Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC41.14■■■■■ 4.18
PALD1Q9ULE6 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
PALD1Q9ULE6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC40.07■■■■■ 4.01
PALD1Q9ULE6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
PALD1Q9ULE6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
PALD1Q9ULE6 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.77■■■■□ 3.96
PALD1Q9ULE6 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC39.69■■■■□ 3.94
PALD1Q9ULE6 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
PALD1Q9ULE6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.42■■■■□ 3.9
PALD1Q9ULE6 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
PALD1Q9ULE6 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
PALD1Q9ULE6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC38.81■■■■□ 3.8
PALD1Q9ULE6 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.78
PALD1Q9ULE6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
PALD1Q9ULE6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
PALD1Q9ULE6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
PALD1Q9ULE6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
PALD1Q9ULE6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
PALD1Q9ULE6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC38.23■■■■□ 3.71
PALD1Q9ULE6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
PALD1Q9ULE6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
PALD1Q9ULE6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
PALD1Q9ULE6 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
PALD1Q9ULE6 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
PALD1Q9ULE6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
PALD1Q9ULE6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
PALD1Q9ULE6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
PALD1Q9ULE6 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
PALD1Q9ULE6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
PALD1Q9ULE6 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
PALD1Q9ULE6 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
PALD1Q9ULE6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
PALD1Q9ULE6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
PALD1Q9ULE6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC37.22■■■■□ 3.55
PALD1Q9ULE6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
PALD1Q9ULE6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
PALD1Q9ULE6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
PALD1Q9ULE6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
PALD1Q9ULE6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
PALD1Q9ULE6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
PALD1Q9ULE6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
PALD1Q9ULE6 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
PALD1Q9ULE6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
PALD1Q9ULE6 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PALD1Q9ULE6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PALD1Q9ULE6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PALD1Q9ULE6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PALD1Q9ULE6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PALD1Q9ULE6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PALD1Q9ULE6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PALD1Q9ULE6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PALD1Q9ULE6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PALD1Q9ULE6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
PALD1Q9ULE6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PALD1Q9ULE6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PALD1Q9ULE6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PALD1Q9ULE6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PALD1Q9ULE6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PALD1Q9ULE6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
PALD1Q9ULE6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
PALD1Q9ULE6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
PALD1Q9ULE6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PALD1Q9ULE6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
PALD1Q9ULE6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
PALD1Q9ULE6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PALD1Q9ULE6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
PALD1Q9ULE6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
PALD1Q9ULE6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
PALD1Q9ULE6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PALD1Q9ULE6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PALD1Q9ULE6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
PALD1Q9ULE6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
PALD1Q9ULE6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
PALD1Q9ULE6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PALD1Q9ULE6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
PALD1Q9ULE6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
PALD1Q9ULE6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
PALD1Q9ULE6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
PALD1Q9ULE6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
PALD1Q9ULE6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PALD1Q9ULE6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PALD1Q9ULE6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PALD1Q9ULE6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PALD1Q9ULE6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PALD1Q9ULE6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PALD1Q9ULE6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PALD1Q9ULE6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PALD1Q9ULE6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PALD1Q9ULE6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
PALD1Q9ULE6 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PALD1Q9ULE6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PALD1Q9ULE6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PALD1Q9ULE6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PALD1Q9ULE6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PALD1Q9ULE6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
PALD1Q9ULE6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
PALD1Q9ULE6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PALD1Q9ULE6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PALD1Q9ULE6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PALD1Q9ULE6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms