Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.04■■■■□ 3.68
SCN5AQ14524 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.65■■■■□ 3.62
SCN5AQ14524 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
SCN5AQ14524 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
SCN5AQ14524 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SCN5AQ14524 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SCN5AQ14524 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SCN5AQ14524 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
SCN5AQ14524 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SCN5AQ14524 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SCN5AQ14524 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SCN5AQ14524 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
SCN5AQ14524 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
SCN5AQ14524 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
SCN5AQ14524 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
SCN5AQ14524 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
SCN5AQ14524 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SCN5AQ14524 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
SCN5AQ14524 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SCN5AQ14524 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SCN5AQ14524 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SCN5AQ14524 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
SCN5AQ14524 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SCN5AQ14524 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SCN5AQ14524 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SCN5AQ14524 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
SCN5AQ14524 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SCN5AQ14524 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SCN5AQ14524 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
SCN5AQ14524 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
SCN5AQ14524 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
SCN5AQ14524 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SCN5AQ14524 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
SCN5AQ14524 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SCN5AQ14524 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
SCN5AQ14524 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SCN5AQ14524 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
SCN5AQ14524 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SCN5AQ14524 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SCN5AQ14524 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SCN5AQ14524 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SCN5AQ14524 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SCN5AQ14524 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
SCN5AQ14524 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SCN5AQ14524 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SCN5AQ14524 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SCN5AQ14524 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SCN5AQ14524 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SCN5AQ14524 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SCN5AQ14524 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SCN5AQ14524 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SCN5AQ14524 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SCN5AQ14524 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SCN5AQ14524 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
SCN5AQ14524 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
SCN5AQ14524 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SCN5AQ14524 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SCN5AQ14524 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SCN5AQ14524 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SCN5AQ14524 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SCN5AQ14524 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SCN5AQ14524 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SCN5AQ14524 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SCN5AQ14524 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SCN5AQ14524 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SCN5AQ14524 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SCN5AQ14524 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SCN5AQ14524 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SCN5AQ14524 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SCN5AQ14524 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SCN5AQ14524 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SCN5AQ14524 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SCN5AQ14524 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SCN5AQ14524 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SCN5AQ14524 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SCN5AQ14524 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SCN5AQ14524 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SCN5AQ14524 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SCN5AQ14524 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SCN5AQ14524 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
SCN5AQ14524 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SCN5AQ14524 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SCN5AQ14524 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SCN5AQ14524 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SCN5AQ14524 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SCN5AQ14524 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SCN5AQ14524 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SCN5AQ14524 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SCN5AQ14524 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SCN5AQ14524 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SCN5AQ14524 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SCN5AQ14524 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SCN5AQ14524 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SCN5AQ14524 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SCN5AQ14524 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SCN5AQ14524 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SCN5AQ14524 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.78
SCN5AQ14524 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SCN5AQ14524 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SCN5AQ14524 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
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