Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB3

CABP2, Calcium-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP2Q9NPB3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC48.18■■■■■ 5.3
CABP2Q9NPB3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC47.11■■■■■ 5.13
CABP2Q9NPB3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.82■■■■■ 5.09
CABP2Q9NPB3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.58■■■■■ 5.05
CABP2Q9NPB3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
CABP2Q9NPB3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.51■■■■■ 5.04
CABP2Q9NPB3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.38■■■■■ 5.02
CABP2Q9NPB3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC46.28■■■■■ 5
CABP2Q9NPB3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.23■■■■■ 4.83
CABP2Q9NPB3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
CABP2Q9NPB3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC45.09■■■■■ 4.81
CABP2Q9NPB3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC44.96■■■■■ 4.79
CABP2Q9NPB3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC44.93■■■■■ 4.78
CABP2Q9NPB3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.9■■■■■ 4.78
CABP2Q9NPB3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC44.88■■■■■ 4.78
CABP2Q9NPB3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
CABP2Q9NPB3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC44.63■■■■■ 4.73
CABP2Q9NPB3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
CABP2Q9NPB3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
CABP2Q9NPB3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC44.29■■■■■ 4.68
CABP2Q9NPB3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
CABP2Q9NPB3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
CABP2Q9NPB3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.18■■■■■ 4.66
CABP2Q9NPB3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
CABP2Q9NPB3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
CABP2Q9NPB3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
CABP2Q9NPB3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
CABP2Q9NPB3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC43.64■■■■■ 4.58
CABP2Q9NPB3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC43.56■■■■■ 4.56
CABP2Q9NPB3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC43.37■■■■■ 4.53
CABP2Q9NPB3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.37■■■■■ 4.53
CABP2Q9NPB3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
CABP2Q9NPB3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
CABP2Q9NPB3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
CABP2Q9NPB3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC42.97■■■■■ 4.47
CABP2Q9NPB3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
CABP2Q9NPB3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.88■■■■■ 4.45
CABP2Q9NPB3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC42.88■■■■■ 4.45
CABP2Q9NPB3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC42.8■■■■■ 4.44
CABP2Q9NPB3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
CABP2Q9NPB3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC42.7■■■■■ 4.43
CABP2Q9NPB3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC42.65■■■■■ 4.42
CABP2Q9NPB3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC42.62■■■■■ 4.41
CABP2Q9NPB3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
CABP2Q9NPB3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
CABP2Q9NPB3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
CABP2Q9NPB3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
CABP2Q9NPB3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
CABP2Q9NPB3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
CABP2Q9NPB3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC42.16■■■■■ 4.34
CABP2Q9NPB3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
CABP2Q9NPB3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC41.99■■■■■ 4.31
CABP2Q9NPB3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.97■■■■■ 4.31
CABP2Q9NPB3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.91■■■■■ 4.3
CABP2Q9NPB3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
CABP2Q9NPB3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC41.73■■■■■ 4.27
CABP2Q9NPB3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC41.63■■■■■ 4.25
CABP2Q9NPB3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC41.63■■■■■ 4.25
CABP2Q9NPB3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
CABP2Q9NPB3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
CABP2Q9NPB3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
CABP2Q9NPB3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
CABP2Q9NPB3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC41.57■■■■■ 4.24
CABP2Q9NPB3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
CABP2Q9NPB3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
CABP2Q9NPB3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
CABP2Q9NPB3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
CABP2Q9NPB3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
CABP2Q9NPB3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC41.44■■■■■ 4.23
CABP2Q9NPB3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC41.43■■■■■ 4.22
CABP2Q9NPB3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
CABP2Q9NPB3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
CABP2Q9NPB3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
CABP2Q9NPB3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC41.36■■■■■ 4.21
CABP2Q9NPB3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
CABP2Q9NPB3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
CABP2Q9NPB3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
CABP2Q9NPB3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
CABP2Q9NPB3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
CABP2Q9NPB3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
CABP2Q9NPB3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
CABP2Q9NPB3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
CABP2Q9NPB3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC41.11■■■■■ 4.17
CABP2Q9NPB3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.17
CABP2Q9NPB3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
CABP2Q9NPB3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
CABP2Q9NPB3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
CABP2Q9NPB3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
CABP2Q9NPB3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
CABP2Q9NPB3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
CABP2Q9NPB3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
CABP2Q9NPB3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
CABP2Q9NPB3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
CABP2Q9NPB3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
CABP2Q9NPB3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
CABP2Q9NPB3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
CABP2Q9NPB3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.8■■■■■ 4.12
CABP2Q9NPB3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
CABP2Q9NPB3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC40.78■■■■■ 4.12
CABP2Q9NPB3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms