Protein–RNA interactions for Protein: O95405

ZFYVE9, Zinc finger FYVE domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE9O95405 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC50.09■■■■■ 5.61
ZFYVE9O95405 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC49.8■■■■■ 5.56
ZFYVE9O95405 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC49.1■■■■■ 5.45
ZFYVE9O95405 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.93■■■■■ 5.42
ZFYVE9O95405 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.42■■■■■ 5.34
ZFYVE9O95405 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.07■■■■■ 5.28
ZFYVE9O95405 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.92■■■■■ 5.26
ZFYVE9O95405 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC47.66■■■■■ 5.22
ZFYVE9O95405 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.57■■■■■ 5.21
ZFYVE9O95405 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC47.4■■■■■ 5.18
ZFYVE9O95405 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC47.27■■■■■ 5.16
ZFYVE9O95405 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.27■■■■■ 5.16
ZFYVE9O95405 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC47.26■■■■■ 5.16
ZFYVE9O95405 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC47.11■■■■■ 5.13
ZFYVE9O95405 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.79■■■■■ 5.08
ZFYVE9O95405 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.72■■■■■ 5.07
ZFYVE9O95405 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.66■■■■■ 5.06
ZFYVE9O95405 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.59■■■■■ 5.05
ZFYVE9O95405 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
ZFYVE9O95405 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC46.19■■■■■ 4.98
ZFYVE9O95405 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
ZFYVE9O95405 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
ZFYVE9O95405 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.95■■■■■ 4.95
ZFYVE9O95405 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.94■■■■■ 4.94
ZFYVE9O95405 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC45.91■■■■■ 4.94
ZFYVE9O95405 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
ZFYVE9O95405 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.93
ZFYVE9O95405 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC45.74■■■■■ 4.91
ZFYVE9O95405 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC45.7■■■■■ 4.91
ZFYVE9O95405 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
ZFYVE9O95405 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.66■■■■■ 4.9
ZFYVE9O95405 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC45.43■■■■■ 4.86
ZFYVE9O95405 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC45.35■■■■■ 4.85
ZFYVE9O95405 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC45.35■■■■■ 4.85
ZFYVE9O95405 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC45.31■■■■■ 4.84
ZFYVE9O95405 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC45.01■■■■■ 4.8
ZFYVE9O95405 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC44.93■■■■■ 4.78
ZFYVE9O95405 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
ZFYVE9O95405 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
ZFYVE9O95405 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
ZFYVE9O95405 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC44.59■■■■■ 4.73
ZFYVE9O95405 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
ZFYVE9O95405 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
ZFYVE9O95405 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC44.26■■■■■ 4.68
ZFYVE9O95405 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
ZFYVE9O95405 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
ZFYVE9O95405 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
ZFYVE9O95405 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC44.1■■■■■ 4.65
ZFYVE9O95405 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC44.05■■■■■ 4.64
ZFYVE9O95405 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
ZFYVE9O95405 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC43.98■■■■■ 4.63
ZFYVE9O95405 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
ZFYVE9O95405 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC43.9■■■■■ 4.62
ZFYVE9O95405 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
ZFYVE9O95405 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC43.85■■■■■ 4.61
ZFYVE9O95405 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.84■■■■■ 4.61
ZFYVE9O95405 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
ZFYVE9O95405 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
ZFYVE9O95405 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
ZFYVE9O95405 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC43.71■■■■■ 4.59
ZFYVE9O95405 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
ZFYVE9O95405 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC43.66■■■■■ 4.58
ZFYVE9O95405 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC43.64■■■■■ 4.58
ZFYVE9O95405 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
ZFYVE9O95405 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
ZFYVE9O95405 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.38■■■■■ 4.53
ZFYVE9O95405 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC43.38■■■■■ 4.53
ZFYVE9O95405 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.37■■■■■ 4.53
ZFYVE9O95405 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
ZFYVE9O95405 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
ZFYVE9O95405 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
ZFYVE9O95405 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
ZFYVE9O95405 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.22■■■■■ 4.51
ZFYVE9O95405 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
ZFYVE9O95405 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
ZFYVE9O95405 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC43.15■■■■■ 4.5
ZFYVE9O95405 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
ZFYVE9O95405 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC43.15■■■■■ 4.5
ZFYVE9O95405 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
ZFYVE9O95405 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC43.13■■■■■ 4.49
ZFYVE9O95405 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
ZFYVE9O95405 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC43.1■■■■■ 4.49
ZFYVE9O95405 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
ZFYVE9O95405 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC43.03■■■■■ 4.48
ZFYVE9O95405 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
ZFYVE9O95405 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC42.98■■■■■ 4.47
ZFYVE9O95405 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
ZFYVE9O95405 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
ZFYVE9O95405 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC42.85■■■■■ 4.45
ZFYVE9O95405 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC42.81■■■■■ 4.44
ZFYVE9O95405 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC42.79■■■■■ 4.44
ZFYVE9O95405 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.78■■■■■ 4.44
ZFYVE9O95405 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.77■■■■■ 4.44
ZFYVE9O95405 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC42.74■■■■■ 4.43
ZFYVE9O95405 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.73■■■■■ 4.43
ZFYVE9O95405 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
ZFYVE9O95405 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC42.7■■■■■ 4.43
ZFYVE9O95405 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC42.7■■■■■ 4.43
ZFYVE9O95405 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
ZFYVE9O95405 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms