Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSPC1Q8WXF1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PSPC1Q8WXF1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PSPC1Q8WXF1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PSPC1Q8WXF1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PSPC1Q8WXF1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSPC1Q8WXF1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSPC1Q8WXF1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSPC1Q8WXF1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSPC1Q8WXF1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSPC1Q8WXF1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSPC1Q8WXF1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSPC1Q8WXF1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PSPC1Q8WXF1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSPC1Q8WXF1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSPC1Q8WXF1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSPC1Q8WXF1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSPC1Q8WXF1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSPC1Q8WXF1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSPC1Q8WXF1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSPC1Q8WXF1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSPC1Q8WXF1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSPC1Q8WXF1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSPC1Q8WXF1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSPC1Q8WXF1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PSPC1Q8WXF1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSPC1Q8WXF1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSPC1Q8WXF1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSPC1Q8WXF1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSPC1Q8WXF1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSPC1Q8WXF1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSPC1Q8WXF1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSPC1Q8WXF1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSPC1Q8WXF1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSPC1Q8WXF1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSPC1Q8WXF1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSPC1Q8WXF1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSPC1Q8WXF1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSPC1Q8WXF1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSPC1Q8WXF1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSPC1Q8WXF1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSPC1Q8WXF1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSPC1Q8WXF1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSPC1Q8WXF1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSPC1Q8WXF1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSPC1Q8WXF1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSPC1Q8WXF1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSPC1Q8WXF1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSPC1Q8WXF1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSPC1Q8WXF1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSPC1Q8WXF1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSPC1Q8WXF1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSPC1Q8WXF1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSPC1Q8WXF1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSPC1Q8WXF1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSPC1Q8WXF1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSPC1Q8WXF1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSPC1Q8WXF1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSPC1Q8WXF1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
PSPC1Q8WXF1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSPC1Q8WXF1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSPC1Q8WXF1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PSPC1Q8WXF1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSPC1Q8WXF1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSPC1Q8WXF1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSPC1Q8WXF1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSPC1Q8WXF1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSPC1Q8WXF1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PSPC1Q8WXF1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PSPC1Q8WXF1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSPC1Q8WXF1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSPC1Q8WXF1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSPC1Q8WXF1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSPC1Q8WXF1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSPC1Q8WXF1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSPC1Q8WXF1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSPC1Q8WXF1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSPC1Q8WXF1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSPC1Q8WXF1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PSPC1Q8WXF1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
PSPC1Q8WXF1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
PSPC1Q8WXF1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSPC1Q8WXF1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSPC1Q8WXF1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSPC1Q8WXF1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSPC1Q8WXF1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSPC1Q8WXF1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSPC1Q8WXF1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PSPC1Q8WXF1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PSPC1Q8WXF1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PSPC1Q8WXF1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSPC1Q8WXF1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSPC1Q8WXF1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSPC1Q8WXF1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSPC1Q8WXF1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSPC1Q8WXF1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSPC1Q8WXF1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSPC1Q8WXF1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSPC1Q8WXF1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSPC1Q8WXF1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.1 ms