Protein–RNA interactions for Protein: P11940

PABPC1, Polyadenylate-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1P11940 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PABPC1P11940 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PABPC1P11940 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PABPC1P11940 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PABPC1P11940 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PABPC1P11940 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PABPC1P11940 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PABPC1P11940 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PABPC1P11940 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PABPC1P11940 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PABPC1P11940 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PABPC1P11940 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PABPC1P11940 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PABPC1P11940 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PABPC1P11940 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PABPC1P11940 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PABPC1P11940 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PABPC1P11940 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PABPC1P11940 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PABPC1P11940 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PABPC1P11940 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PABPC1P11940 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PABPC1P11940 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PABPC1P11940 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PABPC1P11940 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PABPC1P11940 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PABPC1P11940 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PABPC1P11940 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PABPC1P11940 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PABPC1P11940 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PABPC1P11940 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PABPC1P11940 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PABPC1P11940 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PABPC1P11940 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PABPC1P11940 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PABPC1P11940 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PABPC1P11940 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PABPC1P11940 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PABPC1P11940 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PABPC1P11940 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PABPC1P11940 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PABPC1P11940 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PABPC1P11940 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PABPC1P11940 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PABPC1P11940 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PABPC1P11940 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PABPC1P11940 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PABPC1P11940 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PABPC1P11940 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PABPC1P11940 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PABPC1P11940 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PABPC1P11940 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PABPC1P11940 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PABPC1P11940 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PABPC1P11940 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PABPC1P11940 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PABPC1P11940 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PABPC1P11940 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PABPC1P11940 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PABPC1P11940 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PABPC1P11940 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PABPC1P11940 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PABPC1P11940 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PABPC1P11940 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PABPC1P11940 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PABPC1P11940 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PABPC1P11940 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PABPC1P11940 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PABPC1P11940 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PABPC1P11940 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PABPC1P11940 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PABPC1P11940 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PABPC1P11940 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PABPC1P11940 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PABPC1P11940 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PABPC1P11940 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PABPC1P11940 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PABPC1P11940 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PABPC1P11940 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PABPC1P11940 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PABPC1P11940 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PABPC1P11940 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PABPC1P11940 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PABPC1P11940 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PABPC1P11940 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PABPC1P11940 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PABPC1P11940 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PABPC1P11940 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PABPC1P11940 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PABPC1P11940 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PABPC1P11940 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PABPC1P11940 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PABPC1P11940 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PABPC1P11940 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PABPC1P11940 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PABPC1P11940 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PABPC1P11940 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PABPC1P11940 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PABPC1P11940 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PABPC1P11940 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.7 ms