Protein–RNA interactions for Protein: O60423

ATP8B3, Phospholipid-transporting ATPase IK, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B3O60423 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.33■■■■□ 3.41
ATP8B3O60423 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
ATP8B3O60423 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
ATP8B3O60423 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ATP8B3O60423 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
ATP8B3O60423 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ATP8B3O60423 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
ATP8B3O60423 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ATP8B3O60423 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ATP8B3O60423 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
ATP8B3O60423 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
ATP8B3O60423 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
ATP8B3O60423 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ATP8B3O60423 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
ATP8B3O60423 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ATP8B3O60423 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ATP8B3O60423 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ATP8B3O60423 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
ATP8B3O60423 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
ATP8B3O60423 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
ATP8B3O60423 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ATP8B3O60423 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ATP8B3O60423 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ATP8B3O60423 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ATP8B3O60423 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ATP8B3O60423 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ATP8B3O60423 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ATP8B3O60423 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ATP8B3O60423 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ATP8B3O60423 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ATP8B3O60423 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ATP8B3O60423 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ATP8B3O60423 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ATP8B3O60423 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ATP8B3O60423 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ATP8B3O60423 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ATP8B3O60423 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ATP8B3O60423 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
ATP8B3O60423 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
ATP8B3O60423 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ATP8B3O60423 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ATP8B3O60423 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ATP8B3O60423 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ATP8B3O60423 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ATP8B3O60423 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ATP8B3O60423 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ATP8B3O60423 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ATP8B3O60423 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
ATP8B3O60423 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ATP8B3O60423 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ATP8B3O60423 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ATP8B3O60423 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ATP8B3O60423 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ATP8B3O60423 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ATP8B3O60423 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ATP8B3O60423 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ATP8B3O60423 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ATP8B3O60423 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ATP8B3O60423 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ATP8B3O60423 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ATP8B3O60423 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
ATP8B3O60423 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
ATP8B3O60423 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
ATP8B3O60423 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
ATP8B3O60423 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
ATP8B3O60423 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
ATP8B3O60423 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
ATP8B3O60423 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
ATP8B3O60423 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
ATP8B3O60423 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
ATP8B3O60423 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
ATP8B3O60423 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
ATP8B3O60423 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
ATP8B3O60423 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
ATP8B3O60423 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ATP8B3O60423 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ATP8B3O60423 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
ATP8B3O60423 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ATP8B3O60423 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ATP8B3O60423 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ATP8B3O60423 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ATP8B3O60423 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ATP8B3O60423 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ATP8B3O60423 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ATP8B3O60423 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
ATP8B3O60423 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
ATP8B3O60423 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ATP8B3O60423 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ATP8B3O60423 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
ATP8B3O60423 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ATP8B3O60423 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
ATP8B3O60423 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
ATP8B3O60423 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ATP8B3O60423 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
ATP8B3O60423 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
ATP8B3O60423 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ATP8B3O60423 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ATP8B3O60423 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ATP8B3O60423 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ATP8B3O60423 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms