Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q80

DERL3, Derlin-3, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DERL3Q96Q80 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DERL3Q96Q80 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DERL3Q96Q80 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DERL3Q96Q80 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DERL3Q96Q80 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DERL3Q96Q80 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DERL3Q96Q80 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DERL3Q96Q80 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DERL3Q96Q80 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DERL3Q96Q80 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DERL3Q96Q80 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DERL3Q96Q80 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DERL3Q96Q80 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DERL3Q96Q80 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DERL3Q96Q80 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DERL3Q96Q80 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DERL3Q96Q80 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DERL3Q96Q80 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DERL3Q96Q80 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DERL3Q96Q80 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DERL3Q96Q80 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DERL3Q96Q80 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DERL3Q96Q80 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DERL3Q96Q80 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DERL3Q96Q80 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DERL3Q96Q80 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DERL3Q96Q80 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DERL3Q96Q80 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DERL3Q96Q80 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DERL3Q96Q80 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DERL3Q96Q80 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DERL3Q96Q80 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DERL3Q96Q80 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DERL3Q96Q80 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DERL3Q96Q80 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DERL3Q96Q80 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DERL3Q96Q80 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DERL3Q96Q80 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DERL3Q96Q80 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DERL3Q96Q80 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DERL3Q96Q80 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DERL3Q96Q80 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DERL3Q96Q80 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DERL3Q96Q80 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DERL3Q96Q80 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DERL3Q96Q80 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DERL3Q96Q80 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DERL3Q96Q80 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DERL3Q96Q80 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DERL3Q96Q80 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DERL3Q96Q80 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DERL3Q96Q80 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DERL3Q96Q80 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DERL3Q96Q80 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DERL3Q96Q80 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DERL3Q96Q80 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DERL3Q96Q80 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DERL3Q96Q80 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DERL3Q96Q80 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DERL3Q96Q80 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DERL3Q96Q80 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DERL3Q96Q80 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DERL3Q96Q80 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DERL3Q96Q80 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DERL3Q96Q80 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DERL3Q96Q80 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DERL3Q96Q80 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DERL3Q96Q80 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DERL3Q96Q80 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DERL3Q96Q80 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DERL3Q96Q80 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DERL3Q96Q80 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DERL3Q96Q80 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DERL3Q96Q80 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DERL3Q96Q80 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DERL3Q96Q80 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DERL3Q96Q80 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DERL3Q96Q80 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DERL3Q96Q80 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DERL3Q96Q80 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DERL3Q96Q80 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DERL3Q96Q80 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DERL3Q96Q80 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DERL3Q96Q80 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DERL3Q96Q80 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DERL3Q96Q80 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DERL3Q96Q80 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DERL3Q96Q80 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DERL3Q96Q80 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DERL3Q96Q80 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DERL3Q96Q80 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DERL3Q96Q80 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DERL3Q96Q80 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DERL3Q96Q80 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DERL3Q96Q80 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DERL3Q96Q80 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DERL3Q96Q80 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DERL3Q96Q80 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DERL3Q96Q80 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DERL3Q96Q80 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms