RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326153.9

GTPBP6-201, Transcript of GTP binding protein 6 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTPBP6, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP6-201ENST00000326153 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.52■■■■■ 5.2
GTPBP6-201ENST00000326153 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.68■■■■■ 4.26
GTPBP6-201ENST00000326153 ABCC9O60706 1549 aa39.89■■■■□ 3.98
GTPBP6-201ENST00000326153 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.83■■■■□ 3.97
GTPBP6-201ENST00000326153 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.3■■■■□ 3.88
GTPBP6-201ENST00000326153 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.24■■■■□ 3.87
GTPBP6-201ENST00000326153 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.05■■■■□ 3.84
GTPBP6-201ENST00000326153 NACADO15069 1562 aa38.94■■■■□ 3.82
GTPBP6-201ENST00000326153 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.78■■■■□ 3.8
GTPBP6-201ENST00000326153 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.71■■■■□ 3.79
GTPBP6-201ENST00000326153 SCRIBQ14160 1630 aa38.23■■■■□ 3.71
GTPBP6-201ENST00000326153 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.02■■■■□ 3.68
GTPBP6-201ENST00000326153 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.68■■■■□ 3.62
GTPBP6-201ENST00000326153 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.66■■■■□ 3.62
GTPBP6-201ENST00000326153 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.49■■■■□ 3.59
GTPBP6-201ENST00000326153 CECR2Q9BXF3 1484 aa37■■■■□ 3.51
GTPBP6-201ENST00000326153 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.71■■■■□ 3.47
GTPBP6-201ENST00000326153 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.7■■■■□ 3.46
GTPBP6-201ENST00000326153 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.65■■■■□ 3.46
GTPBP6-201ENST00000326153 SMARCA4P51532 1647 aa36.64■■■■□ 3.46
GTPBP6-201ENST00000326153 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.53■■■■□ 3.44
GTPBP6-201ENST00000326153 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.43■■■■□ 3.42
GTPBP6-201ENST00000326153 WIZO95785 1651 aa36.37■■■■□ 3.41
GTPBP6-201ENST00000326153 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.27■■■■□ 3.4
GTPBP6-201ENST00000326153 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.19■■■■□ 3.38
GTPBP6-201ENST00000326153 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.12■■■■□ 3.37
GTPBP6-201ENST00000326153 SMARCA2P51531 1590 aa36.09■■■■□ 3.37
GTPBP6-201ENST00000326153 NCAPD3P42695 1498 aa35.97■■■■□ 3.35
GTPBP6-201ENST00000326153 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.94■■■■□ 3.34
GTPBP6-201ENST00000326153 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.89■■■■□ 3.34
GTPBP6-201ENST00000326153 HMGXB3Q12766 1538 aa35.87■■■■□ 3.33
GTPBP6-201ENST00000326153 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.79■■■■□ 3.32
GTPBP6-201ENST00000326153 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.59■■■■□ 3.29
GTPBP6-201ENST00000326153 TRIM41Q8WV44 630 aa35.25■■■■□ 3.23
GTPBP6-201ENST00000326153 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.16■■■■□ 3.22
GTPBP6-201ENST00000326153 CFTRP13569 1480 aa35.02■■■■□ 3.2
GTPBP6-201ENST00000326153 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.98■■■■□ 3.19
GTPBP6-201ENST00000326153 NESP48681 1621 aa34.9■■■■□ 3.18
GTPBP6-201ENST00000326153 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.81■■■■□ 3.16
GTPBP6-201ENST00000326153 PRDM2Q13029 1718 aa34.78■■■■□ 3.16
GTPBP6-201ENST00000326153 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.76■■■■□ 3.15
GTPBP6-201ENST00000326153 ABCC8Q09428 1581 aa34.72■■■■□ 3.15
GTPBP6-201ENST00000326153 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.58■■■■□ 3.13
GTPBP6-201ENST00000326153 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.5■■■■□ 3.11
GTPBP6-201ENST00000326153 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.46■■■■□ 3.11
GTPBP6-201ENST00000326153 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.45■■■■□ 3.11
GTPBP6-201ENST00000326153 SYNJ1O43426 1573 aa34.41■■■■□ 3.1
GTPBP6-201ENST00000326153 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.39■■■■□ 3.1
GTPBP6-201ENST00000326153 CUX1P39880 1505 aa34.36■■■■□ 3.09
GTPBP6-201ENST00000326153 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.34■■■■□ 3.09
GTPBP6-201ENST00000326153 PCGF6Q9BYE7 350 aa34.34■■■■□ 3.09
GTPBP6-201ENST00000326153 TOP2BQ02880 1626 aa34.29■■■■□ 3.08
GTPBP6-201ENST00000326153 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.27■■■■□ 3.08
GTPBP6-201ENST00000326153 SOGA1O94964 1423 aa34.24■■■■□ 3.07
GTPBP6-201ENST00000326153 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.23■■■■□ 3.07
GTPBP6-201ENST00000326153 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.18■■■■□ 3.06
GTPBP6-201ENST00000326153 ERCC6Q03468 1493 aa34.17■■■■□ 3.06
GTPBP6-201ENST00000326153 TOPBP1Q92547 1522 aa34.17■■■■□ 3.06
GTPBP6-201ENST00000326153 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.12■■■■□ 3.05
GTPBP6-201ENST00000326153 EEA1Q15075 1411 aa34.11■■■■□ 3.05
GTPBP6-201ENST00000326153 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.1■■■■□ 3.05
GTPBP6-201ENST00000326153 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
GTPBP6-201ENST00000326153 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.03■■■■□ 3.04
GTPBP6-201ENST00000326153 WDR62O43379 1518 aa34.03■■■■□ 3.04
GTPBP6-201ENST00000326153 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP34.02■■■■□ 3.04
GTPBP6-201ENST00000326153 CSRNP3Q8WYN3 585 aa33.98■■■■□ 3.03
GTPBP6-201ENST00000326153 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.97■■■■□ 3.03
GTPBP6-201ENST00000326153 HRCP23327 699 aa33.93■■■■□ 3.02
GTPBP6-201ENST00000326153 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.85■■■■□ 3.01
GTPBP6-201ENST00000326153 CUX2O14529 1486 aa33.83■■■■□ 3.01
GTPBP6-201ENST00000326153 TNIKQ9UKE5 1360 aa33.82■■■■□ 3
GTPBP6-201ENST00000326153 GOLGA3Q08378 1498 aa33.76■■■□□ 2.99
GTPBP6-201ENST00000326153 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.75■■■□□ 2.99
GTPBP6-201ENST00000326153 CEP162Q5TB80 1403 aa33.74■■■□□ 2.99
GTPBP6-201ENST00000326153 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.73■■■□□ 2.99
GTPBP6-201ENST00000326153 WDR97A6NE52 1622 aa33.72■■■□□ 2.99
GTPBP6-201ENST00000326153 KIF21BO75037 1637 aa33.69■■■□□ 2.98
GTPBP6-201ENST00000326153 UBTFP17480 764 aaKnown RBP33.65■■■□□ 2.98
GTPBP6-201ENST00000326153 IFT140Q96RY7 1462 aa33.61■■■□□ 2.97
GTPBP6-201ENST00000326153 KIF27Q86VH2 1401 aa33.6■■■□□ 2.97
GTPBP6-201ENST00000326153 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.54■■■□□ 2.96
GTPBP6-201ENST00000326153 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.54■■■□□ 2.96
GTPBP6-201ENST00000326153 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.52■■■□□ 2.96
GTPBP6-201ENST00000326153 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP33.49■■■□□ 2.95
GTPBP6-201ENST00000326153 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.48■■■□□ 2.95
GTPBP6-201ENST00000326153 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.44■■■□□ 2.941e-7■■■■■ 40.2
GTPBP6-201ENST00000326153 IGF1RP08069 1367 aa33.44■■■□□ 2.94
GTPBP6-201ENST00000326153 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.42■■■□□ 2.94
GTPBP6-201ENST00000326153 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.38■■■□□ 2.93
GTPBP6-201ENST00000326153 PRXQ9BXM0 1461 aa33.35■■■□□ 2.93
GTPBP6-201ENST00000326153 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.31■■■□□ 2.92
GTPBP6-201ENST00000326153 PBRM1Q86U86 1689 aa33.3■■■□□ 2.92
GTPBP6-201ENST00000326153 CLIP1P30622 1438 aa33.29■■■□□ 2.92
GTPBP6-201ENST00000326153 GRIN2BQ13224 1484 aa33.24■■■□□ 2.91
GTPBP6-201ENST00000326153 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.2■■■□□ 2.91
GTPBP6-201ENST00000326153 CUL7Q14999 1698 aa33.18■■■□□ 2.9
GTPBP6-201ENST00000326153 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.11■■■□□ 2.89
GTPBP6-201ENST00000326153 ADAMTS12P58397 1594 aa33.11■■■□□ 2.89
GTPBP6-201ENST00000326153 VPS8Q8N3P4 1428 aa33.09■■■□□ 2.89
GTPBP6-201ENST00000326153 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP33.05■■■□□ 2.88
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