Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CACNG6Q9BXT2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CACNG6Q9BXT2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CACNG6Q9BXT2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CACNG6Q9BXT2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CACNG6Q9BXT2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CACNG6Q9BXT2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CACNG6Q9BXT2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CACNG6Q9BXT2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CACNG6Q9BXT2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CACNG6Q9BXT2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CACNG6Q9BXT2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CACNG6Q9BXT2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CACNG6Q9BXT2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CACNG6Q9BXT2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CACNG6Q9BXT2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CACNG6Q9BXT2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CACNG6Q9BXT2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CACNG6Q9BXT2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACNG6Q9BXT2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CACNG6Q9BXT2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CACNG6Q9BXT2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNG6Q9BXT2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CACNG6Q9BXT2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CACNG6Q9BXT2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNG6Q9BXT2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CACNG6Q9BXT2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CACNG6Q9BXT2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CACNG6Q9BXT2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNG6Q9BXT2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNG6Q9BXT2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CACNG6Q9BXT2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CACNG6Q9BXT2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNG6Q9BXT2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CACNG6Q9BXT2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACNG6Q9BXT2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CACNG6Q9BXT2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CACNG6Q9BXT2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CACNG6Q9BXT2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNG6Q9BXT2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNG6Q9BXT2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNG6Q9BXT2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNG6Q9BXT2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNG6Q9BXT2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNG6Q9BXT2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNG6Q9BXT2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNG6Q9BXT2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNG6Q9BXT2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNG6Q9BXT2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CACNG6Q9BXT2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNG6Q9BXT2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CACNG6Q9BXT2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CACNG6Q9BXT2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CACNG6Q9BXT2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNG6Q9BXT2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNG6Q9BXT2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CACNG6Q9BXT2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNG6Q9BXT2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CACNG6Q9BXT2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNG6Q9BXT2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNG6Q9BXT2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNG6Q9BXT2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNG6Q9BXT2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CACNG6Q9BXT2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNG6Q9BXT2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNG6Q9BXT2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNG6Q9BXT2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNG6Q9BXT2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNG6Q9BXT2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNG6Q9BXT2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNG6Q9BXT2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNG6Q9BXT2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNG6Q9BXT2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CACNG6Q9BXT2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CACNG6Q9BXT2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNG6Q9BXT2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNG6Q9BXT2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNG6Q9BXT2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNG6Q9BXT2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNG6Q9BXT2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNG6Q9BXT2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNG6Q9BXT2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNG6Q9BXT2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNG6Q9BXT2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNG6Q9BXT2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNG6Q9BXT2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNG6Q9BXT2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNG6Q9BXT2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNG6Q9BXT2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNG6Q9BXT2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNG6Q9BXT2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNG6Q9BXT2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNG6Q9BXT2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CACNG6Q9BXT2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNG6Q9BXT2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNG6Q9BXT2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNG6Q9BXT2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNG6Q9BXT2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNG6Q9BXT2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNG6Q9BXT2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms