Protein–RNA interactions for Protein: Q8N350

CBARP, Voltage-dependent calcium channel beta subunit-associated regulatory protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBARPQ8N350 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CBARPQ8N350 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CBARPQ8N350 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CBARPQ8N350 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CBARPQ8N350 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CBARPQ8N350 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CBARPQ8N350 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CBARPQ8N350 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CBARPQ8N350 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CBARPQ8N350 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CBARPQ8N350 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CBARPQ8N350 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CBARPQ8N350 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CBARPQ8N350 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CBARPQ8N350 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CBARPQ8N350 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CBARPQ8N350 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CBARPQ8N350 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CBARPQ8N350 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CBARPQ8N350 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CBARPQ8N350 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CBARPQ8N350 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CBARPQ8N350 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CBARPQ8N350 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CBARPQ8N350 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CBARPQ8N350 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CBARPQ8N350 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CBARPQ8N350 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CBARPQ8N350 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CBARPQ8N350 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CBARPQ8N350 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CBARPQ8N350 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CBARPQ8N350 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CBARPQ8N350 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CBARPQ8N350 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CBARPQ8N350 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CBARPQ8N350 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CBARPQ8N350 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CBARPQ8N350 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CBARPQ8N350 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CBARPQ8N350 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CBARPQ8N350 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CBARPQ8N350 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CBARPQ8N350 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CBARPQ8N350 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CBARPQ8N350 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CBARPQ8N350 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CBARPQ8N350 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CBARPQ8N350 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CBARPQ8N350 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CBARPQ8N350 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CBARPQ8N350 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CBARPQ8N350 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CBARPQ8N350 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CBARPQ8N350 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CBARPQ8N350 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CBARPQ8N350 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CBARPQ8N350 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CBARPQ8N350 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CBARPQ8N350 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CBARPQ8N350 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CBARPQ8N350 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CBARPQ8N350 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CBARPQ8N350 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CBARPQ8N350 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CBARPQ8N350 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CBARPQ8N350 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CBARPQ8N350 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CBARPQ8N350 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CBARPQ8N350 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CBARPQ8N350 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CBARPQ8N350 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CBARPQ8N350 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CBARPQ8N350 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CBARPQ8N350 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CBARPQ8N350 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CBARPQ8N350 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CBARPQ8N350 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CBARPQ8N350 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CBARPQ8N350 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CBARPQ8N350 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CBARPQ8N350 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CBARPQ8N350 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CBARPQ8N350 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CBARPQ8N350 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CBARPQ8N350 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CBARPQ8N350 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CBARPQ8N350 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CBARPQ8N350 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CBARPQ8N350 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CBARPQ8N350 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CBARPQ8N350 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CBARPQ8N350 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CBARPQ8N350 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CBARPQ8N350 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CBARPQ8N350 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CBARPQ8N350 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CBARPQ8N350 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBARPQ8N350 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBARPQ8N350 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms