Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ54

PMF1-BGLAP, HCG2044777, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PMF1-BGLAPU3KQ54 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PMF1-BGLAPU3KQ54 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PMF1-BGLAPU3KQ54 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PMF1-BGLAPU3KQ54 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PMF1-BGLAPU3KQ54 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PMF1-BGLAPU3KQ54 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PMF1-BGLAPU3KQ54 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PMF1-BGLAPU3KQ54 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PMF1-BGLAPU3KQ54 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PMF1-BGLAPU3KQ54 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PMF1-BGLAPU3KQ54 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PMF1-BGLAPU3KQ54 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PMF1-BGLAPU3KQ54 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PMF1-BGLAPU3KQ54 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PMF1-BGLAPU3KQ54 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PMF1-BGLAPU3KQ54 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PMF1-BGLAPU3KQ54 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PMF1-BGLAPU3KQ54 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PMF1-BGLAPU3KQ54 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PMF1-BGLAPU3KQ54 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PMF1-BGLAPU3KQ54 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PMF1-BGLAPU3KQ54 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PMF1-BGLAPU3KQ54 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PMF1-BGLAPU3KQ54 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PMF1-BGLAPU3KQ54 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PMF1-BGLAPU3KQ54 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PMF1-BGLAPU3KQ54 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PMF1-BGLAPU3KQ54 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PMF1-BGLAPU3KQ54 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PMF1-BGLAPU3KQ54 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PMF1-BGLAPU3KQ54 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PMF1-BGLAPU3KQ54 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PMF1-BGLAPU3KQ54 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PMF1-BGLAPU3KQ54 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PMF1-BGLAPU3KQ54 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PMF1-BGLAPU3KQ54 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PMF1-BGLAPU3KQ54 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PMF1-BGLAPU3KQ54 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PMF1-BGLAPU3KQ54 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PMF1-BGLAPU3KQ54 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PMF1-BGLAPU3KQ54 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PMF1-BGLAPU3KQ54 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PMF1-BGLAPU3KQ54 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PMF1-BGLAPU3KQ54 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PMF1-BGLAPU3KQ54 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PMF1-BGLAPU3KQ54 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PMF1-BGLAPU3KQ54 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PMF1-BGLAPU3KQ54 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PMF1-BGLAPU3KQ54 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PMF1-BGLAPU3KQ54 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms