Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
BMP3P12645 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
BMP3P12645 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
BMP3P12645 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
BMP3P12645 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
BMP3P12645 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BMP3P12645 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
BMP3P12645 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
BMP3P12645 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
BMP3P12645 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
BMP3P12645 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
BMP3P12645 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
BMP3P12645 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
BMP3P12645 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
BMP3P12645 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
BMP3P12645 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
BMP3P12645 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
BMP3P12645 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
BMP3P12645 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
BMP3P12645 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
BMP3P12645 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
BMP3P12645 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
BMP3P12645 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BMP3P12645 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
BMP3P12645 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BMP3P12645 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
BMP3P12645 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
BMP3P12645 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
BMP3P12645 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
BMP3P12645 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
BMP3P12645 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
BMP3P12645 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
BMP3P12645 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
BMP3P12645 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
BMP3P12645 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
BMP3P12645 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BMP3P12645 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
BMP3P12645 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
BMP3P12645 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
BMP3P12645 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
BMP3P12645 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
BMP3P12645 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BMP3P12645 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BMP3P12645 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BMP3P12645 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BMP3P12645 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BMP3P12645 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BMP3P12645 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BMP3P12645 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BMP3P12645 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BMP3P12645 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BMP3P12645 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BMP3P12645 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
BMP3P12645 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BMP3P12645 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
BMP3P12645 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BMP3P12645 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
BMP3P12645 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BMP3P12645 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
BMP3P12645 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BMP3P12645 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BMP3P12645 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BMP3P12645 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BMP3P12645 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BMP3P12645 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BMP3P12645 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BMP3P12645 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BMP3P12645 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BMP3P12645 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BMP3P12645 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BMP3P12645 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BMP3P12645 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BMP3P12645 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BMP3P12645 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
BMP3P12645 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
BMP3P12645 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BMP3P12645 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BMP3P12645 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BMP3P12645 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BMP3P12645 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BMP3P12645 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BMP3P12645 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BMP3P12645 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
BMP3P12645 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
BMP3P12645 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BMP3P12645 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BMP3P12645 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BMP3P12645 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BMP3P12645 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
BMP3P12645 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BMP3P12645 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BMP3P12645 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BMP3P12645 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BMP3P12645 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BMP3P12645 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
BMP3P12645 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BMP3P12645 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BMP3P12645 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BMP3P12645 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BMP3P12645 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms