Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC57.25■■■■■ 6.76
CARMIL1Q5VZK9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC56.57■■■■■ 6.65
CARMIL1Q5VZK9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.82■■■■■ 6.53
CARMIL1Q5VZK9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC55.74■■■■■ 6.51
CARMIL1Q5VZK9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.34■■■■■ 6.45
CARMIL1Q5VZK9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC55.05■■■■■ 6.4
CARMIL1Q5VZK9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.93■■■■■ 6.38
CARMIL1Q5VZK9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC54.67■■■■■ 6.34
CARMIL1Q5VZK9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC54.14■■■■■ 6.26
CARMIL1Q5VZK9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC53.86■■■■■ 6.21
CARMIL1Q5VZK9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC53.83■■■■■ 6.21
CARMIL1Q5VZK9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC53.75■■■■■ 6.2
CARMIL1Q5VZK9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC53.55■■■■■ 6.16
CARMIL1Q5VZK9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC53.41■■■■■ 6.14
CARMIL1Q5VZK9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC53.36■■■■■ 6.13
CARMIL1Q5VZK9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC53.33■■■■■ 6.13
CARMIL1Q5VZK9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC53.15■■■■■ 6.1
CARMIL1Q5VZK9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.06■■■■■ 6.08
CARMIL1Q5VZK9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.85■■■■■ 6.05
CARMIL1Q5VZK9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC52.82■■■■■ 6.05
CARMIL1Q5VZK9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.48■■■■■ 5.99
CARMIL1Q5VZK9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC52.43■■■■■ 5.98
CARMIL1Q5VZK9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.39■■■■■ 5.98
CARMIL1Q5VZK9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC52.39■■■■■ 5.98
CARMIL1Q5VZK9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.35■■■■■ 5.97
CARMIL1Q5VZK9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC52.23■■■■■ 5.95
CARMIL1Q5VZK9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.21■■■■■ 5.95
CARMIL1Q5VZK9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC52.08■■■■■ 5.93
CARMIL1Q5VZK9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC52.03■■■■■ 5.92
CARMIL1Q5VZK9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.97■■■■■ 5.91
CARMIL1Q5VZK9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.89■■■■■ 5.9
CARMIL1Q5VZK9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC51.86■■■■■ 5.89
CARMIL1Q5VZK9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC51.42■■■■■ 5.82
CARMIL1Q5VZK9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.41■■■■■ 5.82
CARMIL1Q5VZK9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC51.41■■■■■ 5.82
CARMIL1Q5VZK9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC51.39■■■■■ 5.82
CARMIL1Q5VZK9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC51.26■■■■■ 5.8
CARMIL1Q5VZK9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC51.08■■■■■ 5.77
CARMIL1Q5VZK9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC50.97■■■■■ 5.75
CARMIL1Q5VZK9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC50.81■■■■■ 5.72
CARMIL1Q5VZK9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.8■■■■■ 5.72
CARMIL1Q5VZK9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC50.68■■■■■ 5.7
CARMIL1Q5VZK9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.62■■■■■ 5.69
CARMIL1Q5VZK9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.58■■■■■ 5.69
CARMIL1Q5VZK9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.52■■■■■ 5.68
CARMIL1Q5VZK9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC50.41■■■■■ 5.66
CARMIL1Q5VZK9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC50.4■■■■■ 5.66
CARMIL1Q5VZK9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.26■■■■■ 5.64
CARMIL1Q5VZK9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.23■■■■■ 5.63
CARMIL1Q5VZK9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC50.22■■■■■ 5.63
CARMIL1Q5VZK9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC50.14■■■■■ 5.62
CARMIL1Q5VZK9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC49.89■■■■■ 5.58
CARMIL1Q5VZK9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC49.87■■■■■ 5.57
CARMIL1Q5VZK9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC49.87■■■■■ 5.57
CARMIL1Q5VZK9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC49.78■■■■■ 5.56
CARMIL1Q5VZK9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC49.75■■■■■ 5.55
CARMIL1Q5VZK9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.73■■■■■ 5.55
CARMIL1Q5VZK9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC49.63■■■■■ 5.53
CARMIL1Q5VZK9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.61■■■■■ 5.53
CARMIL1Q5VZK9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC49.6■■■■■ 5.53
CARMIL1Q5VZK9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC49.6■■■■■ 5.53
CARMIL1Q5VZK9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC49.6■■■■■ 5.53
CARMIL1Q5VZK9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC49.59■■■■■ 5.53
CARMIL1Q5VZK9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.53■■■■■ 5.52
CARMIL1Q5VZK9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.46■■■■■ 5.51
CARMIL1Q5VZK9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC49.46■■■■■ 5.51
CARMIL1Q5VZK9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC49.45■■■■■ 5.51
CARMIL1Q5VZK9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.43■■■■■ 5.5
CARMIL1Q5VZK9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC49.38■■■■■ 5.5
CARMIL1Q5VZK9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.33■■■■■ 5.49
CARMIL1Q5VZK9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC49.27■■■■■ 5.48
CARMIL1Q5VZK9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.22■■■■■ 5.47
CARMIL1Q5VZK9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.17■■■■■ 5.46
CARMIL1Q5VZK9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC49.17■■■■■ 5.46
CARMIL1Q5VZK9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.15■■■■■ 5.46
CARMIL1Q5VZK9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC49.13■■■■■ 5.45
CARMIL1Q5VZK9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.12■■■■■ 5.45
CARMIL1Q5VZK9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC49.11■■■■■ 5.45
CARMIL1Q5VZK9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC49.1■■■■■ 5.45
CARMIL1Q5VZK9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.09■■■■■ 5.45
CARMIL1Q5VZK9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC49.09■■■■■ 5.45
CARMIL1Q5VZK9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.09■■■■■ 5.45
CARMIL1Q5VZK9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.08■■■■■ 5.45
CARMIL1Q5VZK9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC49.07■■■■■ 5.45
CARMIL1Q5VZK9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC49.04■■■■■ 5.44
CARMIL1Q5VZK9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC49.04■■■■■ 5.44
CARMIL1Q5VZK9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC49.02■■■■■ 5.44
CARMIL1Q5VZK9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49■■■■■ 5.43
CARMIL1Q5VZK9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC48.86■■■■■ 5.41
CARMIL1Q5VZK9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.86■■■■■ 5.41
CARMIL1Q5VZK9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.83■■■■■ 5.41
CARMIL1Q5VZK9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.83■■■■■ 5.41
CARMIL1Q5VZK9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC48.79■■■■■ 5.4
CARMIL1Q5VZK9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC48.75■■■■■ 5.39
CARMIL1Q5VZK9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.74■■■■■ 5.39
CARMIL1Q5VZK9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.67■■■■■ 5.38
CARMIL1Q5VZK9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.67■■■■■ 5.38
CARMIL1Q5VZK9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC48.66■■■■■ 5.38
CARMIL1Q5VZK9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC48.59■■■■■ 5.37
CARMIL1Q5VZK9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC48.53■■■■■ 5.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms