Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ7

PCDHB16, Protocadherin beta-16, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB16Q9NRJ7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PCDHB16Q9NRJ7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PCDHB16Q9NRJ7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCDHB16Q9NRJ7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PCDHB16Q9NRJ7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCDHB16Q9NRJ7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHB16Q9NRJ7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PCDHB16Q9NRJ7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHB16Q9NRJ7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHB16Q9NRJ7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHB16Q9NRJ7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDHB16Q9NRJ7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCDHB16Q9NRJ7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCDHB16Q9NRJ7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDHB16Q9NRJ7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCDHB16Q9NRJ7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCDHB16Q9NRJ7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHB16Q9NRJ7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHB16Q9NRJ7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHB16Q9NRJ7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCDHB16Q9NRJ7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCDHB16Q9NRJ7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCDHB16Q9NRJ7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCDHB16Q9NRJ7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCDHB16Q9NRJ7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCDHB16Q9NRJ7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCDHB16Q9NRJ7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDHB16Q9NRJ7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCDHB16Q9NRJ7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCDHB16Q9NRJ7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCDHB16Q9NRJ7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCDHB16Q9NRJ7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCDHB16Q9NRJ7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCDHB16Q9NRJ7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCDHB16Q9NRJ7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PCDHB16Q9NRJ7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCDHB16Q9NRJ7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCDHB16Q9NRJ7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDHB16Q9NRJ7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PCDHB16Q9NRJ7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCDHB16Q9NRJ7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCDHB16Q9NRJ7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PCDHB16Q9NRJ7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCDHB16Q9NRJ7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHB16Q9NRJ7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDHB16Q9NRJ7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDHB16Q9NRJ7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDHB16Q9NRJ7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCDHB16Q9NRJ7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHB16Q9NRJ7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHB16Q9NRJ7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHB16Q9NRJ7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHB16Q9NRJ7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHB16Q9NRJ7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PCDHB16Q9NRJ7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHB16Q9NRJ7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHB16Q9NRJ7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHB16Q9NRJ7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHB16Q9NRJ7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHB16Q9NRJ7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB16Q9NRJ7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB16Q9NRJ7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHB16Q9NRJ7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHB16Q9NRJ7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHB16Q9NRJ7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHB16Q9NRJ7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHB16Q9NRJ7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHB16Q9NRJ7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHB16Q9NRJ7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDHB16Q9NRJ7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDHB16Q9NRJ7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHB16Q9NRJ7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB16Q9NRJ7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB16Q9NRJ7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHB16Q9NRJ7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHB16Q9NRJ7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHB16Q9NRJ7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB16Q9NRJ7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB16Q9NRJ7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHB16Q9NRJ7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB16Q9NRJ7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB16Q9NRJ7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHB16Q9NRJ7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHB16Q9NRJ7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHB16Q9NRJ7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHB16Q9NRJ7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHB16Q9NRJ7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHB16Q9NRJ7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHB16Q9NRJ7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHB16Q9NRJ7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHB16Q9NRJ7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHB16Q9NRJ7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHB16Q9NRJ7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHB16Q9NRJ7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHB16Q9NRJ7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHB16Q9NRJ7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHB16Q9NRJ7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHB16Q9NRJ7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHB16Q9NRJ7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHB16Q9NRJ7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms