Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW3

APOBEC3C, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3C, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3CQ9NRW3 RPS2-211ENST00000531065 1548 ntTSL 529.6■■■□□ 2.331e-323■□□□□ 8.6
APOBEC3CQ9NRW3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.221e-323■□□□□ 8.6
APOBEC3CQ9NRW3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.121e-323■□□□□ 8.6
APOBEC3CQ9NRW3 RPS2-207ENST00000527826 837 ntTSL 1 (best)28.28■■■□□ 2.121e-323■□□□□ 8.6
APOBEC3CQ9NRW3 RPS2-205ENST00000527109 1030 ntTSL 1 (best)28.28■■■□□ 2.121e-323■□□□□ 8.6
APOBEC3CQ9NRW3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.111e-323■□□□□ 8.6
APOBEC3CQ9NRW3 RPS2-206ENST00000527302 719 ntTSL 328.07■■■□□ 2.081e-323■□□□□ 8.6
APOBEC3CQ9NRW3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.951e-323■□□□□ 8.6
APOBEC3CQ9NRW3 RPS2-208ENST00000527871 1243 ntTSL 1 (best)26.87■■□□□ 1.891e-323■□□□□ 8.6
APOBEC3CQ9NRW3 RPS2-213ENST00000533161 1186 ntTSL 1 (best)26.48■■□□□ 1.831e-323■□□□□ 8.6
APOBEC3CQ9NRW3 SLC37A3-210ENST00000469193 647 ntTSL 324.67■■□□□ 1.541e-323■□□□□ 11
APOBEC3CQ9NRW3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.941e-323■□□□□ 8.6
APOBEC3CQ9NRW3 SLC37A3-204ENST00000460560 2111 ntTSL 519.68■□□□□ 0.741e-323■□□□□ 11
APOBEC3CQ9NRW3 HBA1-203ENST00000472694 674 ntTSL 1 (best)19.42■□□□□ 0.71e-323■□□□□ 8.6
APOBEC3CQ9NRW3 SLC37A3-208ENST00000464865 1228 ntTSL 218.57■□□□□ 0.561e-323■□□□□ 11
APOBEC3CQ9NRW3 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.041e-323■□□□□ 11
APOBEC3CQ9NRW3 RNA5SP248-201ENST00000365602 127 ntBASIC13.96□□□□□ -0.171e-323■□□□□ 11
APOBEC3CQ9NRW3 SLC37A3-203ENST00000447932 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.221e-323■□□□□ 11
APOBEC3CQ9NRW3 SLC37A3-222ENST00000490760 574 ntTSL 512.71□□□□□ -0.371e-323■□□□□ 11
APOBEC3CQ9NRW3 SLC37A3-227ENST00000495257 573 ntTSL 411.64□□□□□ -0.551e-323■□□□□ 11
APOBEC3CQ9NRW3 HBA1-202ENST00000397797 504 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.611e-323■□□□□ 8.6
APOBEC3CQ9NRW3 SLC37A3-215ENST00000477571 3488 ntTSL 511.18□□□□□ -0.621e-323■□□□□ 11
APOBEC3CQ9NRW3 HBG2-201ENST00000336906 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.621e-323■■■□□ 15.6
APOBEC3CQ9NRW3 SLC37A3-205ENST00000461089 617 ntTSL 410.35□□□□□ -0.751e-323■□□□□ 11
APOBEC3CQ9NRW3 RNA5SP149-201ENST00000364952 92 ntBASIC8.69□□□□□ -1.021e-323■■■□□ 14.8
APOBEC3CQ9NRW3 SLC37A3-224ENST00000491505 544 ntTSL 28.63□□□□□ -1.031e-323■□□□□ 11
APOBEC3CQ9NRW3 HBG1-202ENST00000632727 369 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.071e-323■□□□□ 8.8
APOBEC3CQ9NRW3 SLC37A3-202ENST00000340308 2955 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.191e-323■□□□□ 11
APOBEC3CQ9NRW3 HBG2-204ENST00000444587 307 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.261e-323■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 SLC37A3-206ENST00000462881 551 ntTSL 45.19□□□□□ -1.581e-323■□□□□ 11
APOBEC3CQ9NRW3 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC4.06□□□□□ -1.761e-323■■■■■ 36.6
APOBEC3CQ9NRW3 RPS2-217ENST00000563194 170 ntTSL 52.45□□□□□ -2.021e-323■□□□□ 8.6
APOBEC3CQ9NRW3 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.48e-89■■■□□ 15.7
APOBEC3CQ9NRW3 ERCC1-204ENST00000423698 3119 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.626e-86■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 RPS19-204ENST00000598399 1172 ntTSL 514.28□□□□□ -0.126e-82■■□□□ 12.7
APOBEC3CQ9NRW3 RPS19-203ENST00000598261 307 ntTSL 313.2□□□□□ -0.36e-82■■□□□ 12.7
APOBEC3CQ9NRW3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.136e-78■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 RPS14-204ENST00000518139 669 ntTSL 312.72□□□□□ -0.376e-78■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 RPS14-207ENST00000521466 592 ntAPPRIS P1 TSL 512.61□□□□□ -0.396e-78■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.763e-73■■□□□ 12.7
APOBEC3CQ9NRW3 RPS14-205ENST00000519690 3119 ntTSL 214.79□□□□□ -0.043e-73■■□□□ 12.7
APOBEC3CQ9NRW3 RPS14-202ENST00000401695 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.453e-73■■□□□ 12.7
APOBEC3CQ9NRW3 RPL11-202ENST00000443624 994 ntTSL 28.41□□□□□ -1.064e-67■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPS19-207ENST00000600467 420 ntTSL 222.97■■□□□ 1.274e-66■□□□□ 11.1
APOBEC3CQ9NRW3 RPS19-205ENST00000598466 601 ntTSL 212.49□□□□□ -0.414e-66■□□□□ 11.1
APOBEC3CQ9NRW3 RPS19-208ENST00000601492 342 ntTSL 59.12□□□□□ -0.954e-66■□□□□ 11.1
APOBEC3CQ9NRW3 RPS10-205ENST00000480942 734 ntTSL 211.87□□□□□ -0.515e-56■□□□□ 8.4
APOBEC3CQ9NRW3 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.092e-51■■■■□ 24.6
APOBEC3CQ9NRW3 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.452e-51■■■■□ 24.6
APOBEC3CQ9NRW3 SYCP2L-202ENST00000341041 3069 ntTSL 212.01□□□□□ -0.492e-51■■■■□ 24.6
APOBEC3CQ9NRW3 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.591e-49■■■■■ 62.4
APOBEC3CQ9NRW3 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.581e-49■■■■■ 62.4
APOBEC3CQ9NRW3 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.391e-49■■■■■ 62.4
APOBEC3CQ9NRW3 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.321e-49■■■■■ 62.4
APOBEC3CQ9NRW3 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.121e-49■■■■■ 62.4
APOBEC3CQ9NRW3 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.091e-49■■■■■ 62.4
APOBEC3CQ9NRW3 ELOF1-207ENST00000591674 679 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.941e-49■■■■■ 62.4
APOBEC3CQ9NRW3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.852e-43■■■■■ 42.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.723e-43■■□□□ 11.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.533e-43■■□□□ 11.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.273e-43■■□□□ 11.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPL36-204ENST00000579446 452 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.483e-43■■□□□ 11.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPL36-205ENST00000579649 449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.753e-43■■□□□ 11.5
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5B-208ENST00000551182 457 ntTSL 27.42□□□□□ -1.224e-41■□□□□ 11
APOBEC3CQ9NRW3 LRRC75A-AS1-218ENST00000578380 310 ntTSL 323.51■■□□□ 1.359e-38■□□□□ 8.1
APOBEC3CQ9NRW3 RPL11-203ENST00000458455 721 ntTSL 1 (best)13.38□□□□□ -0.272e-36■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 RPL11-201ENST00000374550 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.832e-36■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 RPL11-205ENST00000482370 879 ntTSL 1 (best)9.69□□□□□ -0.862e-36■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.721e-35■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.681e-35■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.31e-35■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 ALDOA-215ENST00000565355 538 ntTSL 516.93■□□□□ 0.31e-35■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 ALDOA-217ENST00000566130 801 ntTSL 215.49■□□□□ 0.071e-35■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.051e-35■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.011e-35■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.021e-35■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.041e-35■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.051e-35■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.141e-35■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.141e-35■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 ALDOA-211ENST00000564521 2534 ntTSL 512.2□□□□□ -0.461e-35■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 HBE1-203ENST00000396895 578 ntTSL 55.82□□□□□ -1.486e-35■■□□□ 14
APOBEC3CQ9NRW3 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.376e-33■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 UBB-206ENST00000577958 376 ntTSL 216.93■□□□□ 0.36e-33■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 UBB-207ENST00000578649 477 ntTSL 514.15□□□□□ -0.146e-33■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 UBB-205ENST00000577640 724 ntTSL 511.61□□□□□ -0.556e-33■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 UBB-204ENST00000535788 704 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.816e-33■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 EEF1G-202ENST00000524420 557 ntTSL 412.01□□□□□ -0.491e-32■□□□□ 8.4
APOBEC3CQ9NRW3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.861e-32■■□□□ 12.8
APOBEC3CQ9NRW3 RPL27A-203ENST00000525981 297 ntTSL 516.14■□□□□ 0.171e-32■■□□□ 12.8
APOBEC3CQ9NRW3 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.171e-32■■□□□ 12.8
APOBEC3CQ9NRW3 RPL27A-212ENST00000534599 651 ntTSL 514.27□□□□□ -0.131e-32■■□□□ 12.8
APOBEC3CQ9NRW3 RPL27A-201ENST00000314138 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.441e-32■■□□□ 12.8
APOBEC3CQ9NRW3 RPL27A-208ENST00000530913 805 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.541e-32■■□□□ 12.8
APOBEC3CQ9NRW3 RPL27A-204ENST00000526562 519 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.651e-32■■□□□ 12.8
APOBEC3CQ9NRW3 RPL27A-211ENST00000532359 406 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.221e-32■■□□□ 12.8
APOBEC3CQ9NRW3 AP002990.1-201ENST00000526409 1954 ntTSL 518.4■□□□□ 0.545e-32■□□□□ 8.3
APOBEC3CQ9NRW3 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.015e-32■□□□□ 8.3
APOBEC3CQ9NRW3 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.145e-32■□□□□ 8.3
APOBEC3CQ9NRW3 EEF1G-203ENST00000525340 2496 ntTSL 1 (best)13.19□□□□□ -0.35e-32■□□□□ 8.3
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