Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWS1

PARPBP, PCNA-interacting partner, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARPBPQ9NWS1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARPBPQ9NWS1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PARPBPQ9NWS1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARPBPQ9NWS1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARPBPQ9NWS1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARPBPQ9NWS1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARPBPQ9NWS1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARPBPQ9NWS1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARPBPQ9NWS1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PARPBPQ9NWS1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PARPBPQ9NWS1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARPBPQ9NWS1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARPBPQ9NWS1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARPBPQ9NWS1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARPBPQ9NWS1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARPBPQ9NWS1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARPBPQ9NWS1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARPBPQ9NWS1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PARPBPQ9NWS1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARPBPQ9NWS1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARPBPQ9NWS1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARPBPQ9NWS1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PARPBPQ9NWS1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PARPBPQ9NWS1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PARPBPQ9NWS1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PARPBPQ9NWS1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PARPBPQ9NWS1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PARPBPQ9NWS1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PARPBPQ9NWS1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARPBPQ9NWS1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARPBPQ9NWS1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARPBPQ9NWS1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARPBPQ9NWS1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARPBPQ9NWS1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARPBPQ9NWS1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARPBPQ9NWS1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARPBPQ9NWS1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PARPBPQ9NWS1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PARPBPQ9NWS1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PARPBPQ9NWS1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PARPBPQ9NWS1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARPBPQ9NWS1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARPBPQ9NWS1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARPBPQ9NWS1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PARPBPQ9NWS1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARPBPQ9NWS1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARPBPQ9NWS1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARPBPQ9NWS1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARPBPQ9NWS1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PARPBPQ9NWS1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARPBPQ9NWS1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARPBPQ9NWS1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARPBPQ9NWS1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PARPBPQ9NWS1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARPBPQ9NWS1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARPBPQ9NWS1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARPBPQ9NWS1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PARPBPQ9NWS1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PARPBPQ9NWS1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PARPBPQ9NWS1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PARPBPQ9NWS1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PARPBPQ9NWS1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PARPBPQ9NWS1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PARPBPQ9NWS1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PARPBPQ9NWS1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PARPBPQ9NWS1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PARPBPQ9NWS1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PARPBPQ9NWS1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PARPBPQ9NWS1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PARPBPQ9NWS1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PARPBPQ9NWS1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PARPBPQ9NWS1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PARPBPQ9NWS1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PARPBPQ9NWS1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PARPBPQ9NWS1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PARPBPQ9NWS1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PARPBPQ9NWS1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PARPBPQ9NWS1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PARPBPQ9NWS1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PARPBPQ9NWS1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PARPBPQ9NWS1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PARPBPQ9NWS1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARPBPQ9NWS1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARPBPQ9NWS1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARPBPQ9NWS1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARPBPQ9NWS1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARPBPQ9NWS1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARPBPQ9NWS1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARPBPQ9NWS1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARPBPQ9NWS1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARPBPQ9NWS1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARPBPQ9NWS1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARPBPQ9NWS1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARPBPQ9NWS1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARPBPQ9NWS1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARPBPQ9NWS1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARPBPQ9NWS1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARPBPQ9NWS1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARPBPQ9NWS1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARPBPQ9NWS1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms