Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW3

APOBEC3C, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3C, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3CQ9NRW3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.8■■■■□ 3.48not detected
APOBEC3CQ9NRW3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39not detected
APOBEC3CQ9NRW3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32not detected
APOBEC3CQ9NRW3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29not detected
APOBEC3CQ9NRW3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.299e-16■■■■□ 25.3
APOBEC3CQ9NRW3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28not detected
APOBEC3CQ9NRW3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27not detected
APOBEC3CQ9NRW3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24not detected
APOBEC3CQ9NRW3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14not detected
APOBEC3CQ9NRW3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12not detected
APOBEC3CQ9NRW3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11not detected
APOBEC3CQ9NRW3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1not detected
APOBEC3CQ9NRW3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1not detected
APOBEC3CQ9NRW3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09not detected
APOBEC3CQ9NRW3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07not detected
APOBEC3CQ9NRW3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06not detected
APOBEC3CQ9NRW3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05not detected
APOBEC3CQ9NRW3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04not detected
APOBEC3CQ9NRW3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02not detected
APOBEC3CQ9NRW3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02not detected
APOBEC3CQ9NRW3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99not detected
APOBEC3CQ9NRW3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99not detected
APOBEC3CQ9NRW3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98not detected
APOBEC3CQ9NRW3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96not detected
APOBEC3CQ9NRW3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96not detected
APOBEC3CQ9NRW3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.961e-10■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95not detected
APOBEC3CQ9NRW3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95not detected
APOBEC3CQ9NRW3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94not detected
APOBEC3CQ9NRW3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91not detected
APOBEC3CQ9NRW3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89not detected
APOBEC3CQ9NRW3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.881e-7■■■□□ 17.6
APOBEC3CQ9NRW3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85not detected
APOBEC3CQ9NRW3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85not detected
APOBEC3CQ9NRW3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85not detected
APOBEC3CQ9NRW3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.85not detected
APOBEC3CQ9NRW3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84not detected
APOBEC3CQ9NRW3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84not detected
APOBEC3CQ9NRW3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84not detected
APOBEC3CQ9NRW3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83not detected
APOBEC3CQ9NRW3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83not detected
APOBEC3CQ9NRW3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82not detected
APOBEC3CQ9NRW3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81not detected
APOBEC3CQ9NRW3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81not detected
APOBEC3CQ9NRW3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8not detected
APOBEC3CQ9NRW3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79not detected
APOBEC3CQ9NRW3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79not detected
APOBEC3CQ9NRW3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76not detected
APOBEC3CQ9NRW3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75not detected
APOBEC3CQ9NRW3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75not detected
APOBEC3CQ9NRW3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72not detected
APOBEC3CQ9NRW3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72not detected
APOBEC3CQ9NRW3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71not detected
APOBEC3CQ9NRW3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69not detected
APOBEC3CQ9NRW3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69not detected
APOBEC3CQ9NRW3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69not detected
APOBEC3CQ9NRW3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69not detected
APOBEC3CQ9NRW3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68not detected
APOBEC3CQ9NRW3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68not detected
APOBEC3CQ9NRW3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68not detected
APOBEC3CQ9NRW3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67not detected
APOBEC3CQ9NRW3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.672e-8■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67not detected
APOBEC3CQ9NRW3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67not detected
APOBEC3CQ9NRW3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67not detected
APOBEC3CQ9NRW3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67not detected
APOBEC3CQ9NRW3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66not detected
APOBEC3CQ9NRW3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66not detected
APOBEC3CQ9NRW3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66not detected
APOBEC3CQ9NRW3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66not detected
APOBEC3CQ9NRW3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.66not detected
APOBEC3CQ9NRW3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66not detected
APOBEC3CQ9NRW3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66not detected
APOBEC3CQ9NRW3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65not detected
APOBEC3CQ9NRW3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65not detected
APOBEC3CQ9NRW3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64not detected
APOBEC3CQ9NRW3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64not detected
APOBEC3CQ9NRW3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64not detected
APOBEC3CQ9NRW3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64not detected
APOBEC3CQ9NRW3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64not detected
APOBEC3CQ9NRW3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.642e-6■□□□□ 10.8
APOBEC3CQ9NRW3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63not detected
APOBEC3CQ9NRW3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63not detected
APOBEC3CQ9NRW3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63not detected
APOBEC3CQ9NRW3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62not detected
APOBEC3CQ9NRW3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62not detected
APOBEC3CQ9NRW3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62not detected
APOBEC3CQ9NRW3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61not detected
APOBEC3CQ9NRW3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61not detected
APOBEC3CQ9NRW3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6not detected
APOBEC3CQ9NRW3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6not detected
APOBEC3CQ9NRW3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6not detected
APOBEC3CQ9NRW3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6not detected
APOBEC3CQ9NRW3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6not detected
APOBEC3CQ9NRW3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59not detected
APOBEC3CQ9NRW3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59not detected
APOBEC3CQ9NRW3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59not detected
APOBEC3CQ9NRW3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57not detected
APOBEC3CQ9NRW3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57not detected
APOBEC3CQ9NRW3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57not detected
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms