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDO1Q16878 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDO1Q16878 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDO1Q16878 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDO1Q16878 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDO1Q16878 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDO1Q16878 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDO1Q16878 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDO1Q16878 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
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