Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB3

CABP2, Calcium-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP2Q9NPB3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
CABP2Q9NPB3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC40.74■■■■■ 4.11
CABP2Q9NPB3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
CABP2Q9NPB3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
CABP2Q9NPB3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
CABP2Q9NPB3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
CABP2Q9NPB3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
CABP2Q9NPB3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
CABP2Q9NPB3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
CABP2Q9NPB3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC40.41■■■■■ 4.06
CABP2Q9NPB3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC40.41■■■■■ 4.06
CABP2Q9NPB3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
CABP2Q9NPB3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC40.37■■■■■ 4.05
CABP2Q9NPB3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
CABP2Q9NPB3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
CABP2Q9NPB3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC40.33■■■■■ 4.05
CABP2Q9NPB3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
CABP2Q9NPB3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
CABP2Q9NPB3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
CABP2Q9NPB3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
CABP2Q9NPB3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
CABP2Q9NPB3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
CABP2Q9NPB3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC40.16■■■■■ 4.02
CABP2Q9NPB3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
CABP2Q9NPB3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC40.13■■■■■ 4.01
CABP2Q9NPB3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC40.12■■■■■ 4.01
CABP2Q9NPB3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC40.12■■■■■ 4.01
CABP2Q9NPB3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
CABP2Q9NPB3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
CABP2Q9NPB3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
CABP2Q9NPB3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
CABP2Q9NPB3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
CABP2Q9NPB3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
CABP2Q9NPB3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
CABP2Q9NPB3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC39.93■■■■□ 3.98
CABP2Q9NPB3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
CABP2Q9NPB3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
CABP2Q9NPB3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
CABP2Q9NPB3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
CABP2Q9NPB3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
CABP2Q9NPB3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
CABP2Q9NPB3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
CABP2Q9NPB3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
CABP2Q9NPB3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
CABP2Q9NPB3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC39.78■■■■□ 3.96
CABP2Q9NPB3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
CABP2Q9NPB3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
CABP2Q9NPB3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
CABP2Q9NPB3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC39.72■■■■□ 3.95
CABP2Q9NPB3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
CABP2Q9NPB3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC39.7■■■■□ 3.95
CABP2Q9NPB3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
CABP2Q9NPB3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC39.67■■■■□ 3.94
CABP2Q9NPB3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC39.66■■■■□ 3.94
CABP2Q9NPB3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC39.66■■■■□ 3.94
CABP2Q9NPB3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
CABP2Q9NPB3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC39.63■■■■□ 3.93
CABP2Q9NPB3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC39.62■■■■□ 3.93
CABP2Q9NPB3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC39.62■■■■□ 3.93
CABP2Q9NPB3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
CABP2Q9NPB3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
CABP2Q9NPB3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC39.56■■■■□ 3.92
CABP2Q9NPB3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
CABP2Q9NPB3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
CABP2Q9NPB3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
CABP2Q9NPB3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
CABP2Q9NPB3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
CABP2Q9NPB3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
CABP2Q9NPB3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
CABP2Q9NPB3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
CABP2Q9NPB3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
CABP2Q9NPB3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
CABP2Q9NPB3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
CABP2Q9NPB3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
CABP2Q9NPB3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
CABP2Q9NPB3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
CABP2Q9NPB3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
CABP2Q9NPB3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC39.36■■■■□ 3.89
CABP2Q9NPB3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC39.34■■■■□ 3.89
CABP2Q9NPB3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
CABP2Q9NPB3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
CABP2Q9NPB3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
CABP2Q9NPB3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
CABP2Q9NPB3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
CABP2Q9NPB3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
CABP2Q9NPB3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
CABP2Q9NPB3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
CABP2Q9NPB3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
CABP2Q9NPB3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
CABP2Q9NPB3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
CABP2Q9NPB3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
CABP2Q9NPB3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
CABP2Q9NPB3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
CABP2Q9NPB3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
CABP2Q9NPB3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
CABP2Q9NPB3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
CABP2Q9NPB3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC39.11■■■■□ 3.85
CABP2Q9NPB3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC39.1■■■■□ 3.85
CABP2Q9NPB3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
CABP2Q9NPB3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms