Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXB3

TUSC5, Tumor suppressor candidate 5, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUSC5Q8IXB3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUSC5Q8IXB3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUSC5Q8IXB3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUSC5Q8IXB3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUSC5Q8IXB3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUSC5Q8IXB3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUSC5Q8IXB3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TUSC5Q8IXB3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUSC5Q8IXB3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUSC5Q8IXB3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUSC5Q8IXB3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUSC5Q8IXB3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUSC5Q8IXB3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUSC5Q8IXB3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUSC5Q8IXB3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUSC5Q8IXB3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUSC5Q8IXB3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUSC5Q8IXB3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUSC5Q8IXB3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUSC5Q8IXB3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUSC5Q8IXB3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUSC5Q8IXB3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUSC5Q8IXB3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUSC5Q8IXB3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUSC5Q8IXB3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUSC5Q8IXB3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUSC5Q8IXB3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUSC5Q8IXB3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TUSC5Q8IXB3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TUSC5Q8IXB3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUSC5Q8IXB3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUSC5Q8IXB3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUSC5Q8IXB3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUSC5Q8IXB3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUSC5Q8IXB3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUSC5Q8IXB3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUSC5Q8IXB3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUSC5Q8IXB3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUSC5Q8IXB3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUSC5Q8IXB3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUSC5Q8IXB3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TUSC5Q8IXB3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUSC5Q8IXB3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUSC5Q8IXB3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUSC5Q8IXB3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUSC5Q8IXB3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUSC5Q8IXB3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUSC5Q8IXB3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUSC5Q8IXB3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUSC5Q8IXB3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUSC5Q8IXB3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUSC5Q8IXB3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUSC5Q8IXB3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUSC5Q8IXB3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUSC5Q8IXB3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUSC5Q8IXB3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUSC5Q8IXB3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUSC5Q8IXB3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TUSC5Q8IXB3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUSC5Q8IXB3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUSC5Q8IXB3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUSC5Q8IXB3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUSC5Q8IXB3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUSC5Q8IXB3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUSC5Q8IXB3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUSC5Q8IXB3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUSC5Q8IXB3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUSC5Q8IXB3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUSC5Q8IXB3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUSC5Q8IXB3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUSC5Q8IXB3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUSC5Q8IXB3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUSC5Q8IXB3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUSC5Q8IXB3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUSC5Q8IXB3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUSC5Q8IXB3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUSC5Q8IXB3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUSC5Q8IXB3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUSC5Q8IXB3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUSC5Q8IXB3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUSC5Q8IXB3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUSC5Q8IXB3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUSC5Q8IXB3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TUSC5Q8IXB3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUSC5Q8IXB3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUSC5Q8IXB3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUSC5Q8IXB3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUSC5Q8IXB3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUSC5Q8IXB3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUSC5Q8IXB3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUSC5Q8IXB3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUSC5Q8IXB3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUSC5Q8IXB3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUSC5Q8IXB3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUSC5Q8IXB3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUSC5Q8IXB3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUSC5Q8IXB3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUSC5Q8IXB3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUSC5Q8IXB3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUSC5Q8IXB3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms