Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2P5

HECW2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, humanhuman

Predictions only

Length 1,572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW2Q9P2P5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC52.61■■■■■ 6.01
HECW2Q9P2P5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC52.55■■■■■ 6
HECW2Q9P2P5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC51.89■■■■■ 5.9
HECW2Q9P2P5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.43■■■■■ 5.82
HECW2Q9P2P5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.92■■■■■ 5.74
HECW2Q9P2P5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.82■■■■■ 5.73
HECW2Q9P2P5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.73■■■■■ 5.71
HECW2Q9P2P5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.47■■■■■ 5.67
HECW2Q9P2P5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC50.45■■■■■ 5.67
HECW2Q9P2P5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.2■■■■■ 5.63
HECW2Q9P2P5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC50.17■■■■■ 5.62
HECW2Q9P2P5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.05■■■■■ 5.6
HECW2Q9P2P5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.04■■■■■ 5.6
HECW2Q9P2P5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC49.97■■■■■ 5.59
HECW2Q9P2P5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC49.89■■■■■ 5.58
HECW2Q9P2P5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC49.79■■■■■ 5.56
HECW2Q9P2P5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.32■■■■■ 5.49
HECW2Q9P2P5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.2■■■■■ 5.47
HECW2Q9P2P5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.16■■■■■ 5.46
HECW2Q9P2P5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.04■■■■■ 5.44
HECW2Q9P2P5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC48.94■■■■■ 5.42
HECW2Q9P2P5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.65■■■■■ 5.38
HECW2Q9P2P5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC48.65■■■■■ 5.38
HECW2Q9P2P5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC48.51■■■■■ 5.36
HECW2Q9P2P5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC48.47■■■■■ 5.35
HECW2Q9P2P5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.47■■■■■ 5.35
HECW2Q9P2P5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.39■■■■■ 5.34
HECW2Q9P2P5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.29■■■■■ 5.32
HECW2Q9P2P5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.26■■■■■ 5.32
HECW2Q9P2P5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC48.25■■■■■ 5.31
HECW2Q9P2P5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC48.12■■■■■ 5.29
HECW2Q9P2P5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC48.08■■■■■ 5.29
HECW2Q9P2P5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC47.95■■■■■ 5.27
HECW2Q9P2P5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.9■■■■■ 5.26
HECW2Q9P2P5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC47.6■■■■■ 5.21
HECW2Q9P2P5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.59■■■■■ 5.21
HECW2Q9P2P5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC47.56■■■■■ 5.2
HECW2Q9P2P5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC47.49■■■■■ 5.19
HECW2Q9P2P5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC47.42■■■■■ 5.18
HECW2Q9P2P5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC47.4■■■■■ 5.18
HECW2Q9P2P5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC47.37■■■■■ 5.17
HECW2Q9P2P5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.18■■■■■ 5.14
HECW2Q9P2P5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC46.88■■■■■ 5.1
HECW2Q9P2P5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC46.86■■■■■ 5.09
HECW2Q9P2P5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC46.86■■■■■ 5.09
HECW2Q9P2P5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.79■■■■■ 5.08
HECW2Q9P2P5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.77■■■■■ 5.08
HECW2Q9P2P5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC46.77■■■■■ 5.08
HECW2Q9P2P5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC46.76■■■■■ 5.08
HECW2Q9P2P5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC46.74■■■■■ 5.07
HECW2Q9P2P5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC46.67■■■■■ 5.06
HECW2Q9P2P5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC46.64■■■■■ 5.06
HECW2Q9P2P5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC46.62■■■■■ 5.05
HECW2Q9P2P5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC46.61■■■■■ 5.05
HECW2Q9P2P5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.58■■■■■ 5.05
HECW2Q9P2P5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
HECW2Q9P2P5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.46■■■■■ 5.03
HECW2Q9P2P5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC46.44■■■■■ 5.03
HECW2Q9P2P5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC46.43■■■■■ 5.02
HECW2Q9P2P5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
HECW2Q9P2P5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC46.31■■■■■ 5
HECW2Q9P2P5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.3■■■■■ 5
HECW2Q9P2P5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC46.3■■■■■ 5
HECW2Q9P2P5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC46.28■■■■■ 5
HECW2Q9P2P5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC46.17■■■■■ 4.98
HECW2Q9P2P5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.14■■■■■ 4.98
HECW2Q9P2P5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.96
HECW2Q9P2P5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
HECW2Q9P2P5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.01■■■■■ 4.96
HECW2Q9P2P5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
HECW2Q9P2P5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
HECW2Q9P2P5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC45.98■■■■■ 4.95
HECW2Q9P2P5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC45.94■■■■■ 4.94
HECW2Q9P2P5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.94
HECW2Q9P2P5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.85■■■■■ 4.93
HECW2Q9P2P5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
HECW2Q9P2P5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC45.83■■■■■ 4.93
HECW2Q9P2P5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC45.82■■■■■ 4.93
HECW2Q9P2P5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
HECW2Q9P2P5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC45.75■■■■■ 4.91
HECW2Q9P2P5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.71■■■■■ 4.91
HECW2Q9P2P5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
HECW2Q9P2P5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC45.65■■■■■ 4.9
HECW2Q9P2P5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
HECW2Q9P2P5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC45.54■■■■■ 4.88
HECW2Q9P2P5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC45.48■■■■■ 4.87
HECW2Q9P2P5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
HECW2Q9P2P5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
HECW2Q9P2P5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC45.47■■■■■ 4.87
HECW2Q9P2P5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
HECW2Q9P2P5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC45.47■■■■■ 4.87
HECW2Q9P2P5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
HECW2Q9P2P5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC45.42■■■■■ 4.86
HECW2Q9P2P5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC45.41■■■■■ 4.86
HECW2Q9P2P5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
HECW2Q9P2P5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
HECW2Q9P2P5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
HECW2Q9P2P5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC45.33■■■■■ 4.85
HECW2Q9P2P5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
HECW2Q9P2P5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms