Protein–RNA interactions for Protein: Q86XE0

SNX32, Sorting nexin-32, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX32Q86XE0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX32Q86XE0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNX32Q86XE0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX32Q86XE0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX32Q86XE0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX32Q86XE0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX32Q86XE0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX32Q86XE0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX32Q86XE0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX32Q86XE0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX32Q86XE0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX32Q86XE0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX32Q86XE0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX32Q86XE0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX32Q86XE0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX32Q86XE0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX32Q86XE0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX32Q86XE0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX32Q86XE0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX32Q86XE0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX32Q86XE0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX32Q86XE0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX32Q86XE0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX32Q86XE0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX32Q86XE0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX32Q86XE0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX32Q86XE0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX32Q86XE0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX32Q86XE0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX32Q86XE0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX32Q86XE0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX32Q86XE0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX32Q86XE0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX32Q86XE0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX32Q86XE0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX32Q86XE0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX32Q86XE0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX32Q86XE0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX32Q86XE0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX32Q86XE0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX32Q86XE0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX32Q86XE0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX32Q86XE0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX32Q86XE0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX32Q86XE0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX32Q86XE0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX32Q86XE0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX32Q86XE0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX32Q86XE0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX32Q86XE0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX32Q86XE0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX32Q86XE0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX32Q86XE0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX32Q86XE0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX32Q86XE0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX32Q86XE0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX32Q86XE0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX32Q86XE0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX32Q86XE0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX32Q86XE0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX32Q86XE0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX32Q86XE0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX32Q86XE0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX32Q86XE0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX32Q86XE0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX32Q86XE0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX32Q86XE0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX32Q86XE0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX32Q86XE0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX32Q86XE0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX32Q86XE0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX32Q86XE0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX32Q86XE0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX32Q86XE0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX32Q86XE0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX32Q86XE0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX32Q86XE0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX32Q86XE0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX32Q86XE0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX32Q86XE0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX32Q86XE0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX32Q86XE0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX32Q86XE0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX32Q86XE0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX32Q86XE0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX32Q86XE0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX32Q86XE0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX32Q86XE0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX32Q86XE0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX32Q86XE0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX32Q86XE0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX32Q86XE0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX32Q86XE0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX32Q86XE0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX32Q86XE0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX32Q86XE0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX32Q86XE0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX32Q86XE0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX32Q86XE0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX32Q86XE0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms