Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
CHIC2Q9UKJ5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC38.56■■■■□ 3.76
CHIC2Q9UKJ5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CHIC2Q9UKJ5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
CHIC2Q9UKJ5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CHIC2Q9UKJ5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC38.55■■■■□ 3.76
CHIC2Q9UKJ5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CHIC2Q9UKJ5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CHIC2Q9UKJ5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CHIC2Q9UKJ5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CHIC2Q9UKJ5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CHIC2Q9UKJ5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CHIC2Q9UKJ5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CHIC2Q9UKJ5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CHIC2Q9UKJ5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CHIC2Q9UKJ5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CHIC2Q9UKJ5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
CHIC2Q9UKJ5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
CHIC2Q9UKJ5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
CHIC2Q9UKJ5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
CHIC2Q9UKJ5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.51■■■■□ 3.76
CHIC2Q9UKJ5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
CHIC2Q9UKJ5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
CHIC2Q9UKJ5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CHIC2Q9UKJ5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
CHIC2Q9UKJ5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CHIC2Q9UKJ5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CHIC2Q9UKJ5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC38.48■■■■□ 3.75
CHIC2Q9UKJ5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CHIC2Q9UKJ5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CHIC2Q9UKJ5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CHIC2Q9UKJ5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CHIC2Q9UKJ5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CHIC2Q9UKJ5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CHIC2Q9UKJ5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
CHIC2Q9UKJ5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
CHIC2Q9UKJ5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CHIC2Q9UKJ5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CHIC2Q9UKJ5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
CHIC2Q9UKJ5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CHIC2Q9UKJ5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
CHIC2Q9UKJ5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CHIC2Q9UKJ5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CHIC2Q9UKJ5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CHIC2Q9UKJ5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
CHIC2Q9UKJ5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
CHIC2Q9UKJ5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC38.44■■■■□ 3.74
CHIC2Q9UKJ5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
CHIC2Q9UKJ5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CHIC2Q9UKJ5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
CHIC2Q9UKJ5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
CHIC2Q9UKJ5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CHIC2Q9UKJ5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
CHIC2Q9UKJ5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
CHIC2Q9UKJ5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
CHIC2Q9UKJ5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
CHIC2Q9UKJ5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
CHIC2Q9UKJ5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
CHIC2Q9UKJ5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
CHIC2Q9UKJ5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
CHIC2Q9UKJ5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CHIC2Q9UKJ5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
CHIC2Q9UKJ5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
CHIC2Q9UKJ5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CHIC2Q9UKJ5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CHIC2Q9UKJ5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CHIC2Q9UKJ5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CHIC2Q9UKJ5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC38.33■■■■□ 3.73
CHIC2Q9UKJ5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
CHIC2Q9UKJ5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CHIC2Q9UKJ5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CHIC2Q9UKJ5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CHIC2Q9UKJ5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
CHIC2Q9UKJ5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CHIC2Q9UKJ5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
CHIC2Q9UKJ5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CHIC2Q9UKJ5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CHIC2Q9UKJ5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CHIC2Q9UKJ5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CHIC2Q9UKJ5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
CHIC2Q9UKJ5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
CHIC2Q9UKJ5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
CHIC2Q9UKJ5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
CHIC2Q9UKJ5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
CHIC2Q9UKJ5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
CHIC2Q9UKJ5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC38.25■■■■□ 3.71
CHIC2Q9UKJ5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
CHIC2Q9UKJ5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
CHIC2Q9UKJ5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
CHIC2Q9UKJ5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
CHIC2Q9UKJ5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
CHIC2Q9UKJ5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
CHIC2Q9UKJ5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
CHIC2Q9UKJ5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
CHIC2Q9UKJ5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
CHIC2Q9UKJ5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
CHIC2Q9UKJ5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
CHIC2Q9UKJ5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
CHIC2Q9UKJ5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
CHIC2Q9UKJ5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 356 ms