Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM1

PEMT, Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEMTQ9UBM1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PEMTQ9UBM1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PEMTQ9UBM1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PEMTQ9UBM1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PEMTQ9UBM1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PEMTQ9UBM1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PEMTQ9UBM1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PEMTQ9UBM1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PEMTQ9UBM1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PEMTQ9UBM1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PEMTQ9UBM1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PEMTQ9UBM1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PEMTQ9UBM1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PEMTQ9UBM1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PEMTQ9UBM1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PEMTQ9UBM1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PEMTQ9UBM1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PEMTQ9UBM1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PEMTQ9UBM1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PEMTQ9UBM1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PEMTQ9UBM1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PEMTQ9UBM1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PEMTQ9UBM1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PEMTQ9UBM1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PEMTQ9UBM1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PEMTQ9UBM1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PEMTQ9UBM1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PEMTQ9UBM1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PEMTQ9UBM1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PEMTQ9UBM1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PEMTQ9UBM1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PEMTQ9UBM1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PEMTQ9UBM1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PEMTQ9UBM1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PEMTQ9UBM1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PEMTQ9UBM1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEMTQ9UBM1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEMTQ9UBM1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEMTQ9UBM1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEMTQ9UBM1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEMTQ9UBM1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEMTQ9UBM1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEMTQ9UBM1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PEMTQ9UBM1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PEMTQ9UBM1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PEMTQ9UBM1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PEMTQ9UBM1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PEMTQ9UBM1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PEMTQ9UBM1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PEMTQ9UBM1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PEMTQ9UBM1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PEMTQ9UBM1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PEMTQ9UBM1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PEMTQ9UBM1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PEMTQ9UBM1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PEMTQ9UBM1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PEMTQ9UBM1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PEMTQ9UBM1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PEMTQ9UBM1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PEMTQ9UBM1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PEMTQ9UBM1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PEMTQ9UBM1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEMTQ9UBM1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEMTQ9UBM1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEMTQ9UBM1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PEMTQ9UBM1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEMTQ9UBM1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEMTQ9UBM1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PEMTQ9UBM1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PEMTQ9UBM1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PEMTQ9UBM1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PEMTQ9UBM1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PEMTQ9UBM1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PEMTQ9UBM1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PEMTQ9UBM1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PEMTQ9UBM1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PEMTQ9UBM1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PEMTQ9UBM1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PEMTQ9UBM1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PEMTQ9UBM1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PEMTQ9UBM1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PEMTQ9UBM1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PEMTQ9UBM1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PEMTQ9UBM1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PEMTQ9UBM1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PEMTQ9UBM1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PEMTQ9UBM1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEMTQ9UBM1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEMTQ9UBM1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEMTQ9UBM1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEMTQ9UBM1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEMTQ9UBM1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEMTQ9UBM1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEMTQ9UBM1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEMTQ9UBM1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEMTQ9UBM1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEMTQ9UBM1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEMTQ9UBM1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEMTQ9UBM1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEMTQ9UBM1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms