RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514472.1

FGFR4-216, Transcript of fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

TSL 4

Gene FGFR4, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4-216ENST00000514472 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.95■■■■■ 6.55
FGFR4-216ENST00000514472 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.2■■■■■ 5.63
FGFR4-216ENST00000514472 ABCC9O60706 1549 aa50.05■■■■■ 5.6
FGFR4-216ENST00000514472 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.71■■■■■ 5.23
FGFR4-216ENST00000514472 NACADO15069 1562 aa47.42■■■■■ 5.18
FGFR4-216ENST00000514472 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.08■■■■■ 5.13
FGFR4-216ENST00000514472 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.93■■■■■ 5.1
FGFR4-216ENST00000514472 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.82■■■■■ 5.09
FGFR4-216ENST00000514472 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.76■■■■■ 5.08
FGFR4-216ENST00000514472 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.6■■■■■ 5.05
FGFR4-216ENST00000514472 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.38■■■■■ 5.02
FGFR4-216ENST00000514472 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.37■■■■■ 5.01
FGFR4-216ENST00000514472 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.25■■■■■ 4.99
FGFR4-216ENST00000514472 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.71■■■■■ 4.91
FGFR4-216ENST00000514472 SCRIBQ14160 1630 aa45.69■■■■■ 4.9
FGFR4-216ENST00000514472 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.26■■■■■ 4.84
FGFR4-216ENST00000514472 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.18■■■■■ 4.82
FGFR4-216ENST00000514472 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.08■■■■■ 4.81
FGFR4-216ENST00000514472 NCAPD3P42695 1498 aa43.78■■■■■ 4.6
FGFR4-216ENST00000514472 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.64■■■■■ 4.58
FGFR4-216ENST00000514472 SMARCA4P51532 1647 aa43.63■■■■■ 4.58
FGFR4-216ENST00000514472 SMARCA2P51531 1590 aa43.52■■■■■ 4.56
FGFR4-216ENST00000514472 HMGXB3Q12766 1538 aa43.46■■■■■ 4.55
FGFR4-216ENST00000514472 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.41■■■■■ 4.54
FGFR4-216ENST00000514472 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.25■■■■■ 4.51
FGFR4-216ENST00000514472 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.19■■■■■ 4.51
FGFR4-216ENST00000514472 ERCC6Q03468 1493 aa43.17■■■■■ 4.5
FGFR4-216ENST00000514472 CUX2O14529 1486 aa43.13■■■■■ 4.49
FGFR4-216ENST00000514472 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.11■■■■■ 4.49
FGFR4-216ENST00000514472 NESP48681 1621 aa43.04■■■■■ 4.48
FGFR4-216ENST00000514472 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.02■■■■■ 4.48
FGFR4-216ENST00000514472 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.78■■■■■ 4.44
FGFR4-216ENST00000514472 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.62■■■■■ 4.41
FGFR4-216ENST00000514472 WIZO95785 1651 aa42.62■■■■■ 4.41
FGFR4-216ENST00000514472 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.55■■■■■ 4.4
FGFR4-216ENST00000514472 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.48■■■■■ 4.39
FGFR4-216ENST00000514472 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.42■■■■■ 4.38
FGFR4-216ENST00000514472 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.24■■■■■ 4.35
FGFR4-216ENST00000514472 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.12■■■■■ 4.33
FGFR4-216ENST00000514472 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.05■■■■■ 4.32
FGFR4-216ENST00000514472 WDR62O43379 1518 aa42.05■■■■■ 4.32
FGFR4-216ENST00000514472 CFTRP13569 1480 aa41.98■■■■■ 4.31
FGFR4-216ENST00000514472 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.96■■■■■ 4.31
FGFR4-216ENST00000514472 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.93■■■■■ 4.3
FGFR4-216ENST00000514472 PRDM2Q13029 1718 aa41.66■■■■■ 4.26
FGFR4-216ENST00000514472 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.61■■■■■ 4.25
FGFR4-216ENST00000514472 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.59■■■■■ 4.25
FGFR4-216ENST00000514472 TOPBP1Q92547 1522 aa41.17■■■■■ 4.18
FGFR4-216ENST00000514472 OSCARQ8IYS5 282 aa41.15■■■■■ 4.18
FGFR4-216ENST00000514472 IFT140Q96RY7 1462 aa41.13■■■■■ 4.17
FGFR4-216ENST00000514472 TRIM41Q8WV44 630 aa41.09■■■■■ 4.17
FGFR4-216ENST00000514472 ABCC8Q09428 1581 aa41.08■■■■■ 4.17
FGFR4-216ENST00000514472 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.07■■■■■ 4.16
FGFR4-216ENST00000514472 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.02■■■■■ 4.16
FGFR4-216ENST00000514472 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.86■■■■■ 4.13
FGFR4-216ENST00000514472 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.84■■■■■ 4.13
FGFR4-216ENST00000514472 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.75■■■■■ 4.11
FGFR4-216ENST00000514472 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.7■■■■■ 4.119e-11■■■■■ 80
FGFR4-216ENST00000514472 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.65■■■■■ 4.1
FGFR4-216ENST00000514472 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.65■■■■■ 4.1
FGFR4-216ENST00000514472 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.65■■■■■ 4.1
FGFR4-216ENST00000514472 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.59■■■■■ 4.09
FGFR4-216ENST00000514472 CHD1O14646 1710 aa40.58■■■■■ 4.09
FGFR4-216ENST00000514472 SOGA1O94964 1423 aa40.55■■■■■ 4.08
FGFR4-216ENST00000514472 ARHGEF11O15085 1522 aa40.51■■■■■ 4.08
FGFR4-216ENST00000514472 CUX1P39880 1505 aa40.49■■■■■ 4.07
FGFR4-216ENST00000514472 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.49■■■■■ 4.07
FGFR4-216ENST00000514472 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.45■■■■■ 4.07
FGFR4-216ENST00000514472 WDR97A6NE52 1622 aa40.42■■■■■ 4.06
FGFR4-216ENST00000514472 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.35■■■■■ 4.05
FGFR4-216ENST00000514472 FBLN2P98095 1184 aa40.35■■■■■ 4.05
FGFR4-216ENST00000514472 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.27■■■■■ 4.04
FGFR4-216ENST00000514472 GRIN2BQ13224 1484 aa40.19■■■■■ 4.02
FGFR4-216ENST00000514472 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.19■■■■■ 4.02
FGFR4-216ENST00000514472 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.17■■■■■ 4.02
FGFR4-216ENST00000514472 ARAP1Q96P48 1450 aa40.12■■■■■ 4.01
FGFR4-216ENST00000514472 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.1■■■■■ 4.01
FGFR4-216ENST00000514472 PBRM1Q86U86 1689 aa40.1■■■■■ 4.01
FGFR4-216ENST00000514472 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.1■■■■■ 4.01
FGFR4-216ENST00000514472 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.07■■■■■ 4
FGFR4-216ENST00000514472 SYNJ2O15056 1496 aa40.06■■■■■ 4
FGFR4-216ENST00000514472 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.06■■■■■ 4
FGFR4-216ENST00000514472 SYNJ1O43426 1573 aa40.04■■■■■ 4
FGFR4-216ENST00000514472 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.02■■■■■ 4
FGFR4-216ENST00000514472 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.91■■■■□ 3.98
FGFR4-216ENST00000514472 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.89■■■■□ 3.98
FGFR4-216ENST00000514472 TOP2BQ02880 1626 aa39.88■■■■□ 3.97
FGFR4-216ENST00000514472 GRIN2AQ12879 1464 aa39.68■■■■□ 3.94
FGFR4-216ENST00000514472 ADAMTS12P58397 1594 aa39.67■■■■□ 3.94
FGFR4-216ENST00000514472 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.66■■■■□ 3.94
FGFR4-216ENST00000514472 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.56■■■■□ 3.92
FGFR4-216ENST00000514472 CEP170Q5SW79 1584 aa39.56■■■■□ 3.92
FGFR4-216ENST00000514472 NUP160Q12769 1436 aa39.56■■■■□ 3.92
FGFR4-216ENST00000514472 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.55■■■■□ 3.92
FGFR4-216ENST00000514472 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.47■■■■□ 3.91
FGFR4-216ENST00000514472 SHROOM2Q13796 1616 aa39.42■■■■□ 3.9
FGFR4-216ENST00000514472 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.14■■■■□ 3.86
FGFR4-216ENST00000514472 JPH4Q96JJ6 628 aa39.14■■■■□ 3.86
FGFR4-216ENST00000514472 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.12■■■■□ 3.85
FGFR4-216ENST00000514472 IGF1RP08069 1367 aa39.08■■■■□ 3.85
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