Protein–RNA interactions for Protein: O75665

OFD1, Oral-facial-digital syndrome 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OFD1O75665 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC38.46■■■■□ 3.75
OFD1O75665 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.46■■■■□ 3.59
OFD1O75665 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC37.42■■■■□ 3.58
OFD1O75665 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
OFD1O75665 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
OFD1O75665 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
OFD1O75665 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
OFD1O75665 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
OFD1O75665 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
OFD1O75665 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
OFD1O75665 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
OFD1O75665 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
OFD1O75665 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
OFD1O75665 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
OFD1O75665 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
OFD1O75665 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
OFD1O75665 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
OFD1O75665 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
OFD1O75665 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
OFD1O75665 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
OFD1O75665 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
OFD1O75665 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
OFD1O75665 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
OFD1O75665 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
OFD1O75665 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
OFD1O75665 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
OFD1O75665 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
OFD1O75665 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
OFD1O75665 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
OFD1O75665 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
OFD1O75665 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
OFD1O75665 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
OFD1O75665 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
OFD1O75665 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
OFD1O75665 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
OFD1O75665 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
OFD1O75665 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
OFD1O75665 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
OFD1O75665 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
OFD1O75665 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
OFD1O75665 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
OFD1O75665 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
OFD1O75665 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
OFD1O75665 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
OFD1O75665 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
OFD1O75665 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
OFD1O75665 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
OFD1O75665 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
OFD1O75665 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
OFD1O75665 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
OFD1O75665 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
OFD1O75665 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
OFD1O75665 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
OFD1O75665 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
OFD1O75665 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
OFD1O75665 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
OFD1O75665 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
OFD1O75665 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
OFD1O75665 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
OFD1O75665 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
OFD1O75665 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
OFD1O75665 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
OFD1O75665 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
OFD1O75665 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
OFD1O75665 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
OFD1O75665 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
OFD1O75665 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
OFD1O75665 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
OFD1O75665 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
OFD1O75665 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
OFD1O75665 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
OFD1O75665 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
OFD1O75665 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
OFD1O75665 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
OFD1O75665 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
OFD1O75665 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
OFD1O75665 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
OFD1O75665 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
OFD1O75665 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
OFD1O75665 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
OFD1O75665 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
OFD1O75665 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
OFD1O75665 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
OFD1O75665 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
OFD1O75665 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
OFD1O75665 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
OFD1O75665 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
OFD1O75665 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
OFD1O75665 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
OFD1O75665 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
OFD1O75665 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
OFD1O75665 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
OFD1O75665 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
OFD1O75665 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
OFD1O75665 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
OFD1O75665 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
OFD1O75665 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
OFD1O75665 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
OFD1O75665 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
OFD1O75665 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms