Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT23

LIMD2, LIM domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD2Q9BT23 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIMD2Q9BT23 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LIMD2Q9BT23 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIMD2Q9BT23 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LIMD2Q9BT23 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LIMD2Q9BT23 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LIMD2Q9BT23 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LIMD2Q9BT23 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LIMD2Q9BT23 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LIMD2Q9BT23 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LIMD2Q9BT23 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIMD2Q9BT23 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LIMD2Q9BT23 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LIMD2Q9BT23 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIMD2Q9BT23 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LIMD2Q9BT23 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIMD2Q9BT23 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LIMD2Q9BT23 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LIMD2Q9BT23 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIMD2Q9BT23 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIMD2Q9BT23 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIMD2Q9BT23 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIMD2Q9BT23 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIMD2Q9BT23 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LIMD2Q9BT23 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIMD2Q9BT23 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMD2Q9BT23 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIMD2Q9BT23 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIMD2Q9BT23 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIMD2Q9BT23 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIMD2Q9BT23 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMD2Q9BT23 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LIMD2Q9BT23 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LIMD2Q9BT23 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIMD2Q9BT23 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIMD2Q9BT23 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LIMD2Q9BT23 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIMD2Q9BT23 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIMD2Q9BT23 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIMD2Q9BT23 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIMD2Q9BT23 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIMD2Q9BT23 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LIMD2Q9BT23 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LIMD2Q9BT23 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LIMD2Q9BT23 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LIMD2Q9BT23 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LIMD2Q9BT23 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIMD2Q9BT23 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LIMD2Q9BT23 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LIMD2Q9BT23 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LIMD2Q9BT23 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LIMD2Q9BT23 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LIMD2Q9BT23 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LIMD2Q9BT23 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIMD2Q9BT23 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIMD2Q9BT23 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LIMD2Q9BT23 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LIMD2Q9BT23 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIMD2Q9BT23 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIMD2Q9BT23 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIMD2Q9BT23 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LIMD2Q9BT23 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LIMD2Q9BT23 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIMD2Q9BT23 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIMD2Q9BT23 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LIMD2Q9BT23 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LIMD2Q9BT23 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LIMD2Q9BT23 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIMD2Q9BT23 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIMD2Q9BT23 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIMD2Q9BT23 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LIMD2Q9BT23 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LIMD2Q9BT23 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIMD2Q9BT23 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIMD2Q9BT23 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIMD2Q9BT23 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LIMD2Q9BT23 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LIMD2Q9BT23 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LIMD2Q9BT23 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LIMD2Q9BT23 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LIMD2Q9BT23 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LIMD2Q9BT23 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LIMD2Q9BT23 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LIMD2Q9BT23 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LIMD2Q9BT23 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LIMD2Q9BT23 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LIMD2Q9BT23 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LIMD2Q9BT23 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LIMD2Q9BT23 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LIMD2Q9BT23 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LIMD2Q9BT23 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIMD2Q9BT23 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIMD2Q9BT23 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LIMD2Q9BT23 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIMD2Q9BT23 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LIMD2Q9BT23 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LIMD2Q9BT23 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LIMD2Q9BT23 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LIMD2Q9BT23 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIMD2Q9BT23 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms