Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPQ1

Glycine cleavage system H protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPQ1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
A0A1W2PPQ1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
A0A1W2PPQ1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A1W2PPQ1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A1W2PPQ1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A1W2PPQ1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A1W2PPQ1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A1W2PPQ1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A1W2PPQ1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A1W2PPQ1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A1W2PPQ1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A1W2PPQ1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A1W2PPQ1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A1W2PPQ1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A1W2PPQ1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PPQ1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PPQ1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PPQ1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1W2PPQ1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A1W2PPQ1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A1W2PPQ1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1W2PPQ1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A1W2PPQ1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A1W2PPQ1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A1W2PPQ1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A1W2PPQ1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A1W2PPQ1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A1W2PPQ1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A1W2PPQ1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A1W2PPQ1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A1W2PPQ1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A1W2PPQ1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
A0A1W2PPQ1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1W2PPQ1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PPQ1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A1W2PPQ1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A1W2PPQ1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A1W2PPQ1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A1W2PPQ1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A1W2PPQ1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A1W2PPQ1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1W2PPQ1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1W2PPQ1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1W2PPQ1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A1W2PPQ1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A1W2PPQ1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A1W2PPQ1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A1W2PPQ1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A1W2PPQ1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A1W2PPQ1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1W2PPQ1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1W2PPQ1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1W2PPQ1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1W2PPQ1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1W2PPQ1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1W2PPQ1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1W2PPQ1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1W2PPQ1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1W2PPQ1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1W2PPQ1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1W2PPQ1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1W2PPQ1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1W2PPQ1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1W2PPQ1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A1W2PPQ1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1W2PPQ1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1W2PPQ1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A1W2PPQ1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A1W2PPQ1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PPQ1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
A0A1W2PPQ1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PPQ1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1W2PPQ1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1W2PPQ1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1W2PPQ1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1W2PPQ1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A1W2PPQ1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A1W2PPQ1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A1W2PPQ1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A1W2PPQ1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A1W2PPQ1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A1W2PPQ1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A1W2PPQ1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A1W2PPQ1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1W2PPQ1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1W2PPQ1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1W2PPQ1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PPQ1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PPQ1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1W2PPQ1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1W2PPQ1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1W2PPQ1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PPQ1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PPQ1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PPQ1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1W2PPQ1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1W2PPQ1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1W2PPQ1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A1W2PPQ1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1W2PPQ1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms