Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC13.84□□□□□ -0.191e-323■■■■□ 26.4
SRSF7Q16629 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC13.64□□□□□ -0.231e-323■■■■□ 26.4
SRSF7Q16629 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.321e-323■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 MALAT1-201ENST00000508832 1519 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.141e-323■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.551e-323■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.561e-323■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.671e-323■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.08□□□□□ -2.082e-77■■■■□ 20.9
SRSF7Q16629 MALAT1-202ENST00000534336 8708 ntBASIC7.63□□□□□ -1.191e-54■■□□□ 12.2
SRSF7Q16629 MALAT1-208ENST00000616527 572 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.333e-54■□□□□ 10.3
SRSF7Q16629 MALAT1-212ENST00000618132 725 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.363e-54■■□□□ 12.9
SRSF7Q16629 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.784e-54■■□□□ 12.9
SRSF7Q16629 MALAT1-216ENST00000620465 333 ntTSL 23.87□□□□□ -1.796e-54■□□□□ 10.3
SRSF7Q16629 TRRAP-203ENST00000417523 550 ntTSL 412.73□□□□□ -0.373e-46■■■■□ 23.5
SRSF7Q16629 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.43e-46■■■■□ 23.5
SRSF7Q16629 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.413e-46■■■■□ 23.5
SRSF7Q16629 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.443e-46■■■■□ 23.5
SRSF7Q16629 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.573e-46■■■■□ 23.5
SRSF7Q16629 SLC17A9-206ENST00000487303 507 ntTSL 212.94□□□□□ -0.344e-36■■□□□ 13.6
SRSF7Q16629 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC11.94□□□□□ -0.55e-36■■■■□ 22.2
SRSF7Q16629 HSP90AA1-203ENST00000553585 581 ntTSL 35.39□□□□□ -1.557e-34■■□□□ 12.7
SRSF7Q16629 HSP90AA1-205ENST00000555662 429 ntTSL 24.12□□□□□ -1.757e-34■□□□□ 8.1
SRSF7Q16629 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.428e-34■□□□□ 8.1
SRSF7Q16629 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.048e-34■□□□□ 8.1
SRSF7Q16629 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.398e-34■□□□□ 8.1
SRSF7Q16629 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.628e-34■□□□□ 8.1
SRSF7Q16629 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.14□□□□□ -1.753e-32■■■■□ 25.6
SRSF7Q16629 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.73e-31■■■□□ 14.9
SRSF7Q16629 ASPSCR1-220ENST00000585140 447 ntTSL 314.22□□□□□ -0.132e-28■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 ASPSCR1-214ENST00000582404 534 ntTSL 313.44□□□□□ -0.262e-28■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 ASPSCR1-206ENST00000578361 590 ntTSL 211.51□□□□□ -0.572e-28■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 ASPSCR1-217ENST00000583693 3976 ntTSL 210.72□□□□□ -0.692e-28■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 ASPSCR1-215ENST00000583142 532 ntTSL 38.65□□□□□ -1.022e-28■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.551e-27■□□□□ 10.9
SRSF7Q16629 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.121e-27■■■□□ 15.6
SRSF7Q16629 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.42e-26■■■■■ 65.1
SRSF7Q16629 GGA2-208ENST00000566685 571 ntTSL 413.14□□□□□ -0.312e-26■■■■■ 65.1
SRSF7Q16629 GGA2-213ENST00000568922 1807 ntTSL 210.62□□□□□ -0.712e-26■■■■■ 65.1
SRSF7Q16629 GGA2-201ENST00000309859 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.972e-26■■■■■ 65.1
SRSF7Q16629 GGA2-210ENST00000567339 293 ntTSL 38.05□□□□□ -1.122e-26■■■■■ 65.1
SRSF7Q16629 FUS-209ENST00000566605 1787 ntTSL 1 (best)22.1■■□□□ 1.132e-25■■□□□ 14
SRSF7Q16629 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.912e-25■■□□□ 14
SRSF7Q16629 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.512e-25■■□□□ 14
SRSF7Q16629 FUS-203ENST00000474990 827 ntTSL 317.45■□□□□ 0.382e-25■■□□□ 14
SRSF7Q16629 FUS-213ENST00000570090 544 ntTSL 213.85□□□□□ -0.192e-25■■□□□ 14
SRSF7Q16629 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.372e-25■■□□□ 14
SRSF7Q16629 FUS-206ENST00000487509 4920 ntTSL 211.21□□□□□ -0.612e-25■■□□□ 14
SRSF7Q16629 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.223e-25■■□□□ 13.3
SRSF7Q16629 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.033e-25■■□□□ 13.3
SRSF7Q16629 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.033e-25■■□□□ 13.3
SRSF7Q16629 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.223e-25■■□□□ 13.3
SRSF7Q16629 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.253e-25■■□□□ 13.3
SRSF7Q16629 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.373e-25■■□□□ 13.3
SRSF7Q16629 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.513e-25■■□□□ 13.3
SRSF7Q16629 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.174e-25■■■■■ 41.5
SRSF7Q16629 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.354e-25■■■■■ 41.5
SRSF7Q16629 NDUFS2-203ENST00000465923 1193 ntTSL 311.61□□□□□ -0.554e-25■■■■■ 41.5
SRSF7Q16629 NDUFS2-205ENST00000468828 899 ntTSL 39.5□□□□□ -0.894e-25■■■■■ 41.5
SRSF7Q16629 NDUFS2-213ENST00000493849 910 ntTSL 34.61□□□□□ -1.674e-25■■■■■ 41.5
SRSF7Q16629 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.412e-24■■■■■ 28.4
SRSF7Q16629 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.472e-24■■■■■ 28.4
SRSF7Q16629 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.472e-24■■■■■ 28.4
SRSF7Q16629 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.472e-24■■■■■ 28.4
SRSF7Q16629 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.522e-24■■■■■ 28.4
SRSF7Q16629 MLXIPL-202ENST00000345114 3079 ntTSL 1 (best)11.2□□□□□ -0.622e-24■■■■■ 28.4
SRSF7Q16629 ASPSCR1-210ENST00000581608 2387 ntTSL 217.51■□□□□ 0.392e-24■□□□□ 10.4
SRSF7Q16629 ASPSCR1-221ENST00000585274 984 ntTSL 514.17□□□□□ -0.142e-24■□□□□ 10.4
SRSF7Q16629 ASPSCR1-218ENST00000583744 539 ntTSL 411.84□□□□□ -0.512e-24■□□□□ 10.4
SRSF7Q16629 ASPSCR1-205ENST00000578236 3277 ntTSL 211.15□□□□□ -0.632e-24■□□□□ 10.4
SRSF7Q16629 SCARNA9-201ENST00000530422 353 ntBASIC6.75□□□□□ -1.333e-24■■■■□ 24.7
SRSF7Q16629 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.673e-24■■■■□ 24.7
SRSF7Q16629 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.823e-24■■■■□ 24.7
SRSF7Q16629 CEP295-203ENST00000530425 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 42.93□□□□□ -1.943e-24■■■■□ 24.7
SRSF7Q16629 FKBP10-207ENST00000490938 837 ntTSL 212.41□□□□□ -0.423e-23■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.474e-23■■■■■ 30.6
SRSF7Q16629 HMGB2-205ENST00000511316 1841 ntTSL 211.1□□□□□ -0.634e-23■■■■■ 30.6
SRSF7Q16629 HMGB2-201ENST00000296503 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.874e-23■■■■■ 30.6
SRSF7Q16629 HMGB2-202ENST00000438704 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.374e-23■■■■■ 30.6
SRSF7Q16629 MLLT6-208ENST00000619356 3868 ntTSL 1 (best)12.26□□□□□ -0.451e-22■■□□□ 12.2
SRSF7Q16629 MLLT6-205ENST00000615741 2937 nt11.56□□□□□ -0.561e-22■■□□□ 12.2
SRSF7Q16629 MLLT6-204ENST00000615441 395 ntTSL 310.04□□□□□ -0.81e-22■■□□□ 12.2
SRSF7Q16629 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.121e-21■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 GMPR-203ENST00000543191 675 ntTSL 28.17□□□□□ -1.11e-21■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 MGAT5-201ENST00000281923 8144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.213e-21■■■■□ 19.8
SRSF7Q16629 MGAT5-202ENST00000409645 8252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.273e-21■■■■□ 19.8
SRSF7Q16629 HDAC7-217ENST00000459625 6414 ntTSL 213.76□□□□□ -0.217e-21■■■■■ 43.1
SRSF7Q16629 HDAC7-219ENST00000470668 4266 ntTSL 211.72□□□□□ -0.537e-21■■■■■ 43.1
SRSF7Q16629 HDAC7-228ENST00000548938 2719 ntTSL 511.69□□□□□ -0.547e-21■■■■■ 43.1
SRSF7Q16629 HDAC7-201ENST00000080059 4095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.667e-21■■■■■ 43.1
SRSF7Q16629 HDAC7-202ENST00000354334 4065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.667e-21■■■■■ 43.1
SRSF7Q16629 BHLHE40-201ENST00000256495 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.761e-20■■■■■ 32.4
SRSF7Q16629 NAP1L1-220ENST00000551524 460 ntTSL 26.19□□□□□ -1.423e-20■■□□□ 12.1
SRSF7Q16629 HNRNPU-217ENST00000638952 5678 ntTSL 514.21□□□□□ -0.137e-20■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 HNRNPU-228ENST00000640306 2917 ntTSL 514□□□□□ -0.177e-20■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 HNRNPU-209ENST00000476241 4844 ntTSL 513.59□□□□□ -0.237e-20■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.237e-20■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.37e-20■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.357e-20■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 HNRNPU-214ENST00000638475 2698 ntTSL 512.44□□□□□ -0.427e-20■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.447e-20■□□□□ 8.9
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