Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 GPC3-203ENST00000406757 836 ntTSL 26.82□□□□□ -1.324e-9■■■■■ 65.6
SRSF7Q16629 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.42e-26■■■■■ 65.1
SRSF7Q16629 GGA2-208ENST00000566685 571 ntTSL 413.14□□□□□ -0.312e-26■■■■■ 65.1
SRSF7Q16629 GGA2-213ENST00000568922 1807 ntTSL 210.62□□□□□ -0.712e-26■■■■■ 65.1
SRSF7Q16629 GGA2-201ENST00000309859 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.972e-26■■■■■ 65.1
SRSF7Q16629 GGA2-210ENST00000567339 293 ntTSL 38.05□□□□□ -1.122e-26■■■■■ 65.1
SRSF7Q16629 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.193e-16■■■■■ 46.6
SRSF7Q16629 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.333e-16■■■■■ 46.6
SRSF7Q16629 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.333e-16■■■■■ 46.6
SRSF7Q16629 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.393e-16■■■■■ 46.6
SRSF7Q16629 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.463e-16■■■■■ 46.6
SRSF7Q16629 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.633e-16■■■■■ 46.6
SRSF7Q16629 ELOF1-207ENST00000591674 679 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.33e-16■■■■■ 46.6
SRSF7Q16629 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.038e-14■■■■■ 44.3
SRSF7Q16629 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.118e-14■■■■■ 44.3
SRSF7Q16629 PRKCB-210ENST00000498739 569 ntTSL 413.45□□□□□ -0.268e-14■■■■■ 44.3
SRSF7Q16629 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.568e-14■■■■■ 44.3
SRSF7Q16629 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.174e-7■■■■■ 43.8
SRSF7Q16629 ASGR1-207ENST00000574330 887 ntTSL 512.84□□□□□ -0.354e-7■■■■■ 43.8
SRSF7Q16629 ASGR1-203ENST00000570576 627 ntTSL 511.42□□□□□ -0.584e-7■■■■■ 43.8
SRSF7Q16629 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.057e-8■■■■■ 43.2
SRSF7Q16629 LINC00511-202ENST00000457958 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.677e-8■■■■■ 43.2
SRSF7Q16629 LINC00511-214ENST00000581801 379 ntTSL 38.68□□□□□ -1.027e-8■■■■■ 43.2
SRSF7Q16629 LINC00511-210ENST00000580861 467 ntTSL 47.22□□□□□ -1.257e-8■■■■■ 43.2
SRSF7Q16629 HDAC7-217ENST00000459625 6414 ntTSL 213.76□□□□□ -0.217e-21■■■■■ 43.1
SRSF7Q16629 HDAC7-219ENST00000470668 4266 ntTSL 211.72□□□□□ -0.537e-21■■■■■ 43.1
SRSF7Q16629 HDAC7-228ENST00000548938 2719 ntTSL 511.69□□□□□ -0.547e-21■■■■■ 43.1
SRSF7Q16629 HDAC7-201ENST00000080059 4095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.667e-21■■■■■ 43.1
SRSF7Q16629 HDAC7-202ENST00000354334 4065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.667e-21■■■■■ 43.1
SRSF7Q16629 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.513e-13■■■■■ 42.6
SRSF7Q16629 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.173e-7■■■■■ 42.4
SRSF7Q16629 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.955e-13■■■■■ 41.9
SRSF7Q16629 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.075e-13■■■■■ 41.9
SRSF7Q16629 AKAP17A-203ENST00000474361 3232 ntTSL 1 (best)15.49■□□□□ 0.075e-13■■■■■ 41.9
SRSF7Q16629 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.174e-25■■■■■ 41.5
SRSF7Q16629 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.354e-25■■■■■ 41.5
SRSF7Q16629 NDUFS2-203ENST00000465923 1193 ntTSL 311.61□□□□□ -0.554e-25■■■■■ 41.5
SRSF7Q16629 NDUFS2-205ENST00000468828 899 ntTSL 39.5□□□□□ -0.894e-25■■■■■ 41.5
SRSF7Q16629 NDUFS2-213ENST00000493849 910 ntTSL 34.61□□□□□ -1.674e-25■■■■■ 41.5
SRSF7Q16629 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.274e-7■■■■■ 41.4
SRSF7Q16629 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.544e-7■■■■■ 41.4
SRSF7Q16629 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.664e-7■■■■■ 41.4
SRSF7Q16629 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.258e-13■■■■■ 41.2
SRSF7Q16629 FGFR4-214ENST00000513166 594 ntTSL 417.22■□□□□ 0.353e-6■■■■■ 40.8
SRSF7Q16629 FGFR4-216ENST00000514472 552 ntTSL 417.07■□□□□ 0.323e-6■■■■■ 40.8
SRSF7Q16629 FGFR4-212ENST00000510911 709 ntTSL 416.67■□□□□ 0.263e-6■■■■■ 40.8
SRSF7Q16629 FGFR4-204ENST00000426612 712 ntTSL 1 (best)16.45■□□□□ 0.223e-6■■■■■ 40.8
SRSF7Q16629 FGFR4-209ENST00000507708 476 ntTSL 316.36■□□□□ 0.213e-6■■■■■ 40.8
SRSF7Q16629 FGFR4-211ENST00000509511 1341 ntTSL 1 (best)15.75■□□□□ 0.113e-6■■■■■ 40.8
SRSF7Q16629 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 03e-6■■■■■ 40.8
SRSF7Q16629 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.033e-6■■■■■ 40.8
SRSF7Q16629 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.093e-6■■■■■ 40.8
SRSF7Q16629 FGFR4-208ENST00000503708 770 ntTSL 414.38□□□□□ -0.113e-6■■■■■ 40.8
SRSF7Q16629 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.213e-6■■■■■ 40.8
SRSF7Q16629 FGFR4-205ENST00000430285 713 ntTSL 1 (best)13.27□□□□□ -0.293e-6■■■■■ 40.8
SRSF7Q16629 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.712e-11■■■■■ 40.5
SRSF7Q16629 SDF4-205ENST00000465727 2095 ntTSL 217.03■□□□□ 0.322e-11■■■■■ 40.5
SRSF7Q16629 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.042e-11■■■■■ 40.5
SRSF7Q16629 SDF4-203ENST00000403997 728 ntTSL 310.36□□□□□ -0.752e-11■■■■■ 40.5
SRSF7Q16629 ENPP1-204ENST00000513998 3107 ntTSL 517.2■□□□□ 0.344e-11■■■■■ 39.8
SRSF7Q16629 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.064e-11■■■■■ 39.8
SRSF7Q16629 HLF-207ENST00000573422 493 ntTSL 49.28□□□□□ -0.926e-8■■■■■ 39.7
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SRSF7Q16629 HLF-211ENST00000575868 558 ntTSL 44.46□□□□□ -1.76e-8■■■■■ 39.7
SRSF7Q16629 ASGR1-206ENST00000573596 2083 ntTSL 515.18■□□□□ 0.023e-7■■■■■ 39.4
SRSF7Q16629 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.022e-6■■■■■ 39.1
SRSF7Q16629 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.537e-8■■■■■ 38.9
SRSF7Q16629 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 17e-8■■■■■ 38.9
SRSF7Q16629 AGAP1-214ENST00000635100 2478 ntTSL 513.14□□□□□ -0.317e-8■■■■■ 38.9
SRSF7Q16629 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.547e-8■■■■■ 38.9
SRSF7Q16629 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.11e-6■■■■■ 38.7
SRSF7Q16629 CDK8-205ENST00000536792 3032 ntTSL 1 (best)13.64□□□□□ -0.231e-6■■■■■ 38.7
SRSF7Q16629 HNF4A-207ENST00000609262 540 ntTSL 1 (best)13.57□□□□□ -0.241e-7■■■■■ 38.7
SRSF7Q16629 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.375e-12■■■■■ 38.5
SRSF7Q16629 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.145e-12■■■■■ 38.5
SRSF7Q16629 RDX-211ENST00000530749 2558 ntTSL 218.4■□□□□ 0.545e-12■■■■■ 38.5
SRSF7Q16629 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.525e-12■■■■■ 38.5
SRSF7Q16629 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.375e-12■■■■■ 38.5
SRSF7Q16629 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.235e-12■■■■■ 38.5
SRSF7Q16629 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.445e-12■■■■■ 38.5
SRSF7Q16629 TTC28-201ENST00000397906 11795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.885e-12■■■■■ 38.5
SRSF7Q16629 RDX-203ENST00000527537 3403 ntTSL 1 (best)5.74□□□□□ -1.495e-12■■■■■ 38.5
SRSF7Q16629 RDX-213ENST00000532461 3286 ntTSL 1 (best)5.1□□□□□ -1.595e-12■■■■■ 38.5
SRSF7Q16629 ASGR2-206ENST00000576487 1055 ntTSL 1 (best)13.04□□□□□ -0.323e-7■■■■■ 38.3
SRSF7Q16629 ANP32E-204ENST00000532744 621 ntTSL 313.26□□□□□ -0.294e-13■■■■■ 38.2
SRSF7Q16629 MBNL2-206ENST00000469707 2574 ntTSL 1 (best)6.81□□□□□ -1.323e-7■■■■■ 38.2
SRSF7Q16629 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.533e-7■■■■■ 38.2
SRSF7Q16629 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.563e-7■■■■■ 38.2
SRSF7Q16629 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.613e-7■■■■■ 38.2
SRSF7Q16629 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.623e-7■■■■■ 38.2
SRSF7Q16629 C9orf3-212ENST00000468164 849 ntTSL 510.35□□□□□ -0.754e-10■■■■■ 38.2
SRSF7Q16629 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.271e-7■■■■■ 37.8
SRSF7Q16629 HNF4A-203ENST00000372920 3340 ntTSL 1 (best)15.48■□□□□ 0.071e-7■■■■■ 37.8
SRSF7Q16629 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.071e-7■■■■■ 37.8
SRSF7Q16629 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.341e-7■■■■■ 37.8
SRSF7Q16629 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.631e-7■■■■■ 37.8
SRSF7Q16629 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.831e-7■■■■■ 37.8
SRSF7Q16629 HNF4A-209ENST00000619550 4763 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.931e-7■■■■■ 37.8
SRSF7Q16629 HNF4A-201ENST00000316099 6445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.971e-7■■■■■ 37.8
SRSF7Q16629 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.752e-10■■■■■ 37.7
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