Protein–RNA interactions for Protein: P46013

MKI67, Proliferation marker protein Ki-67, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKI67P46013 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC39.33■■■■□ 3.89
MKI67P46013 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.01■■■■□ 3.84
MKI67P46013 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.7■■■■□ 3.79
MKI67P46013 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
MKI67P46013 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
MKI67P46013 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
MKI67P46013 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
MKI67P46013 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
MKI67P46013 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
MKI67P46013 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
MKI67P46013 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
MKI67P46013 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
MKI67P46013 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
MKI67P46013 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
MKI67P46013 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
MKI67P46013 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
MKI67P46013 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
MKI67P46013 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
MKI67P46013 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
MKI67P46013 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
MKI67P46013 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
MKI67P46013 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
MKI67P46013 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
MKI67P46013 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
MKI67P46013 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
MKI67P46013 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
MKI67P46013 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
MKI67P46013 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
MKI67P46013 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
MKI67P46013 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
MKI67P46013 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
MKI67P46013 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.29
MKI67P46013 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
MKI67P46013 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
MKI67P46013 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
MKI67P46013 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
MKI67P46013 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
MKI67P46013 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
MKI67P46013 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
MKI67P46013 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
MKI67P46013 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
MKI67P46013 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
MKI67P46013 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC34.93■■■■□ 3.18
MKI67P46013 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
MKI67P46013 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
MKI67P46013 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
MKI67P46013 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
MKI67P46013 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
MKI67P46013 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
MKI67P46013 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
MKI67P46013 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
MKI67P46013 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
MKI67P46013 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
MKI67P46013 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
MKI67P46013 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
MKI67P46013 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
MKI67P46013 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
MKI67P46013 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
MKI67P46013 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
MKI67P46013 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
MKI67P46013 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
MKI67P46013 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
MKI67P46013 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
MKI67P46013 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
MKI67P46013 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
MKI67P46013 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
MKI67P46013 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
MKI67P46013 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
MKI67P46013 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
MKI67P46013 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
MKI67P46013 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
MKI67P46013 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
MKI67P46013 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
MKI67P46013 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
MKI67P46013 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
MKI67P46013 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
MKI67P46013 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
MKI67P46013 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
MKI67P46013 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
MKI67P46013 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
MKI67P46013 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
MKI67P46013 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
MKI67P46013 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
MKI67P46013 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
MKI67P46013 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
MKI67P46013 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
MKI67P46013 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
MKI67P46013 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
MKI67P46013 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
MKI67P46013 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
MKI67P46013 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
MKI67P46013 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
MKI67P46013 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
MKI67P46013 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
MKI67P46013 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
MKI67P46013 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC33.79■■■■□ 3
MKI67P46013 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
MKI67P46013 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
MKI67P46013 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
MKI67P46013 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms