Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R7

SUCLA2, Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLA2Q9P2R7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SUCLA2Q9P2R7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SUCLA2Q9P2R7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SUCLA2Q9P2R7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SUCLA2Q9P2R7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SUCLA2Q9P2R7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SUCLA2Q9P2R7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SUCLA2Q9P2R7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SUCLA2Q9P2R7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SUCLA2Q9P2R7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SUCLA2Q9P2R7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SUCLA2Q9P2R7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SUCLA2Q9P2R7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SUCLA2Q9P2R7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SUCLA2Q9P2R7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SUCLA2Q9P2R7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SUCLA2Q9P2R7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SUCLA2Q9P2R7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SUCLA2Q9P2R7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SUCLA2Q9P2R7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SUCLA2Q9P2R7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SUCLA2Q9P2R7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SUCLA2Q9P2R7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SUCLA2Q9P2R7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SUCLA2Q9P2R7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SUCLA2Q9P2R7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SUCLA2Q9P2R7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SUCLA2Q9P2R7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SUCLA2Q9P2R7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SUCLA2Q9P2R7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SUCLA2Q9P2R7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SUCLA2Q9P2R7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SUCLA2Q9P2R7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SUCLA2Q9P2R7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SUCLA2Q9P2R7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SUCLA2Q9P2R7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SUCLA2Q9P2R7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SUCLA2Q9P2R7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SUCLA2Q9P2R7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SUCLA2Q9P2R7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SUCLA2Q9P2R7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SUCLA2Q9P2R7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SUCLA2Q9P2R7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SUCLA2Q9P2R7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SUCLA2Q9P2R7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SUCLA2Q9P2R7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SUCLA2Q9P2R7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SUCLA2Q9P2R7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SUCLA2Q9P2R7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SUCLA2Q9P2R7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SUCLA2Q9P2R7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SUCLA2Q9P2R7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SUCLA2Q9P2R7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SUCLA2Q9P2R7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SUCLA2Q9P2R7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SUCLA2Q9P2R7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SUCLA2Q9P2R7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SUCLA2Q9P2R7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SUCLA2Q9P2R7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SUCLA2Q9P2R7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SUCLA2Q9P2R7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SUCLA2Q9P2R7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SUCLA2Q9P2R7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SUCLA2Q9P2R7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SUCLA2Q9P2R7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SUCLA2Q9P2R7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SUCLA2Q9P2R7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SUCLA2Q9P2R7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SUCLA2Q9P2R7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SUCLA2Q9P2R7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SUCLA2Q9P2R7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SUCLA2Q9P2R7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SUCLA2Q9P2R7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SUCLA2Q9P2R7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SUCLA2Q9P2R7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SUCLA2Q9P2R7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SUCLA2Q9P2R7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SUCLA2Q9P2R7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SUCLA2Q9P2R7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SUCLA2Q9P2R7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SUCLA2Q9P2R7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SUCLA2Q9P2R7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SUCLA2Q9P2R7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SUCLA2Q9P2R7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SUCLA2Q9P2R7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SUCLA2Q9P2R7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SUCLA2Q9P2R7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SUCLA2Q9P2R7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
SUCLA2Q9P2R7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SUCLA2Q9P2R7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SUCLA2Q9P2R7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SUCLA2Q9P2R7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SUCLA2Q9P2R7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SUCLA2Q9P2R7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SUCLA2Q9P2R7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SUCLA2Q9P2R7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SUCLA2Q9P2R7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SUCLA2Q9P2R7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SUCLA2Q9P2R7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SUCLA2Q9P2R7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms