Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CACNA1EQ15878 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CACNA1EQ15878 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CACNA1EQ15878 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CACNA1EQ15878 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CACNA1EQ15878 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CACNA1EQ15878 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CACNA1EQ15878 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
CACNA1EQ15878 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CACNA1EQ15878 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CACNA1EQ15878 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CACNA1EQ15878 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CACNA1EQ15878 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CACNA1EQ15878 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CACNA1EQ15878 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CACNA1EQ15878 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CACNA1EQ15878 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CACNA1EQ15878 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CACNA1EQ15878 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CACNA1EQ15878 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CACNA1EQ15878 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CACNA1EQ15878 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CACNA1EQ15878 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CACNA1EQ15878 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CACNA1EQ15878 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CACNA1EQ15878 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CACNA1EQ15878 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CACNA1EQ15878 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CACNA1EQ15878 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CACNA1EQ15878 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CACNA1EQ15878 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CACNA1EQ15878 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CACNA1EQ15878 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
CACNA1EQ15878 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
CACNA1EQ15878 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CACNA1EQ15878 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CACNA1EQ15878 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
CACNA1EQ15878 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CACNA1EQ15878 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CACNA1EQ15878 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CACNA1EQ15878 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CACNA1EQ15878 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CACNA1EQ15878 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CACNA1EQ15878 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CACNA1EQ15878 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CACNA1EQ15878 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CACNA1EQ15878 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CACNA1EQ15878 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CACNA1EQ15878 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CACNA1EQ15878 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CACNA1EQ15878 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CACNA1EQ15878 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CACNA1EQ15878 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CACNA1EQ15878 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CACNA1EQ15878 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CACNA1EQ15878 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CACNA1EQ15878 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CACNA1EQ15878 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CACNA1EQ15878 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CACNA1EQ15878 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CACNA1EQ15878 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CACNA1EQ15878 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CACNA1EQ15878 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CACNA1EQ15878 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CACNA1EQ15878 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CACNA1EQ15878 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CACNA1EQ15878 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CACNA1EQ15878 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CACNA1EQ15878 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CACNA1EQ15878 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CACNA1EQ15878 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CACNA1EQ15878 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CACNA1EQ15878 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CACNA1EQ15878 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CACNA1EQ15878 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CACNA1EQ15878 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CACNA1EQ15878 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CACNA1EQ15878 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CACNA1EQ15878 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CACNA1EQ15878 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CACNA1EQ15878 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CACNA1EQ15878 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CACNA1EQ15878 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CACNA1EQ15878 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CACNA1EQ15878 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CACNA1EQ15878 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CACNA1EQ15878 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CACNA1EQ15878 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CACNA1EQ15878 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CACNA1EQ15878 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CACNA1EQ15878 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CACNA1EQ15878 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CACNA1EQ15878 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CACNA1EQ15878 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CACNA1EQ15878 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CACNA1EQ15878 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CACNA1EQ15878 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CACNA1EQ15878 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CACNA1EQ15878 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CACNA1EQ15878 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms