Protein–RNA interactions for Protein: O43795

MYO1B, Unconventional myosin-Ib, humanhuman

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1BO43795 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC41.56■■■■■ 4.24
MYO1BO43795 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC41.08■■■■■ 4.17
MYO1BO43795 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
MYO1BO43795 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.47■■■■■ 4.07
MYO1BO43795 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
MYO1BO43795 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
MYO1BO43795 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
MYO1BO43795 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC39.71■■■■□ 3.95
MYO1BO43795 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
MYO1BO43795 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC39.22■■■■□ 3.87
MYO1BO43795 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
MYO1BO43795 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC38.98■■■■□ 3.83
MYO1BO43795 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
MYO1BO43795 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
MYO1BO43795 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
MYO1BO43795 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
MYO1BO43795 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
MYO1BO43795 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
MYO1BO43795 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
MYO1BO43795 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
MYO1BO43795 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
MYO1BO43795 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
MYO1BO43795 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
MYO1BO43795 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
MYO1BO43795 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
MYO1BO43795 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
MYO1BO43795 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
MYO1BO43795 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
MYO1BO43795 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
MYO1BO43795 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
MYO1BO43795 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
MYO1BO43795 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
MYO1BO43795 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
MYO1BO43795 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
MYO1BO43795 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
MYO1BO43795 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
MYO1BO43795 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
MYO1BO43795 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
MYO1BO43795 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
MYO1BO43795 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
MYO1BO43795 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
MYO1BO43795 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
MYO1BO43795 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
MYO1BO43795 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
MYO1BO43795 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
MYO1BO43795 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
MYO1BO43795 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
MYO1BO43795 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
MYO1BO43795 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
MYO1BO43795 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.53■■■■□ 3.44
MYO1BO43795 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
MYO1BO43795 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
MYO1BO43795 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
MYO1BO43795 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
MYO1BO43795 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
MYO1BO43795 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
MYO1BO43795 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
MYO1BO43795 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
MYO1BO43795 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
MYO1BO43795 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
MYO1BO43795 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
MYO1BO43795 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
MYO1BO43795 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
MYO1BO43795 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
MYO1BO43795 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
MYO1BO43795 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
MYO1BO43795 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
MYO1BO43795 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
MYO1BO43795 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
MYO1BO43795 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
MYO1BO43795 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
MYO1BO43795 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
MYO1BO43795 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
MYO1BO43795 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC35.78■■■■□ 3.32
MYO1BO43795 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
MYO1BO43795 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
MYO1BO43795 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
MYO1BO43795 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
MYO1BO43795 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
MYO1BO43795 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
MYO1BO43795 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
MYO1BO43795 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
MYO1BO43795 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
MYO1BO43795 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
MYO1BO43795 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
MYO1BO43795 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
MYO1BO43795 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
MYO1BO43795 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
MYO1BO43795 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
MYO1BO43795 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
MYO1BO43795 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
MYO1BO43795 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
MYO1BO43795 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
MYO1BO43795 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
MYO1BO43795 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
MYO1BO43795 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
MYO1BO43795 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
MYO1BO43795 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
MYO1BO43795 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
MYO1BO43795 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms