Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUJ3

TCP11L1, T-complex protein 11-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP11L1Q9NUJ3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TCP11L1Q9NUJ3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TCP11L1Q9NUJ3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TCP11L1Q9NUJ3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TCP11L1Q9NUJ3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TCP11L1Q9NUJ3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TCP11L1Q9NUJ3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TCP11L1Q9NUJ3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TCP11L1Q9NUJ3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TCP11L1Q9NUJ3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TCP11L1Q9NUJ3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TCP11L1Q9NUJ3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TCP11L1Q9NUJ3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TCP11L1Q9NUJ3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TCP11L1Q9NUJ3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TCP11L1Q9NUJ3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TCP11L1Q9NUJ3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TCP11L1Q9NUJ3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TCP11L1Q9NUJ3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TCP11L1Q9NUJ3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TCP11L1Q9NUJ3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TCP11L1Q9NUJ3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TCP11L1Q9NUJ3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TCP11L1Q9NUJ3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TCP11L1Q9NUJ3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TCP11L1Q9NUJ3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TCP11L1Q9NUJ3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TCP11L1Q9NUJ3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TCP11L1Q9NUJ3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TCP11L1Q9NUJ3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TCP11L1Q9NUJ3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TCP11L1Q9NUJ3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TCP11L1Q9NUJ3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TCP11L1Q9NUJ3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TCP11L1Q9NUJ3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TCP11L1Q9NUJ3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TCP11L1Q9NUJ3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TCP11L1Q9NUJ3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TCP11L1Q9NUJ3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TCP11L1Q9NUJ3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TCP11L1Q9NUJ3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TCP11L1Q9NUJ3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TCP11L1Q9NUJ3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TCP11L1Q9NUJ3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TCP11L1Q9NUJ3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TCP11L1Q9NUJ3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TCP11L1Q9NUJ3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TCP11L1Q9NUJ3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TCP11L1Q9NUJ3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
TCP11L1Q9NUJ3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TCP11L1Q9NUJ3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
TCP11L1Q9NUJ3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TCP11L1Q9NUJ3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TCP11L1Q9NUJ3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TCP11L1Q9NUJ3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TCP11L1Q9NUJ3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TCP11L1Q9NUJ3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TCP11L1Q9NUJ3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TCP11L1Q9NUJ3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TCP11L1Q9NUJ3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TCP11L1Q9NUJ3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TCP11L1Q9NUJ3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TCP11L1Q9NUJ3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TCP11L1Q9NUJ3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TCP11L1Q9NUJ3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TCP11L1Q9NUJ3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TCP11L1Q9NUJ3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TCP11L1Q9NUJ3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TCP11L1Q9NUJ3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TCP11L1Q9NUJ3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TCP11L1Q9NUJ3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TCP11L1Q9NUJ3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TCP11L1Q9NUJ3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TCP11L1Q9NUJ3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TCP11L1Q9NUJ3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
TCP11L1Q9NUJ3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TCP11L1Q9NUJ3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TCP11L1Q9NUJ3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TCP11L1Q9NUJ3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TCP11L1Q9NUJ3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TCP11L1Q9NUJ3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TCP11L1Q9NUJ3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TCP11L1Q9NUJ3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TCP11L1Q9NUJ3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TCP11L1Q9NUJ3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TCP11L1Q9NUJ3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TCP11L1Q9NUJ3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TCP11L1Q9NUJ3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TCP11L1Q9NUJ3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TCP11L1Q9NUJ3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TCP11L1Q9NUJ3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TCP11L1Q9NUJ3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
TCP11L1Q9NUJ3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TCP11L1Q9NUJ3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TCP11L1Q9NUJ3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TCP11L1Q9NUJ3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TCP11L1Q9NUJ3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TCP11L1Q9NUJ3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TCP11L1Q9NUJ3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TCP11L1Q9NUJ3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms