Protein–RNA interactions for Protein: Q13228

SELENBP1, Selenium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENBP1Q13228 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SELENBP1Q13228 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SELENBP1Q13228 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SELENBP1Q13228 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
SELENBP1Q13228 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SELENBP1Q13228 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SELENBP1Q13228 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SELENBP1Q13228 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SELENBP1Q13228 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SELENBP1Q13228 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SELENBP1Q13228 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SELENBP1Q13228 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SELENBP1Q13228 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SELENBP1Q13228 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SELENBP1Q13228 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SELENBP1Q13228 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SELENBP1Q13228 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SELENBP1Q13228 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SELENBP1Q13228 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SELENBP1Q13228 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SELENBP1Q13228 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SELENBP1Q13228 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SELENBP1Q13228 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SELENBP1Q13228 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SELENBP1Q13228 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SELENBP1Q13228 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SELENBP1Q13228 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SELENBP1Q13228 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SELENBP1Q13228 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SELENBP1Q13228 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SELENBP1Q13228 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SELENBP1Q13228 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SELENBP1Q13228 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SELENBP1Q13228 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SELENBP1Q13228 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SELENBP1Q13228 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SELENBP1Q13228 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SELENBP1Q13228 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SELENBP1Q13228 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SELENBP1Q13228 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SELENBP1Q13228 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SELENBP1Q13228 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SELENBP1Q13228 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SELENBP1Q13228 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SELENBP1Q13228 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SELENBP1Q13228 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SELENBP1Q13228 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SELENBP1Q13228 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SELENBP1Q13228 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SELENBP1Q13228 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SELENBP1Q13228 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SELENBP1Q13228 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SELENBP1Q13228 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SELENBP1Q13228 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SELENBP1Q13228 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SELENBP1Q13228 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SELENBP1Q13228 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SELENBP1Q13228 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SELENBP1Q13228 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SELENBP1Q13228 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SELENBP1Q13228 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SELENBP1Q13228 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SELENBP1Q13228 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SELENBP1Q13228 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SELENBP1Q13228 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SELENBP1Q13228 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SELENBP1Q13228 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SELENBP1Q13228 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SELENBP1Q13228 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SELENBP1Q13228 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SELENBP1Q13228 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SELENBP1Q13228 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SELENBP1Q13228 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SELENBP1Q13228 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SELENBP1Q13228 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SELENBP1Q13228 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SELENBP1Q13228 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SELENBP1Q13228 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SELENBP1Q13228 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SELENBP1Q13228 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SELENBP1Q13228 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SELENBP1Q13228 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SELENBP1Q13228 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SELENBP1Q13228 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SELENBP1Q13228 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SELENBP1Q13228 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SELENBP1Q13228 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SELENBP1Q13228 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SELENBP1Q13228 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SELENBP1Q13228 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SELENBP1Q13228 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SELENBP1Q13228 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SELENBP1Q13228 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SELENBP1Q13228 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SELENBP1Q13228 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SELENBP1Q13228 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SELENBP1Q13228 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SELENBP1Q13228 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SELENBP1Q13228 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SELENBP1Q13228 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
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