Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBX8

PIP4K2C, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 gamma, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2CQ8TBX8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIP4K2CQ8TBX8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIP4K2CQ8TBX8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIP4K2CQ8TBX8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIP4K2CQ8TBX8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIP4K2CQ8TBX8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PIP4K2CQ8TBX8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PIP4K2CQ8TBX8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PIP4K2CQ8TBX8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PIP4K2CQ8TBX8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PIP4K2CQ8TBX8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PIP4K2CQ8TBX8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PIP4K2CQ8TBX8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PIP4K2CQ8TBX8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PIP4K2CQ8TBX8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PIP4K2CQ8TBX8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PIP4K2CQ8TBX8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PIP4K2CQ8TBX8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PIP4K2CQ8TBX8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PIP4K2CQ8TBX8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PIP4K2CQ8TBX8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PIP4K2CQ8TBX8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PIP4K2CQ8TBX8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PIP4K2CQ8TBX8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PIP4K2CQ8TBX8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PIP4K2CQ8TBX8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PIP4K2CQ8TBX8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PIP4K2CQ8TBX8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PIP4K2CQ8TBX8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PIP4K2CQ8TBX8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PIP4K2CQ8TBX8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PIP4K2CQ8TBX8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PIP4K2CQ8TBX8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PIP4K2CQ8TBX8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PIP4K2CQ8TBX8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PIP4K2CQ8TBX8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PIP4K2CQ8TBX8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PIP4K2CQ8TBX8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PIP4K2CQ8TBX8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PIP4K2CQ8TBX8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PIP4K2CQ8TBX8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PIP4K2CQ8TBX8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PIP4K2CQ8TBX8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PIP4K2CQ8TBX8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PIP4K2CQ8TBX8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PIP4K2CQ8TBX8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PIP4K2CQ8TBX8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PIP4K2CQ8TBX8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PIP4K2CQ8TBX8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PIP4K2CQ8TBX8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PIP4K2CQ8TBX8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PIP4K2CQ8TBX8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIP4K2CQ8TBX8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIP4K2CQ8TBX8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIP4K2CQ8TBX8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIP4K2CQ8TBX8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PIP4K2CQ8TBX8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIP4K2CQ8TBX8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PIP4K2CQ8TBX8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIP4K2CQ8TBX8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIP4K2CQ8TBX8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PIP4K2CQ8TBX8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIP4K2CQ8TBX8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIP4K2CQ8TBX8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIP4K2CQ8TBX8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIP4K2CQ8TBX8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIP4K2CQ8TBX8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIP4K2CQ8TBX8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIP4K2CQ8TBX8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIP4K2CQ8TBX8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIP4K2CQ8TBX8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIP4K2CQ8TBX8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIP4K2CQ8TBX8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIP4K2CQ8TBX8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIP4K2CQ8TBX8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIP4K2CQ8TBX8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIP4K2CQ8TBX8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIP4K2CQ8TBX8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIP4K2CQ8TBX8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIP4K2CQ8TBX8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIP4K2CQ8TBX8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIP4K2CQ8TBX8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIP4K2CQ8TBX8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIP4K2CQ8TBX8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIP4K2CQ8TBX8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PIP4K2CQ8TBX8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PIP4K2CQ8TBX8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PIP4K2CQ8TBX8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PIP4K2CQ8TBX8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PIP4K2CQ8TBX8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PIP4K2CQ8TBX8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PIP4K2CQ8TBX8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PIP4K2CQ8TBX8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PIP4K2CQ8TBX8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PIP4K2CQ8TBX8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PIP4K2CQ8TBX8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PIP4K2CQ8TBX8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PIP4K2CQ8TBX8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PIP4K2CQ8TBX8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PIP4K2CQ8TBX8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms