Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
LAMA3Q16787 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
LAMA3Q16787 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.57■■■■□ 3.61
LAMA3Q16787 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
LAMA3Q16787 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
LAMA3Q16787 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
LAMA3Q16787 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
LAMA3Q16787 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
LAMA3Q16787 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
LAMA3Q16787 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
LAMA3Q16787 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
LAMA3Q16787 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
LAMA3Q16787 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
LAMA3Q16787 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
LAMA3Q16787 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
LAMA3Q16787 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
LAMA3Q16787 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
LAMA3Q16787 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
LAMA3Q16787 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
LAMA3Q16787 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
LAMA3Q16787 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
LAMA3Q16787 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
LAMA3Q16787 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
LAMA3Q16787 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
LAMA3Q16787 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
LAMA3Q16787 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
LAMA3Q16787 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
LAMA3Q16787 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
LAMA3Q16787 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
LAMA3Q16787 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
LAMA3Q16787 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
LAMA3Q16787 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
LAMA3Q16787 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
LAMA3Q16787 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
LAMA3Q16787 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
LAMA3Q16787 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
LAMA3Q16787 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
LAMA3Q16787 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
LAMA3Q16787 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
LAMA3Q16787 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
LAMA3Q16787 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
LAMA3Q16787 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
LAMA3Q16787 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
LAMA3Q16787 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
LAMA3Q16787 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
LAMA3Q16787 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
LAMA3Q16787 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
LAMA3Q16787 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
LAMA3Q16787 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
LAMA3Q16787 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
LAMA3Q16787 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
LAMA3Q16787 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
LAMA3Q16787 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
LAMA3Q16787 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
LAMA3Q16787 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
LAMA3Q16787 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
LAMA3Q16787 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
LAMA3Q16787 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
LAMA3Q16787 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
LAMA3Q16787 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
LAMA3Q16787 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
LAMA3Q16787 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
LAMA3Q16787 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
LAMA3Q16787 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
LAMA3Q16787 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
LAMA3Q16787 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
LAMA3Q16787 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
LAMA3Q16787 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
LAMA3Q16787 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
LAMA3Q16787 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LAMA3Q16787 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
LAMA3Q16787 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
LAMA3Q16787 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
LAMA3Q16787 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
LAMA3Q16787 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
LAMA3Q16787 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
LAMA3Q16787 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
LAMA3Q16787 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
LAMA3Q16787 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
LAMA3Q16787 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
LAMA3Q16787 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
LAMA3Q16787 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
LAMA3Q16787 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
LAMA3Q16787 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
LAMA3Q16787 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
LAMA3Q16787 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.88
LAMA3Q16787 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
LAMA3Q16787 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
LAMA3Q16787 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
LAMA3Q16787 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
LAMA3Q16787 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
LAMA3Q16787 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
LAMA3Q16787 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
LAMA3Q16787 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
LAMA3Q16787 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
LAMA3Q16787 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
LAMA3Q16787 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
LAMA3Q16787 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
LAMA3Q16787 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
LAMA3Q16787 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms