Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC3

SLC38A7, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 7, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A7Q9NVC3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC38A7Q9NVC3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC38A7Q9NVC3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC38A7Q9NVC3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC38A7Q9NVC3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC38A7Q9NVC3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC38A7Q9NVC3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC38A7Q9NVC3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC38A7Q9NVC3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC38A7Q9NVC3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC38A7Q9NVC3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC38A7Q9NVC3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC38A7Q9NVC3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC38A7Q9NVC3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC38A7Q9NVC3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC38A7Q9NVC3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC38A7Q9NVC3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC38A7Q9NVC3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC38A7Q9NVC3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC38A7Q9NVC3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC38A7Q9NVC3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC38A7Q9NVC3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC38A7Q9NVC3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC38A7Q9NVC3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC38A7Q9NVC3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC38A7Q9NVC3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC38A7Q9NVC3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC38A7Q9NVC3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC38A7Q9NVC3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC38A7Q9NVC3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC38A7Q9NVC3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC38A7Q9NVC3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC38A7Q9NVC3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC38A7Q9NVC3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC38A7Q9NVC3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC38A7Q9NVC3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC38A7Q9NVC3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC38A7Q9NVC3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC38A7Q9NVC3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC38A7Q9NVC3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC38A7Q9NVC3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC38A7Q9NVC3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SLC38A7Q9NVC3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC38A7Q9NVC3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC38A7Q9NVC3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC38A7Q9NVC3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC38A7Q9NVC3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC38A7Q9NVC3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC38A7Q9NVC3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC38A7Q9NVC3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC38A7Q9NVC3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC38A7Q9NVC3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC38A7Q9NVC3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC38A7Q9NVC3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC38A7Q9NVC3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC38A7Q9NVC3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC38A7Q9NVC3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC38A7Q9NVC3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC38A7Q9NVC3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC38A7Q9NVC3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC38A7Q9NVC3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC38A7Q9NVC3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC38A7Q9NVC3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC38A7Q9NVC3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC38A7Q9NVC3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC38A7Q9NVC3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SLC38A7Q9NVC3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC38A7Q9NVC3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC38A7Q9NVC3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC38A7Q9NVC3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC38A7Q9NVC3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC38A7Q9NVC3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC38A7Q9NVC3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC38A7Q9NVC3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC38A7Q9NVC3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC38A7Q9NVC3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC38A7Q9NVC3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC38A7Q9NVC3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC38A7Q9NVC3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC38A7Q9NVC3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC38A7Q9NVC3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC38A7Q9NVC3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC38A7Q9NVC3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC38A7Q9NVC3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC38A7Q9NVC3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC38A7Q9NVC3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC38A7Q9NVC3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC38A7Q9NVC3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC38A7Q9NVC3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC38A7Q9NVC3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC38A7Q9NVC3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC38A7Q9NVC3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC38A7Q9NVC3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC38A7Q9NVC3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC38A7Q9NVC3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SLC38A7Q9NVC3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC38A7Q9NVC3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC38A7Q9NVC3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC38A7Q9NVC3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC38A7Q9NVC3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms