Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1A6

C4orf33, UPF0462 protein C4orf33, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf33Q8N1A6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C4orf33Q8N1A6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C4orf33Q8N1A6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C4orf33Q8N1A6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C4orf33Q8N1A6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
C4orf33Q8N1A6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C4orf33Q8N1A6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C4orf33Q8N1A6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C4orf33Q8N1A6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
C4orf33Q8N1A6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C4orf33Q8N1A6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
C4orf33Q8N1A6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C4orf33Q8N1A6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C4orf33Q8N1A6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C4orf33Q8N1A6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C4orf33Q8N1A6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C4orf33Q8N1A6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C4orf33Q8N1A6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C4orf33Q8N1A6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C4orf33Q8N1A6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C4orf33Q8N1A6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C4orf33Q8N1A6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C4orf33Q8N1A6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C4orf33Q8N1A6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C4orf33Q8N1A6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C4orf33Q8N1A6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C4orf33Q8N1A6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C4orf33Q8N1A6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C4orf33Q8N1A6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C4orf33Q8N1A6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C4orf33Q8N1A6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C4orf33Q8N1A6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C4orf33Q8N1A6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
C4orf33Q8N1A6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C4orf33Q8N1A6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C4orf33Q8N1A6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C4orf33Q8N1A6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C4orf33Q8N1A6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C4orf33Q8N1A6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C4orf33Q8N1A6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C4orf33Q8N1A6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C4orf33Q8N1A6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C4orf33Q8N1A6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C4orf33Q8N1A6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C4orf33Q8N1A6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
C4orf33Q8N1A6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C4orf33Q8N1A6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
C4orf33Q8N1A6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C4orf33Q8N1A6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
C4orf33Q8N1A6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C4orf33Q8N1A6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C4orf33Q8N1A6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C4orf33Q8N1A6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C4orf33Q8N1A6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C4orf33Q8N1A6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C4orf33Q8N1A6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C4orf33Q8N1A6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C4orf33Q8N1A6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C4orf33Q8N1A6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C4orf33Q8N1A6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C4orf33Q8N1A6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C4orf33Q8N1A6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C4orf33Q8N1A6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C4orf33Q8N1A6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C4orf33Q8N1A6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C4orf33Q8N1A6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C4orf33Q8N1A6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C4orf33Q8N1A6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C4orf33Q8N1A6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C4orf33Q8N1A6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C4orf33Q8N1A6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C4orf33Q8N1A6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C4orf33Q8N1A6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C4orf33Q8N1A6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C4orf33Q8N1A6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C4orf33Q8N1A6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C4orf33Q8N1A6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
C4orf33Q8N1A6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C4orf33Q8N1A6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C4orf33Q8N1A6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C4orf33Q8N1A6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C4orf33Q8N1A6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C4orf33Q8N1A6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C4orf33Q8N1A6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C4orf33Q8N1A6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C4orf33Q8N1A6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C4orf33Q8N1A6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C4orf33Q8N1A6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C4orf33Q8N1A6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C4orf33Q8N1A6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C4orf33Q8N1A6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C4orf33Q8N1A6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C4orf33Q8N1A6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C4orf33Q8N1A6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C4orf33Q8N1A6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C4orf33Q8N1A6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C4orf33Q8N1A6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C4orf33Q8N1A6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
C4orf33Q8N1A6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C4orf33Q8N1A6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms