Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW3

APOBEC3C, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3C, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3CQ9NRW3 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.281e-9■■■■■ 83.8
APOBEC3CQ9NRW3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.631e-18■■■■■ 75.5
APOBEC3CQ9NRW3 NME4-208ENST00000454619 719 ntTSL 515.93■□□□□ 0.145e-9■■■■■ 64.5
APOBEC3CQ9NRW3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.891e-6■■■■■ 63.8
APOBEC3CQ9NRW3 AC079781.5-203ENST00000641315 2059 nt19.37■□□□□ 0.691e-6■■■■■ 63.8
APOBEC3CQ9NRW3 AC079781.5-201ENST00000641390 3211 nt17.13■□□□□ 0.331e-6■■■■■ 63.8
APOBEC3CQ9NRW3 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.071e-6■■■■■ 63.8
APOBEC3CQ9NRW3 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21e-6■■■■■ 63.8
APOBEC3CQ9NRW3 ASNS-203ENST00000394309 2289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.471e-6■■■■■ 63.8
APOBEC3CQ9NRW3 ASNS-205ENST00000422745 1865 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.721e-6■■■■■ 63.8
APOBEC3CQ9NRW3 ASNS-202ENST00000394308 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.731e-6■■■■■ 63.8
APOBEC3CQ9NRW3 ASNS-213ENST00000454046 1947 ntTSL 58.72□□□□□ -1.011e-6■■■■■ 63.8
APOBEC3CQ9NRW3 ASNS-214ENST00000455086 1588 ntTSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.111e-6■■■■■ 63.8
APOBEC3CQ9NRW3 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.471e-6■■■■■ 63.8
APOBEC3CQ9NRW3 NHSL2-205ENST00000631833 452 ntTSL 516.52■□□□□ 0.241e-15■■■■■ 63
APOBEC3CQ9NRW3 NHSL2-207ENST00000633930 13660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.91e-15■■■■■ 63
APOBEC3CQ9NRW3 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.591e-49■■■■■ 62.4
APOBEC3CQ9NRW3 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.581e-49■■■■■ 62.4
APOBEC3CQ9NRW3 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.391e-49■■■■■ 62.4
APOBEC3CQ9NRW3 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.321e-49■■■■■ 62.4
APOBEC3CQ9NRW3 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.121e-49■■■■■ 62.4
APOBEC3CQ9NRW3 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.091e-49■■■■■ 62.4
APOBEC3CQ9NRW3 ELOF1-207ENST00000591674 679 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.941e-49■■■■■ 62.4
APOBEC3CQ9NRW3 NME4-204ENST00000433358 966 ntTSL 325.6■■□□□ 1.694e-9■■■■■ 61.2
APOBEC3CQ9NRW3 NME4-209ENST00000460297 1652 ntTSL 525.51■■□□□ 1.674e-9■■■■■ 61.2
APOBEC3CQ9NRW3 NME4-206ENST00000448828 1167 ntTSL 224.91■■□□□ 1.584e-9■■■■■ 61.2
APOBEC3CQ9NRW3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.44e-9■■■■■ 61.2
APOBEC3CQ9NRW3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.44e-9■■■■■ 61.2
APOBEC3CQ9NRW3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.44e-9■■■■■ 61.2
APOBEC3CQ9NRW3 NME4-205ENST00000444498 1111 ntTSL 320.48■□□□□ 0.874e-9■■■■■ 61.2
APOBEC3CQ9NRW3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.664e-9■■■■■ 61.2
APOBEC3CQ9NRW3 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.034e-9■■■■■ 61.2
APOBEC3CQ9NRW3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.336e-7■■■■■ 58.5
APOBEC3CQ9NRW3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.726e-7■■■■■ 58.5
APOBEC3CQ9NRW3 SEC61G-202ENST00000395535 459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.046e-7■■■■■ 58.5
APOBEC3CQ9NRW3 SEC61G-201ENST00000352861 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.156e-7■■■■■ 58.5
APOBEC3CQ9NRW3 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.228e-24■■■■■ 52.2
APOBEC3CQ9NRW3 BAX-207ENST00000502487 1346 ntTSL 1 (best)28.88■■■□□ 2.212e-12■■■■■ 50.1
APOBEC3CQ9NRW3 BAX-211ENST00000513545 775 ntTSL 324.02■■□□□ 1.442e-12■■■■■ 50.1
APOBEC3CQ9NRW3 PFDN6-207ENST00000491382 989 ntTSL 217.48■□□□□ 0.392e-7■■■■■ 43.8
APOBEC3CQ9NRW3 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.212e-7■■■■■ 43.8
APOBEC3CQ9NRW3 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.289e-11■■■■■ 43.6
APOBEC3CQ9NRW3 CD52-202ENST00000470468 381 ntTSL 32.14□□□□□ -2.079e-11■■■■■ 43.6
APOBEC3CQ9NRW3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.852e-43■■■■■ 42.5
APOBEC3CQ9NRW3 FLVCR2-205ENST00000554496 441 ntTSL 312.87□□□□□ -0.355e-14■■■■■ 42.4
APOBEC3CQ9NRW3 FLVCR2-201ENST00000238667 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.585e-14■■■■■ 42.4
APOBEC3CQ9NRW3 FLVCR2-209ENST00000555385 218 ntTSL 410.93□□□□□ -0.665e-14■■■■■ 42.4
APOBEC3CQ9NRW3 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC4.06□□□□□ -1.765e-14■■■■■ 42.4
APOBEC3CQ9NRW3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.982e-10■■■■■ 42.3
APOBEC3CQ9NRW3 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.032e-10■■■■■ 42.3
APOBEC3CQ9NRW3 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.022e-10■■■■■ 42.3
APOBEC3CQ9NRW3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.851e-7■■■■■ 42.1
APOBEC3CQ9NRW3 PSMG1-205ENST00000481921 716 ntTSL 23.23□□□□□ -1.892e-10■■■■■ 42
APOBEC3CQ9NRW3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.272e-7■■■■■ 41.5
APOBEC3CQ9NRW3 PRPF19-202ENST00000535326 779 ntTSL 513.18□□□□□ -0.32e-7■■■■■ 41.5
APOBEC3CQ9NRW3 PRPF19-205ENST00000540473 169 ntTSL 57.25□□□□□ -1.252e-7■■■■■ 41.5
APOBEC3CQ9NRW3 COX5B-204ENST00000494306 738 ntTSL 213.6□□□□□ -0.231e-20■■■■■ 41.3
APOBEC3CQ9NRW3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.552e-7■■■■■ 40.2
APOBEC3CQ9NRW3 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.212e-7■■■■■ 40.2
APOBEC3CQ9NRW3 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.092e-7■■■■■ 40.2
APOBEC3CQ9NRW3 PFDN6-205ENST00000395134 805 ntTSL 29.04□□□□□ -0.962e-7■■■■■ 40.2
APOBEC3CQ9NRW3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.51e-11■■■■■ 39.7
APOBEC3CQ9NRW3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.111e-11■■■■■ 39.7
APOBEC3CQ9NRW3 AGPAT3-207ENST00000445582 582 ntTSL 313.61□□□□□ -0.231e-11■■■■■ 39.7
APOBEC3CQ9NRW3 AGPAT3-208ENST00000448287 454 ntTSL 312.88□□□□□ -0.351e-11■■■■■ 39.7
APOBEC3CQ9NRW3 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.451e-11■■■■■ 39.7
APOBEC3CQ9NRW3 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.451e-11■■■■■ 39.7
APOBEC3CQ9NRW3 ACAT2-203ENST00000472052 1641 ntTSL 210.5□□□□□ -0.731e-11■■■■■ 39.7
APOBEC3CQ9NRW3 S100A1-203ENST00000368698 784 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.452e-9■■■■■ 38.8
APOBEC3CQ9NRW3 S100A1-201ENST00000292169 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.562e-9■■■■■ 38.8
APOBEC3CQ9NRW3 S100A1-205ENST00000469893 2621 ntTSL 1 (best)11.54□□□□□ -0.562e-9■■■■■ 38.8
APOBEC3CQ9NRW3 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.272e-9■■■■■ 38.8
APOBEC3CQ9NRW3 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC15.07■□□□□ 01e-7■■■■■ 37.6
APOBEC3CQ9NRW3 SNORD3B-1-203ENST00000631292 217 nt11.95□□□□□ -0.51e-7■■■■■ 37.6
APOBEC3CQ9NRW3 SNORD3B-1-202ENST00000617128 218 nt11.77□□□□□ -0.531e-7■■■■■ 37.6
APOBEC3CQ9NRW3 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.224e-7■■■■■ 37.3
APOBEC3CQ9NRW3 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.016e-9■■■■■ 37.3
APOBEC3CQ9NRW3 MAGOH-204ENST00000495868 695 ntTSL 1 (best)11.01□□□□□ -0.656e-9■■■■■ 37.3
APOBEC3CQ9NRW3 MAGOH-201ENST00000371466 500 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.896e-9■■■■■ 37.3
APOBEC3CQ9NRW3 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.094e-7■■■■■ 37.3
APOBEC3CQ9NRW3 FAM98B-204ENST00000559431 305 ntTSL 510.77□□□□□ -0.694e-7■■■■■ 37.3
APOBEC3CQ9NRW3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.374e-9■■■■■ 37.2
APOBEC3CQ9NRW3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.154e-9■■■■■ 37.2
APOBEC3CQ9NRW3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.144e-9■■■■■ 37.2
APOBEC3CQ9NRW3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.014e-9■■■■■ 37.2
APOBEC3CQ9NRW3 RPS6KB2-209ENST00000528964 1806 ntTSL 520.52■□□□□ 0.884e-9■■■■■ 37.2
APOBEC3CQ9NRW3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.874e-9■■■■■ 37.2
APOBEC3CQ9NRW3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.864e-9■■■■■ 37.2
APOBEC3CQ9NRW3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.614e-9■■■■■ 37.2
APOBEC3CQ9NRW3 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.364e-9■■■■■ 37.2
APOBEC3CQ9NRW3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.34e-9■■■■■ 37.2
APOBEC3CQ9NRW3 OTUB1-201ENST00000301453 2493 ntTSL 215.51■□□□□ 0.074e-9■■■■■ 37.2
APOBEC3CQ9NRW3 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.14e-9■■■■■ 37.2
APOBEC3CQ9NRW3 RPS6KB2-205ENST00000525088 5528 ntTSL 214.11□□□□□ -0.154e-9■■■■■ 37.2
APOBEC3CQ9NRW3 OOEP-202ENST00000370363 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.384e-9■■■■■ 37.2
APOBEC3CQ9NRW3 OOEP-203ENST00000441145 964 ntTSL 311.59□□□□□ -0.554e-9■■■■■ 37.2
APOBEC3CQ9NRW3 C11orf58-210ENST00000531658 4258 ntTSL 1 (best)5.2□□□□□ -1.584e-9■■■■■ 37.2
APOBEC3CQ9NRW3 C11orf58-203ENST00000524461 2040 ntTSL 24.49□□□□□ -1.694e-9■■■■■ 37.2
APOBEC3CQ9NRW3 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC1.87□□□□□ -2.114e-9■■■■■ 37.2
APOBEC3CQ9NRW3 SS18L1-203ENST00000450482 781 ntTSL 512.92□□□□□ -0.341e-6■■■■■ 37.1
Retrieved 100 of 4,302 protein–RNA pairs in 21.2 ms