Protein–RNA interactions for Protein: Q9H239

MMP28, Matrix metalloproteinase-28, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP28Q9H239 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
MMP28Q9H239 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MMP28Q9H239 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MMP28Q9H239 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
MMP28Q9H239 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MMP28Q9H239 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MMP28Q9H239 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MMP28Q9H239 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MMP28Q9H239 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MMP28Q9H239 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MMP28Q9H239 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MMP28Q9H239 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MMP28Q9H239 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MMP28Q9H239 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
MMP28Q9H239 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MMP28Q9H239 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MMP28Q9H239 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MMP28Q9H239 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MMP28Q9H239 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MMP28Q9H239 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MMP28Q9H239 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
MMP28Q9H239 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MMP28Q9H239 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MMP28Q9H239 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MMP28Q9H239 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MMP28Q9H239 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MMP28Q9H239 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MMP28Q9H239 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MMP28Q9H239 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MMP28Q9H239 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MMP28Q9H239 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MMP28Q9H239 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MMP28Q9H239 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MMP28Q9H239 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MMP28Q9H239 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MMP28Q9H239 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MMP28Q9H239 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MMP28Q9H239 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MMP28Q9H239 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MMP28Q9H239 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MMP28Q9H239 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MMP28Q9H239 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MMP28Q9H239 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MMP28Q9H239 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MMP28Q9H239 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MMP28Q9H239 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MMP28Q9H239 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MMP28Q9H239 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MMP28Q9H239 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MMP28Q9H239 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MMP28Q9H239 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MMP28Q9H239 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MMP28Q9H239 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MMP28Q9H239 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MMP28Q9H239 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MMP28Q9H239 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MMP28Q9H239 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MMP28Q9H239 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MMP28Q9H239 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MMP28Q9H239 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MMP28Q9H239 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MMP28Q9H239 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MMP28Q9H239 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MMP28Q9H239 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MMP28Q9H239 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMP28Q9H239 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMP28Q9H239 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMP28Q9H239 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MMP28Q9H239 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MMP28Q9H239 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MMP28Q9H239 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MMP28Q9H239 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MMP28Q9H239 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MMP28Q9H239 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MMP28Q9H239 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MMP28Q9H239 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MMP28Q9H239 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MMP28Q9H239 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MMP28Q9H239 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MMP28Q9H239 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MMP28Q9H239 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MMP28Q9H239 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP28Q9H239 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP28Q9H239 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP28Q9H239 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MMP28Q9H239 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMP28Q9H239 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP28Q9H239 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MMP28Q9H239 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MMP28Q9H239 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MMP28Q9H239 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MMP28Q9H239 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP28Q9H239 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP28Q9H239 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MMP28Q9H239 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MMP28Q9H239 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MMP28Q9H239 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP28Q9H239 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MMP28Q9H239 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MMP28Q9H239 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms