Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

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Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC41.78■■■■■ 4.28
EEA1Q15075 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
EEA1Q15075 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
EEA1Q15075 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
EEA1Q15075 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
EEA1Q15075 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC41.75■■■■■ 4.27
EEA1Q15075 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC41.75■■■■■ 4.27
EEA1Q15075 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
EEA1Q15075 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC41.75■■■■■ 4.27
EEA1Q15075 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
EEA1Q15075 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
EEA1Q15075 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC41.74■■■■■ 4.27
EEA1Q15075 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
EEA1Q15075 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC41.73■■■■■ 4.27
EEA1Q15075 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC41.72■■■■■ 4.27
EEA1Q15075 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
EEA1Q15075 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
EEA1Q15075 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
EEA1Q15075 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC41.71■■■■■ 4.27
EEA1Q15075 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC41.7■■■■■ 4.27
EEA1Q15075 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC41.69■■■■■ 4.26
EEA1Q15075 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC41.68■■■■■ 4.26
EEA1Q15075 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC41.68■■■■■ 4.26
EEA1Q15075 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.67■■■■■ 4.26
EEA1Q15075 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
EEA1Q15075 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC41.67■■■■■ 4.26
EEA1Q15075 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
EEA1Q15075 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC41.66■■■■■ 4.26
EEA1Q15075 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
EEA1Q15075 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.65■■■■■ 4.26
EEA1Q15075 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
EEA1Q15075 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC41.65■■■■■ 4.26
EEA1Q15075 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
EEA1Q15075 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
EEA1Q15075 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC41.62■■■■■ 4.25
EEA1Q15075 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.62■■■■■ 4.25
EEA1Q15075 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
EEA1Q15075 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC41.61■■■■■ 4.25
EEA1Q15075 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
EEA1Q15075 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC41.61■■■■■ 4.25
EEA1Q15075 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC41.6■■■■■ 4.25
EEA1Q15075 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
EEA1Q15075 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
EEA1Q15075 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
EEA1Q15075 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
EEA1Q15075 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
EEA1Q15075 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
EEA1Q15075 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
EEA1Q15075 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
EEA1Q15075 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.57■■■■■ 4.25
EEA1Q15075 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
EEA1Q15075 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
EEA1Q15075 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
EEA1Q15075 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC41.56■■■■■ 4.24
EEA1Q15075 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
EEA1Q15075 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
EEA1Q15075 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.55■■■■■ 4.24
EEA1Q15075 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC41.55■■■■■ 4.24
EEA1Q15075 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
EEA1Q15075 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
EEA1Q15075 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC41.55■■■■■ 4.24
EEA1Q15075 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
EEA1Q15075 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC41.54■■■■■ 4.24
EEA1Q15075 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
EEA1Q15075 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC41.53■■■■■ 4.24
EEA1Q15075 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
EEA1Q15075 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
EEA1Q15075 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
EEA1Q15075 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
EEA1Q15075 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
EEA1Q15075 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC41.51■■■■■ 4.24
EEA1Q15075 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.5■■■■■ 4.23
EEA1Q15075 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
EEA1Q15075 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
EEA1Q15075 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
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EEA1Q15075 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
EEA1Q15075 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
EEA1Q15075 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
EEA1Q15075 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
EEA1Q15075 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
EEA1Q15075 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
EEA1Q15075 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
EEA1Q15075 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
EEA1Q15075 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC41.45■■■■■ 4.23
EEA1Q15075 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
EEA1Q15075 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC41.44■■■■■ 4.23
EEA1Q15075 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
EEA1Q15075 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
EEA1Q15075 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
EEA1Q15075 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC41.41■■■■■ 4.22
EEA1Q15075 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
EEA1Q15075 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC41.41■■■■■ 4.22
EEA1Q15075 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
EEA1Q15075 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
EEA1Q15075 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
EEA1Q15075 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
EEA1Q15075 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
EEA1Q15075 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
EEA1Q15075 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC41.38■■■■■ 4.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.3 ms