Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.49■■■■■ 5.35
CARMIL1Q5VZK9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.47■■■■■ 5.35
CARMIL1Q5VZK9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC48.47■■■■■ 5.35
CARMIL1Q5VZK9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC48.47■■■■■ 5.35
CARMIL1Q5VZK9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC48.44■■■■■ 5.34
CARMIL1Q5VZK9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.41■■■■■ 5.34
CARMIL1Q5VZK9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.31■■■■■ 5.32
CARMIL1Q5VZK9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC48.28■■■■■ 5.32
CARMIL1Q5VZK9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.27■■■■■ 5.32
CARMIL1Q5VZK9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC48.22■■■■■ 5.31
CARMIL1Q5VZK9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC48.21■■■■■ 5.31
CARMIL1Q5VZK9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC48.2■■■■■ 5.31
CARMIL1Q5VZK9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC48.19■■■■■ 5.3
CARMIL1Q5VZK9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.18■■■■■ 5.3
CARMIL1Q5VZK9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC48.17■■■■■ 5.3
CARMIL1Q5VZK9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.13■■■■■ 5.3
CARMIL1Q5VZK9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC48.12■■■■■ 5.29
CARMIL1Q5VZK9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.09■■■■■ 5.29
CARMIL1Q5VZK9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
CARMIL1Q5VZK9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC48.06■■■■■ 5.28
CARMIL1Q5VZK9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.97■■■■■ 5.27
CARMIL1Q5VZK9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC47.95■■■■■ 5.27
CARMIL1Q5VZK9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC47.94■■■■■ 5.26
CARMIL1Q5VZK9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC47.92■■■■■ 5.26
CARMIL1Q5VZK9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC47.91■■■■■ 5.26
CARMIL1Q5VZK9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.85■■■■■ 5.25
CARMIL1Q5VZK9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC47.84■■■■■ 5.25
CARMIL1Q5VZK9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC47.75■■■■■ 5.24
CARMIL1Q5VZK9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC47.75■■■■■ 5.23
CARMIL1Q5VZK9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.75■■■■■ 5.23
CARMIL1Q5VZK9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.75■■■■■ 5.23
CARMIL1Q5VZK9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.72■■■■■ 5.23
CARMIL1Q5VZK9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC47.7■■■■■ 5.23
CARMIL1Q5VZK9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC47.68■■■■■ 5.22
CARMIL1Q5VZK9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC47.66■■■■■ 5.22
CARMIL1Q5VZK9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC47.65■■■■■ 5.22
CARMIL1Q5VZK9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC47.63■■■■■ 5.22
CARMIL1Q5VZK9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.58■■■■■ 5.21
CARMIL1Q5VZK9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC47.57■■■■■ 5.21
CARMIL1Q5VZK9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.56■■■■■ 5.2
CARMIL1Q5VZK9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC47.53■■■■■ 5.2
CARMIL1Q5VZK9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC47.51■■■■■ 5.2
CARMIL1Q5VZK9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.47■■■■■ 5.19
CARMIL1Q5VZK9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.45■■■■■ 5.19
CARMIL1Q5VZK9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC47.45■■■■■ 5.19
CARMIL1Q5VZK9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.44■■■■■ 5.18
CARMIL1Q5VZK9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC47.43■■■■■ 5.18
CARMIL1Q5VZK9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC47.43■■■■■ 5.18
CARMIL1Q5VZK9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC47.41■■■■■ 5.18
CARMIL1Q5VZK9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC47.4■■■■■ 5.18
CARMIL1Q5VZK9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.35■■■■■ 5.17
CARMIL1Q5VZK9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC47.35■■■■■ 5.17
CARMIL1Q5VZK9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.32■■■■■ 5.17
CARMIL1Q5VZK9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC47.32■■■■■ 5.17
CARMIL1Q5VZK9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC47.31■■■■■ 5.16
CARMIL1Q5VZK9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.28■■■■■ 5.16
CARMIL1Q5VZK9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.27■■■■■ 5.16
CARMIL1Q5VZK9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.26■■■■■ 5.16
CARMIL1Q5VZK9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC47.25■■■■■ 5.16
CARMIL1Q5VZK9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC47.24■■■■■ 5.15
CARMIL1Q5VZK9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC47.21■■■■■ 5.15
CARMIL1Q5VZK9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.13■■■■■ 5.14
CARMIL1Q5VZK9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.13■■■■■ 5.13
CARMIL1Q5VZK9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC47.12■■■■■ 5.13
CARMIL1Q5VZK9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC47.12■■■■■ 5.13
CARMIL1Q5VZK9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC47.07■■■■■ 5.13
CARMIL1Q5VZK9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC47.07■■■■■ 5.13
CARMIL1Q5VZK9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC47.06■■■■■ 5.12
CARMIL1Q5VZK9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC47.02■■■■■ 5.12
CARMIL1Q5VZK9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47■■■■■ 5.12
CARMIL1Q5VZK9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC46.98■■■■■ 5.11
CARMIL1Q5VZK9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.97■■■■■ 5.11
CARMIL1Q5VZK9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC46.97■■■■■ 5.11
CARMIL1Q5VZK9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC46.96■■■■■ 5.11
CARMIL1Q5VZK9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.86■■■■■ 5.09
CARMIL1Q5VZK9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC46.86■■■■■ 5.09
CARMIL1Q5VZK9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC46.86■■■■■ 5.09
CARMIL1Q5VZK9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.76■■■■■ 5.08
CARMIL1Q5VZK9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.75■■■■■ 5.07
CARMIL1Q5VZK9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.74■■■■■ 5.07
CARMIL1Q5VZK9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC46.73■■■■■ 5.07
CARMIL1Q5VZK9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.73■■■■■ 5.07
CARMIL1Q5VZK9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.72■■■■■ 5.07
CARMIL1Q5VZK9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.65■■■■■ 5.06
CARMIL1Q5VZK9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.63■■■■■ 5.06
CARMIL1Q5VZK9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.61■■■■■ 5.05
CARMIL1Q5VZK9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC46.6■■■■■ 5.05
CARMIL1Q5VZK9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC46.59■■■■■ 5.05
CARMIL1Q5VZK9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.59■■■■■ 5.05
CARMIL1Q5VZK9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC46.59■■■■■ 5.05
CARMIL1Q5VZK9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.59■■■■■ 5.05
CARMIL1Q5VZK9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC46.58■■■■■ 5.05
CARMIL1Q5VZK9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.58■■■■■ 5.05
CARMIL1Q5VZK9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC46.57■■■■■ 5.05
CARMIL1Q5VZK9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC46.56■■■■■ 5.04
CARMIL1Q5VZK9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.55■■■■■ 5.04
CARMIL1Q5VZK9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC46.55■■■■■ 5.04
CARMIL1Q5VZK9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC46.55■■■■■ 5.04
CARMIL1Q5VZK9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.53■■■■■ 5.04
CARMIL1Q5VZK9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms