Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC52.28■■■■■ 5.96
CHIC2Q9UKJ5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC50.97■■■■■ 5.75
CHIC2Q9UKJ5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.75■■■■■ 5.71
CHIC2Q9UKJ5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.61■■■■■ 5.69
CHIC2Q9UKJ5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.54■■■■■ 5.68
CHIC2Q9UKJ5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.5■■■■■ 5.67
CHIC2Q9UKJ5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC50.29■■■■■ 5.64
CHIC2Q9UKJ5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC50.19■■■■■ 5.63
CHIC2Q9UKJ5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC49.01■■■■■ 5.44
CHIC2Q9UKJ5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.98■■■■■ 5.43
CHIC2Q9UKJ5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC48.85■■■■■ 5.41
CHIC2Q9UKJ5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC48.8■■■■■ 5.4
CHIC2Q9UKJ5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.72■■■■■ 5.39
CHIC2Q9UKJ5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC48.7■■■■■ 5.39
CHIC2Q9UKJ5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC48.64■■■■■ 5.38
CHIC2Q9UKJ5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC48.55■■■■■ 5.36
CHIC2Q9UKJ5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.42■■■■■ 5.34
CHIC2Q9UKJ5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC48.17■■■■■ 5.3
CHIC2Q9UKJ5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC48.12■■■■■ 5.29
CHIC2Q9UKJ5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.12■■■■■ 5.29
CHIC2Q9UKJ5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.1■■■■■ 5.29
CHIC2Q9UKJ5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.93■■■■■ 5.26
CHIC2Q9UKJ5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.8■■■■■ 5.24
CHIC2Q9UKJ5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.46■■■■■ 5.19
CHIC2Q9UKJ5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC47.46■■■■■ 5.19
CHIC2Q9UKJ5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC47.31■■■■■ 5.16
CHIC2Q9UKJ5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.27■■■■■ 5.16
CHIC2Q9UKJ5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC47.26■■■■■ 5.16
CHIC2Q9UKJ5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC47.19■■■■■ 5.14
CHIC2Q9UKJ5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.17■■■■■ 5.14
CHIC2Q9UKJ5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.08■■■■■ 5.13
CHIC2Q9UKJ5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.95■■■■■ 5.11
CHIC2Q9UKJ5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC46.76■■■■■ 5.08
CHIC2Q9UKJ5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.65■■■■■ 5.06
CHIC2Q9UKJ5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC46.65■■■■■ 5.06
CHIC2Q9UKJ5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.63■■■■■ 5.06
CHIC2Q9UKJ5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC46.45■■■■■ 5.03
CHIC2Q9UKJ5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.37■■■■■ 5.01
CHIC2Q9UKJ5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.33■■■■■ 5.01
CHIC2Q9UKJ5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC46.32■■■■■ 5.01
CHIC2Q9UKJ5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.26■■■■■ 5
CHIC2Q9UKJ5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC46.18■■■■■ 4.98
CHIC2Q9UKJ5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.17■■■■■ 4.98
CHIC2Q9UKJ5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC46.15■■■■■ 4.98
CHIC2Q9UKJ5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC46.11■■■■■ 4.97
CHIC2Q9UKJ5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
CHIC2Q9UKJ5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
CHIC2Q9UKJ5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC45.75■■■■■ 4.91
CHIC2Q9UKJ5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
CHIC2Q9UKJ5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC45.72■■■■■ 4.91
CHIC2Q9UKJ5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
CHIC2Q9UKJ5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.7■■■■■ 4.91
CHIC2Q9UKJ5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.7■■■■■ 4.91
CHIC2Q9UKJ5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
CHIC2Q9UKJ5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC45.4■■■■■ 4.86
CHIC2Q9UKJ5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
CHIC2Q9UKJ5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.26■■■■■ 4.84
CHIC2Q9UKJ5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.26■■■■■ 4.84
CHIC2Q9UKJ5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.22■■■■■ 4.83
CHIC2Q9UKJ5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC45.21■■■■■ 4.83
CHIC2Q9UKJ5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
CHIC2Q9UKJ5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC45.07■■■■■ 4.81
CHIC2Q9UKJ5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
CHIC2Q9UKJ5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
CHIC2Q9UKJ5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC45.02■■■■■ 4.8
CHIC2Q9UKJ5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
CHIC2Q9UKJ5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC44.99■■■■■ 4.79
CHIC2Q9UKJ5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
CHIC2Q9UKJ5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC44.89■■■■■ 4.78
CHIC2Q9UKJ5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC44.85■■■■■ 4.77
CHIC2Q9UKJ5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
CHIC2Q9UKJ5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
CHIC2Q9UKJ5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC44.79■■■■■ 4.76
CHIC2Q9UKJ5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
CHIC2Q9UKJ5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
CHIC2Q9UKJ5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC44.73■■■■■ 4.75
CHIC2Q9UKJ5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
CHIC2Q9UKJ5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC44.67■■■■■ 4.74
CHIC2Q9UKJ5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC44.67■■■■■ 4.74
CHIC2Q9UKJ5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
CHIC2Q9UKJ5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
CHIC2Q9UKJ5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC44.58■■■■■ 4.73
CHIC2Q9UKJ5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
CHIC2Q9UKJ5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.48■■■■■ 4.71
CHIC2Q9UKJ5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC44.48■■■■■ 4.71
CHIC2Q9UKJ5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.46■■■■■ 4.71
CHIC2Q9UKJ5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
CHIC2Q9UKJ5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC44.45■■■■■ 4.71
CHIC2Q9UKJ5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.44■■■■■ 4.7
CHIC2Q9UKJ5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC44.38■■■■■ 4.7
CHIC2Q9UKJ5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.36■■■■■ 4.69
CHIC2Q9UKJ5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC44.36■■■■■ 4.69
CHIC2Q9UKJ5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
CHIC2Q9UKJ5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
CHIC2Q9UKJ5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
CHIC2Q9UKJ5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
CHIC2Q9UKJ5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
CHIC2Q9UKJ5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
CHIC2Q9UKJ5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
CHIC2Q9UKJ5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.21■■■■■ 4.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms